عنوان

تاپینگ مولکولی جدایه های بالینی کاندیدا البیکنس بر اساس روش ‮‭rep-PCR‬ و تکثیر ژن ‮‭۲۵SrDNA‬

شماره

‭۱۳۸۱۲پ‬

زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن

per

عنوان اصلي

تاپینگ مولکولی جدایه های بالینی کاندیدا البیکنس بر اساس روش ‮‭rep-PCR‬ و تکثیر ژن ‮‭۲۵SrDNA‬

نام نخستين پديدآور

/ارمینا دالوند

نام ناشر، پخش کننده و غيره

: دامپزشکی

تاریخ نشرو بخش و غیره

، ‮‭۹۴‬

متن يادداشت

چاپی

جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن

دکتری حرفه ای

نظم درجات

دامپزشکی

زمان اعطا مدرک

‮‭۱۳۹۴/۰۶/۱۸‬

کسي که مدرک را اعطا کرده

تبریز

متن يادداشت

در حیوانات گونه‌های کاندیدا از عوامل ایجاد بیماری‌های مخاطی و جلدی و در پاره‌ای موارد عفونت‌های سیستمیک هستند .همچنین کاندیدا آلبیکنس در بین گونه‌های کاندیدا شایع‌ترین گونه شناخته‌شده است .تاکنون از دیدگاه اپیدمیولوژی مولکولی مطالعات محدودی بر روی استرین های حیوانی انجام‌شده است و این در حالی است که تایپینگ مولکولی برای تعیین ساختار جمعیتی و اخذ تصمیمات صحیح در پیشگیری و درمان عفونت‌ها ضروری است .تعیین نوع ‮‭۲۵s rDNA‬ از روش‌های مفید در تایپینگ و نیز تشخیص استرین های کاندیدا آلبیکنس بوده است .از طرفی توالی های نوکلئوتیدی تکراری ‮‭(RPS)‬ مبنایی برای تعیین تنوع ژنتیکی در کاندیدا آلبیکنس می‌باشند و بر این اساس کاندیدا آلبیکنس را گروه‌بندی می‌کنند .همچنین برخی از پرایمرهای مورداستفاده قادر به تفکیک بین گونه کاندیدا آلبیکنس از سایر گونه‌های ازنظر ژنتیکی نزدیک به کاندیدا آلبیکنس نیز می‌باشد .تکثیر ژن ‮‭۲۵s rDNA‬ به‌طور رایجی برای تایپینگ کاندیدا آلبیکنس مورداستفاده است و بر این اساس به ‮‭۵‬ گروه اصلی تقسیم می‌شود

متن يادداشت

Candida species are the cause of mucosal and cutaneous diseases in animals and in some cases cause systemic infections. Candida albicans is the most common Candida species. From the perspective of molecular epidemiology, limited studies have so far been undertaken on animal strains, this is where determination of genotypes is an essential factor in population structure and correct decision making in prevention and treatment of infections. PCR targeting 25S rDNA or ABC typing is useful in the diagnosis and typing of Candida albicans strains. On the other hand, the repetitive sequences (RPS) are the basis for determining genetic variation in albicans and its classification. Some of the primers used also able to distinguish between Candida albicans from other Candida species that is genetically close. Amplification of 25S rDNA gene has been commonly used in typing of Candida albicans and accordingly divided into five main groups. Twenty-Seven samples used in this study have been isolated from animals. Once the primary phenotypic diagnosis is done, then the strains determination was further confirmed by PCR-RFLP method. DNA extraction was performed by chemical-physical method followed by electrophoresis to ensure the quality of the extraction. At the beginning of ITS region of fungal rDNA were amplified by PCR using ITS4-ITS1 primers. Enzyme digestion pattern of PCR products was evaluated by MSP1 restriction enzyme.Molecular typing methods were then used, and accordingly amplification of specific area 25S rDNA or ABC typing, with CA-INT primers, was done. This was to obtain the actual measure of the changeable and transposable part of intron 25S rDNA. In this study, genotype A (40.7 ), was the most common genotype was obtained, followed by genotype E, B and C 22.5 , 18.5 , 18.50 respectively. Isolation of type E is remarkable result achieved in this study. As this genotype is a new group in the grouping of Candida albicans using 25S rDNA typing. Employing Rep-PCR with the aid of primers AS-I where the viscera of ALT being targeted, seventeen unique genotypes obtained from pattern of twenty-seven examined strains. These patterns were identified based on visualization of bands made up of electrophoresis of PCR products. AS1 and AS2 genotypes were more common than other genotypes and other genotypes had similar frequency. The results of ABC typing with the results of Rep-PCR method was adapted and aligned in order to achieve more detailed genotypic pattern.By the end, twenty-two genotypes were obtained from the twenty-seven strains studied, indicating that this method has significant resolution of the various aspects of intraspecific differences are very important in research.Isolation of twenty-two different genotypes achieved in this study is significant in that there have been little findings in animals before. The results of this study showed the high genetic diversity of the candida population isolated from animal and similar studies in human populations are heterogeneous in candida isolated from animals

مستند نام اشخاص تاييد نشده

دالوند، ارمینا

مستند نام اشخاص تاييد نشده

جعفری جوزانی، رضی، استاد راهنما

مستند نام اشخاص تاييد نشده

کتیرائی، فرزاد، استاد راهنما

يادداشت عمومي

سیاه و سفید

وضعیت فهرست نویسی

نمایه‌سازی قبلی