عنوان

ارزیابی ژنومی صفات بیماری درگاوهای شیری با در نظر گرفتن اثرات متقابل ژنوتیپ و محیط

شماره

پ۲۶۷۰۱

زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن

per

عنوان اصلي

ارزیابی ژنومی صفات بیماری درگاوهای شیری با در نظر گرفتن اثرات متقابل ژنوتیپ و محیط

نام نخستين پديدآور

بهاره اعتقادی

نام ناشر، پخش کننده و غيره

مهندسی کشاورزی

تاریخ نشرو بخش و غیره

۱۴۰۰

نام خاص و کميت اثر

۱۱۴ص.

مواد همراه اثر

سی دی

نظم درجات

کشاورزی گروه علوم دامی

زمان اعطا مدرک

۱۴۰۰/۱۱/

متن يادداشت

اثر متقابل ژنوتیپ و محیط (G × E) یکی از عوامل مهم و تأثیرگذار در صحت پیش¬بینی¬های ژنومی می¬باشد. هدف اصلی از اصلاح نژاد گاوهای شیری، افزایش تولید شیر و ترکیبات آن است و این افزایش تولید موجب افزایش حساسیت دام به برخی بیماری¬ها نظیر ورم پستان می¬شود. هدف از این تحقیق، ارزیابی ژنومی گاوهای شیری با در نظر گرفتن اثرات متقابل G × E برای صفات بیماری می¬باشد. در تحقیق حاضر، این اثر در دو بخش مورد بررسی قرارگرفت. در بخش اول، از مدل¬های تک صفتی و چند صفتی با در نظر گرفتن سناریوهای مختلف برای بررسی صحت پیش¬بینی ژنومی و تشخیص وجود اثر متقابل G × E استفاده شد. داده¬های ژنومی از طریق نرم¬افزار QMSim برای صفت بیماری با سطوح مختلف LD (پایین و بالا)، تعداد نشانگر ثایت (K50)، QTL های مختلف (60 و 300) و درصد متفاوت از شیوع بیماری در جمعیت (10% و 30%) شبیه-سازی شدند. سپس، شبیه¬سازی برای ایجاد همبستگی ژنتیکی بین صفات در چهار محیط مختلف با وراثت¬پذیری¬های مختلف صورت گرفت. نتایج نشان داد که صحت پیش¬بینی ژنومی به طور معنی¬داری با افزایش سطح LD، وراثت¬پذیری، شیوع بیماری و همبستگی ژنتیکی بین صفات افزایش یافت (P<0.05). استفاده از مدل¬های چند صفتی، صحت ارزش¬های اصلاحی ژنومی را افزایش داد. نتایج حاکی از آن بود که سطح LD، میزان شیوع بیماری، تعداد حیوانات موجود در جمعیت مرجع و همبستگی ژنتیکی بین محیط¬های مختلف در صورت وجود اثر متقابل G × E، نقش مهمی را ایفا می¬کنند. بنابراین با توجه به نتایج بدست آمده می¬توان گفت که صحت پیش¬بینی با بررسی اثر متقابل ژنوتیپ و محیط بیشتر شده و فهم بهتری از تنوع ژنتیکی صفات کمّی حاصل می¬گردد. در بخش دوم تحقیق، رکوردهای مربوط به بیماری ورم¬پستان گاوهای هلشتاین کشور آلمان از بانک اطلاعاتی مرکز اصلاح نژاد کشور آلمان استخراج گردید و با استفاده از اطلاعات ژنومی آنها، وجود اثر متقابل ژنوتیپ و شکم زایش (G × P) برای صفت بیماری ورم¬پستان مورد بررسی قرار گرفت. از رکوردهای شکم‌زایش اول، دوم و سوم برای صفت بیماری ورم پستان (سالم و بیمار) در دامنه¬ سنی 20 تا 73 ماهگی در زمان زایش استفاده شد. با انجام کنترل کیفی داده¬ ژنومی، جایگاه¬های ژنی با فراوانی آلل جزئی کمتر از 5 درصد و نرخ خوانش کمتر از 90 درصد حذف شدند. آنالیز ژنتیکی با برنامه¬ THRGIBBS3F90 و از طریق نمونه¬گیری گیبس انجام شد. به طور کلی، مقدار همبستگی-های ¬¬ژنتیکی برآورد شده برای ورم¬پستان در شکم¬های زایش مختلف، پایین¬تر از 8/0 بود. نتایج حاصل نشان داد که با نظر گرفتن اثر متقابل G × P همراه با اطلاعات ژنومی در مدل، صحت پیش¬بینی نسبت به مدل صرفا با اطلاعات شجره¬ای افزایش می¬یابد و رتبه¬بندی گاوهای شیرده در شکم¬های زایش مختلف تغییر می¬کند. بنابراین شرایطی را فراهم می¬سازد تا بتوان ژنوتیپ¬های با شایستگی بالا را برای شکم¬های زایش مختلف انتخاب نمود. در نتیجه لحاظ نمودن اثر متقابل G × P می¬تواند راه حل مناسب و کاربردی جهت بهبود گزینش ژنومی باشد و بهبود قابل توجه¬ای در برنامه¬های اصلاح نژاد ایجاد نماید

عنوان گونه گون

Genomic evaluation of disease traits in dairy cattle by considering genotype × environment interactions

عنصر شناسه اي

‏اعتقادی،

ساير عناصر نام

‏‏ بهاره

کد نقش

تهيه کننده

عنصر شناسه اي

‏علیجانی،

عنصر شناسه اي

‏بهلولی،

عنصر شناسه اي

‏کؤنیگ،

ساير عناصر نام

‏سید عباس رأفت

ساير عناصر نام

‏صادق

ساير عناصر نام

‏مهدی

ساير عناصر نام

سون

تاريخ

استاد راهنما

تاريخ

استاد راهنما

تاريخ

استاد مشاور

تاريخ

استاد مشاور

عنصر شناسه اي

‏تبریز