عنوان

انتقال‌پذیری و چندشکلی نشانگرهای ‮‭SSR‬ جو در گندم نان و دوروم

شماره

‭۱۴۲۳۰پ‬

زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن

per

عنوان اصلي

انتقال‌پذیری و چندشکلی نشانگرهای ‮‭SSR‬ جو در گندم نان و دوروم

نام نخستين پديدآور

/وحید حسین‌زاده

نام ناشر، پخش کننده و غيره

: کشاورزی

تاریخ نشرو بخش و غیره

، ‮‭۹۴‬

متن يادداشت

چاپی

جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن

کارشناسی ارشد

نظم درجات

بیوتکنولوژی کشاورزی

زمان اعطا مدرک

‮‭۱۳۹۴/۰۶/۲۵‬

کسي که مدرک را اعطا کرده

تبریز

متن يادداشت

به دلیل مزیت‌صهایی مانند چندشکلی بالا، امتیاز دهی هم‌صبارز، چندآللی بودن و توزیع در نواحی رمزکننده و غیر رمزکننده ژنوم نشانگرهای ‮‭SSR‬ ابزارهای قدرتمند در تعیین روابط ژنوتیپ‌ها و تنوع ژنتیکی هستند .ولی به علت هزینه‌صهای بالا و وقت‌صگیر بودن طراحی نشانگرهای مخصوص گونه، استفاده از نشانگرهای ‮‭SSR‬ یک گونه در گونه دیگر می‌صتواند سودمند باشد .دراین مطالعه، انتقال‌صپذیری و چندشکلی ‮‭۱۰۲‬ نشانگر ‮‭SSR‬ جو در ‮‭۴۱‬ ژنوتیپ گندم نان، دوروم و تریتیکاله بررسی شد .از این تعداد نشانگر، ‮‭۵۰‬ جفت آغازگر، انتقال‌صپذیری نشان دادند و ‮‭۴۰‬ جفت آغازگر با تولید ‮‭۱۱۸‬ آلل) با متوسط ‮‭۹۵/۲‬ آلل به ازای هر جایگاه (چندشکل بودند .میانگین محتوای اطلاعات چندشکلی ‮‭(PIC)‬ و تنوع ژنی برای این نشانگرها به ترتیب ‮‭۲۹/۰‬ و ‮‭۳۳/۰‬ برآورد شد .میانگین شاخص شانون و شاخص نی برای ژنوتیپ‌صهای مورد مطالعه به ترتیب برابر ‮‭۳۴/۰‬ و ‮‭۲۳/۰‬ بود .تجزیه خوشه‌صای با استفاده از الگوریتم ‮‭Minimum Evolution‬ و ضریب فاصله‮‭distance - P‬ژنوتیپ‌صها را در پنج گروه مجزا قرار داد .در تجزیه به بردارهای اصلی، سه بردار اصلی اول، ‮‭۶۹/۷۴‬ درصد تغییرات مولکولی کل را تبیین کرد .علاوه بر نشانگرهای ‮‭SSR‬ جو از ‮‭۱۴۳‬ نشانگر ‮‭SSR‬ گندم نیز برای بررسی تنوع ژنتیکی و گروه‌صبندی ارقام استفاده شد که ‮‭۶۰‬ نشانگر با تولید ‮‭۲۹۲‬ آلل) با میانگین ‮‭۸۶/۴‬ آلل به ازای هر مکان (چند شکلی نشان دادند .متوسط مقدار ‮‭PIC‬ و تنوع ژنی برای این نشانگرها به ترتیب ‮‭۵۷/۰‬ و ‮‭۶۱/۰‬ بود و متوسط شاخص شانون و شاخص نی به ترتیب ‮‭۵۹/۰‬ و ‮‭۳۳/۰‬ برآورد شد .تجزیه خوشه‌صای براساس الگوریتم ‮‭Minimum Evolution‬ و ضریب فاصله‮‭۲parametr - Kimura‬ژنوتیپ‌صها را به پنج گروه منتسب کرد .در تجزیه به بردارهای اصلی، سه بردار اصلی اول ‮‭۳۷/۷۱‬ درصد تغییرات مولکولی کل را تبیین کردند .در مجموع نشانگرهای ‮‭SSR‬ چندشکل گندم و جو ‮‭( ۱۰۰‬ نشانگر(، متوسط ‮‭PIC‬ و تنوع ژنی به ترتیب ‮‭۴۶/۰‬ و ‮‭۵/۰‬ به دست آمد .تجزیه خوشه‌صای با الگوریتم ‮‭Minimum Evolution‬ و ضریب فاصله‮‭distance - P‬برای مجموع نشانگرهای گندم و جو، ژنوتیپ‌صها را در چهار گروه قرار داد .در تجزیه به بردارهای اصلی، سه بردار اصلی اول ‮‭۷۸/۶۷‬ درصد تغییرات مولکولی کل را تبیین کردند .تجزیه واریانس مولکولی براساس ساختار ژنومی ژنوتیپ‌صهای مورد مطالعه و براساس داده‌صهای مولکولی نشان داد که تنوع درون گونه‌صها سهم بیشتری در تبیین واریانس مولکولی کل دارد

متن يادداشت

Abstract Due to advantages such as high polymorphism, codominanc nature, multiallelism and distribution on encoding and non-encoding regions, SSR markers are powerful tools for determination relationship of genotypes and genetic diversity. But because of time and cost involved in designing species specific primer, use of related species primers could be useful. In this study, transferability and polymorphism of 102 barley SSR markers in 41 bread and durum wheat and triticale genotypes was investigated. Out of this primers, 50 pair primers were transferabile and 40 pair primers with producing 118 allele (in average 2.95 allele per locus) were polymorphic. Polymorphism information content (PIC) and genetic diversity for these markers was estimated 29 and 33 , respectively. The average of Shannon and Nei indices for the studied genotypes were 34 and 23 , respectively. Cluster analysis using Minimum Evolution algorithm and P-distance coefficient, assigned the genotypes into five groups. In principal coordinates analysis, tree firs principal components (PCs) explained 74.69 of total molecular variation. In addition to barley SSR markers, 143 wheat SSR primer pair were also use for genetic diversity analysis grouping of genotypes and 60 markers producing 292 allele (average of 4.86 allele per locus) were polymorphic. The average PIC and gene diversity for these markers were 0.57 and 0.61 and the average of Shannon and Nie indices were estimated 0.59 and 0.33, respectively. Cluster analysis using Minimum Evolution algorithm and Kimura-2parametr coefficient, assigned the genotypes into five groups. In principal coordinates analysis, three first PCs, explained 71.37 of molecular variation. In total of wheat and barley polymorphic SSR markers (100 markers), average of PIC and gene diversity were 0.46 and 0.5, respectively. Cluster analysis using Minimum Evolution algorithm and P-distance coefficient using wheat and barley markers, classified genotypes in to four groups. In principal coordinates analysis, three first PCs explained 67.78 of total molecular variations. Analysis of molecular variance based on genome structure of the genotypes using molecular dada revealed higher contribution of withing species variation in determination of total molecular variance

مستند نام اشخاص تاييد نشده

حسین‌زاده، وحید

مستند نام اشخاص تاييد نشده

محمدی، سید ابوالقاسم، استاد راهنما

مستند نام اشخاص تاييد نشده

نوروزی، مجید، استاد راهنما

مستند نام اشخاص تاييد نشده

صادق‌زاده، بهزاد، استاد مشاور

يادداشت عمومي

سیاه و سفید

وضعیت فهرست نویسی

نمایه‌سازی قبلی