عنوان

بررسی بیان RNA غیرکد‌کننده‌ی بلند LOC100506036 و ژن‌های SMPD1 و ZEB1 در سلول‌های تک هسته‌ای خون محیطی بیماران مبتلا به مالتیپل اسکلروزیس

شماره

پ۲۵۴۵۵

زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن

per

عنوان اصلي

بررسی بیان RNA غیرکد‌کننده‌ی بلند LOC100506036 و ژن‌های SMPD1 و ZEB1 در سلول‌های تک هسته‌ای خون محیطی بیماران مبتلا به مالتیپل اسکلروزیس

نام نخستين پديدآور

مهسا یاز

نام ناشر، پخش کننده و غيره

علوم طبیعی

تاریخ نشرو بخش و غیره

۱۳۹۹

نام خاص و کميت اثر

۱۰۰ص.

مواد همراه اثر

سی دی

جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن

کارشناسی ارشد

نظم درجات

علوم جانوری ژنتیک

زمان اعطا مدرک

۱۳۹۹/۱۱/۲۹

متن يادداشت

بیماری مالتیپل اسکلروزیس(MS) ، یک بیماری خودایمنی، مرتبط با التهاب مزمن سیستم اعصاب مرکزی(CNS) است. درMS ، جنبه‌های مختلف سیستم ایمنی فاقد عملکرد صحیح می‌شود؛ به طور مثال، تعداد و فعالیت تهاجمی سلول‌های Th1 و Th17 افزایش یافته و تنظیم سلول‌های Th2 و Treg (که در تنظیم‌ و سرکوب سلول‌های ایمنی نقش دارند) به‌هم می‌خورد. نتیجه‌ی این عدم عملکرد صحیح، حمله سلول‌های ایمنی به آنتی‌ژن‌های میلین خودی، اطراف رشته‌های عصبی در CNS می‌باشد. با‌توجه به نقش‌های غلاف میلین از جمله عایق‌بندی آکسون‌ها و افزایش سرعت انتشار تکانه‌های الکتریکی در طول سلول‌های عصبی، در صورت آسیب‌دیدگی، انتشار این تکانه‌ها کند یا متوقف شده و نقایص عصبی و التهاب در CNS دیده می‌شود. عوامل ژنتیکی و محیطی بسیاری در ابتلا به این بیماری تاثیر گذارند. موضوعی که همیشه در مداخلات ژنتیکی حائز اهمیت بوده، تنظیم بیان ژن‌ها می‌باشد. مطالعات زیادی در این زمینه صورت گرفته که نتیجه‌ی آن معرفی مولکول‌های تنظیم‌کننده‌ی‌ بیان جدید، از جمله RNA های غیر‌کد‌کننده‌ی بلند (lncRNA) در اوایل قرن 21 می‌باشد. در پستانداران بخش عمده‌ی فراورده‌های بیان‌ژن را توالی‌های ریبونکلئوتیدی که غیر‌کد‌کننده‌ی پروتئین هستند، تشکیل می‌دهند؛lncRNA ها جزء این گروه می‌باشند. این‌مولکول‌ها طولی بیش از 200 نوکلئوتید دارند و عملکردشان وابسته به ساختار مولکولی منحصر‌به فردشان می‌باشد؛ و نقش مهمی در تنظیم بیان ژن‌ها در سطوح متفاوت اپی‌ژنتیکی، رونویسی و پس‌از‌ رونویسی ایفا می‌کنند. هدف از این پژوهش، بررسی تغییرات بیان ژن‌های SMPD1، LOC100506036 وZEB1 در گروه new case (بیمار، بدون دریافت دارو) نسبت به گروه کنترل، و در گروه هایی که یکی از داروهای اینترفرون بتا 1-آلفا، فینگولیمود، گلاتیرامر استات یا دی‌متیل فومارات را دریافت کرده‌‌اند، نسبت به گروه new case می‌باشد. علت انتخاب این ژن‌ها برای بررسی در بیماری,MS تاثیر‌گذاری هرکدام از این‌ها در تولید، تکثیر و تمایز سلول‌های T CD4⁺ به سلول‌هایTh می‌باشد؛ و به‌دلیل اینکه اختلال در موارد ذکر شده در پاتوژنز بیماری MS بسیار حائز اهمیت است؛ بررسی تغییرات احتمالی در بیان این ژن‌ها در افراد مبتلا به ,MS هدف این پژوهش قرار گرفت.مواد و روش ها: در این پژوهش نمونه‌گیری از خون 76 بیمار مبتلا به MS و 43 فرد سالم صورت گرفت. PBMC از هر‌کدام از نمونه‌ها توسط فایکول جداسازی شد، سپس RNA از نمونه‌ها توسط ترایزول استخراج شد؛ در ادامه سنتز cDNA و سپس Real Time PCR انجام شد و در نهایت آنالیز آماری داده‌ها انجام گرفت.نتایج : افزایش بیان معنی‌داری در ژن‎های LOC100506036، SMPD1 و ZEB1 در افراد بیمار بدون دریافت دارو در مقایسه با افراد سالم مشاهده شد و بیان ژنZEB1 در گروه بیمار دریافت کننده‌ی داروی اینترفرون بتا در مقایسه با گروه بیمار بدون دریافت دارو، با کاهش معنی‌داری همراه بود.بحث و نتیجه‌گیری: بر اساس تحلیل‌های صورت گرفته، ژن‌های LOC100506036،SMPD1 وZEB1 دارای پتانسیل تشخیصی بالایی در بیماران مبتلا بهRRMS می‌باشند و کاهش بیان ژن ZEB1 توسط داروی اینترفرون بتا ممکن است یکی از مکانیسم‌های درمانی این دارو در بیماری ام اس باشد. بنابراین این مطالعه می‌تواند در شناخت قسمتی از مکانیسم مولکولی نحوه‌ی ایجاد MS موثر باشد؛ البته برای شناخت ارتباط سلول‌های ایمنی با بیان این ژن‌ها در بیماری MS، نیاز به مطالعات عملکردی بیشتری می‌باشد.

متن يادداشت

Abstract:Multiple sclerosis (MS) is an autoimmune disease associated with chronic inflammation of the central nervous system (CNS). In MS, various aspects of the immune system become dysfunctional; For example, the number and aggressive activity of Th1 and Th17 cells are increased and the regulation of Th2 and Treg cells (which are involved in the regulation and suppression of immune cells) is disrupted. As a result of this dysfunction, immune cells mistakenly attacks myelin self-antigens around nerve fibers in the CNS. Due to the functions of myelin sheat, including the isolation of axons and the acceleration of electrical impulses propagating along nerve cells, in the event of injury, the propagation of these impulses is slowed or stopped and neurological defects and inflammation are seen in the CNS. Many genetics and environmental factors play a role in the development of this disease. One issue that has always been important in genetic interventions is the regulation of gene expression. Numerous studies have been conducted in this field, resulting in the introduction of new expression regulatory molecules, including long non-coding RNAs (lncRNAs) in the early 21st century. In mammals, the majority of expression products are ribonucleotide sequences that do not encode proteins; lncRNAs belong to this group. These molecules are more than 200 nucleotides in length and their function depends on their unique molecular structure; And play an important role in regulating gene expression at different levels of epigenetics, transcription, and post-transcription. The aim of this study was to evaluate the changes in the expression of SMPD1, LOC100506036 and ZEB1 genes in the non-treaed RRMS patients compared to the control group, and in the Interferon beta-1a (IFNβ-1α) or fingolimod, or glatiramer acetate (GA), or dimethyl fumarate (DMF)- treated RRMS patients, compared to the non-treaed RRMS patients. The reason for selecting these genes for screening in patients with MS, is the effect of each of these genes on the production, proliferation and differentiation of T CD4⁺ cells into Th cells. Disorder in the mentioned cases is very important in the pathogenesis of MS, so the aim of this study was to investigate possible changes in the expression of these genes in patients with MS.Materials and Methods: In this study, blood samples were taken from 76 patients with MS and 43 healthy individuals. PBMC was isolated from each sample by Ficoll, then RNA was extracted from the samples by trizol; The synthesis of cDNA and then Real Time was performed. Finally, statistical analysis of the data were performed.

عنوان گونه گون

Evaluation of expression of long non-coding RNA, LOC100506036 and SMPD1 and ZEB1 genes in peripheral blood mononuclear cells in patients with multiple sclerosis

عنصر شناسه اي

‏‏ یاز،

ساير عناصر نام

‏‏ مهسا

کد نقش

تهيه کننده

عنصر شناسه اي

‏صفر‌علیزاده ،

عنصر شناسه اي

‏حسینپور‌فیضی،

عنصر شناسه اي

‏برادران،

ساير عناصر نام

‏‏ رضا

ساير عناصر نام

محمد علی

ساير عناصر نام

بهزاد

تاريخ

استاد راهنما

تاريخ

استاد راهنما

تاريخ

استاد مشاور

عنصر شناسه اي

تبریز