ارزیابی سطح پلاسمایی lncRNA ها در بیماران مبتلا به آلزایمر دیررس
نام نخستين پديدآور
مجید خدائی شهرک
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
علوم طبیعی
تاریخ نشرو بخش و غیره
1401
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
۱۰۴ص.
مواد همراه اثر
سی دی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
کارشناسی ارشد
نظم درجات
ژنتیک
زمان اعطا مدرک
۱۴۰۱۸۰۴/۱۲
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
مقدمه: بیماری آلزایمر یک اختلال تخریب کننده و پیشرونده ی عصبی است که به تدریج حافظه ، قدرت یادگیری و فعالیت روزانه بیماران را تحت تاثیر قرار می دهد. آلزایمر یکی از علل اصلی مرگ و میر در افراد مسن در سراسر جهان است. اخیرا مشخص شده که پلاسمای انسانی حاوی مقدار زیادی lncRNAs پایداراست و الگوی بیانی منحصر بفرد lncRNAs های پلاسما، تحت شرایط خاص یک بیماری، این امکان را فراهم کرده است که بعنوان بیو مارکر مناسب و غیر تهاجمی برای تشخیص تعدادی بیماری توصیه شوند. پژوهش حاضر با هدف غربالگری و مقایسه سطح پلاسمایی lncRNAs های دخیل در بیماری آلزایمر دیررس در بیماران آلزایمری و افراد سالم انجام میشود.روش¬ها: RNAکل از نمونههای پلاسما جدا شد. سطوح بیان 90 lncRNA با استفاده از آرایه های PCR حاوی 90 LncRNA و با qRT-PCR مورد سنجش قرار گرفت. سپس با تجزیه و تحلیل نتایج اولیه پروفایلینگ، ژن های BC200، NDM29، NEAT1، FAS-AS1 و GAS5-AS1 برای مطالعات بیشتر در همه نمونهها انتخاب شدند. در مرحله بعد، پتانسیل بیومارکری هرکدام این فاکتورها توسط ROC Curve مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. همچنین، پایگاههای اطلاعاتی RNA seq به صورت in silico غربالگری شده وncRNA های با بیشترین اختلاف بیان در افراد آلزایمری و سالم شناسایی شدند.یافته¬ها: نتایج آنالیز داده ها نشان داد که میزان بیان NEAT1(p=0.04), BC200(p=0.02) در پلاسمای بیماران آلزایمری نسبت به افراد غیربیمار به طرز معنیداری بالا می باشند. همچنیناین مطالعه نشان داد که مقدار BC200 در مراحل شروع بیماری افزایش مییابد. تجزیه و تحلیل منحنی ROC نشان داد که NEAT1 با 72٪ حساسیت و 84٪ ویژگی و BC200 با 60٪ حساسیت و 91٪ ویژگی به طور مناسب بیماران AD را از گروه کنترل سالم تشخیص میدهد. در روش بیو انفورماتیک LncRNA های تغییر یافته در دیتای RNAseq در مجموع 46 ژن بودند که از این بین 33 ژن افزایش بیان و 13 ژن کاهش بیان را نشان دادند.نتیجه گیری: این مطالعه نشان میدهد که سطوح پلاسمایی lncRNA NEAT1 و BC200 ممکن است بهعنوان نشانگرهای زیستی مبتنی بر خون برای توسعه و پیشرفت AD در نظر گرفته شوند و lncRNA های جدیدی را ارائه میدهد که ممکن است به عنوان نشانگر زیستی امیدوار کننده برای تشخیص زودهنگام AD مورد بهره برداری قرار گیرند.
متن يادداشت
Alzheimer's is a progressiv neurodegenerative disorder, which graduallyaffects memory, the learning ability and performance of daily activities. Alzheimer isone of the main causes of death in old people worldwide. It was recently revealed thathuman plasma carries lncRNAs which are stable in and their disease-specific profilehave made them valuable biomarkers for some disease. This project aimed atinvestigating the plasma levels of lncRNAs involved in AD pathogenesis to evaluatethem as plasma-based AD biomarkers.Methods: Total RNA was isolated from plasma samples. The expression levels of 90lncRNAs were estimated using the PCR arrays containing 90 LncRNAs and by realtime qRT-PCR.Then, by analyzing the preliminary results of profiling, the genesBC200, NDM29, NEAT1, FAS-AS1 and GAS5-AS1 were selected for further studiesin all samples. In the next step, biomarker potency of each factor was analyzed by ROCCurve analysis. Also, seq RNA databases were screened in silico and ncRNAs with thehighest expression differences were identified in Alzheimer's and healthy individuals.
عنوانهای گونه گون دیگر
عنوان گونه گون
Evaluation of the plasma levels of lncRNAs in patients with late onset Alzheimer’s disease
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )