بررسی نقش تغییرات RamR در کاهش حساسیت به تایگی سایکلین در باکتری Klebsiella pneumoniae
نام نخستين پديدآور
محدثه مقیمی
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
علوم طبیعی
تاریخ نشرو بخش و غیره
۱۴۰۰
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
۱۰۸ص.
مواد همراه اثر
سی دی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
کارشناسی ارشد
نظم درجات
میکروبیولوژی گرایش: میکروب های بیماری زا
زمان اعطا مدرک
۱۴۰۰/۰۳/۲۶
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
چکیده: آنتی بیوتیک تایگی سایکلین یکی از آخرین گزینه¬های درمانی برای مبارزه با عفونت¬های ناشی از باکتری¬های گرم منفی مقاوم به چند دارو، به ویژه Klebsiella pneumoniae است. اگرچه مقاومت به تایگی سایکلین به ندرت اتفاق می¬افتد ولیکن مقاومت به آن در Klebsiella pneumoniae گزارش شده است. در این مطالعه مکانیسم¬های مقاومت به آنتی بیوتیک تایگی سایکلین در 18 جدایه¬ی غیرحساس Klebsiella pneumoniae شامل 5 جدایه انسانی، 7 جدایه حیوانی و 6 جدایه به دست آمده با روش القا در آزمایشگاه بررسی شدند. ارتباط ژنتیکی جدایه¬های مقاوم به تایگی سایکلین با روش Multilocus sequence typing تعیین شد. توالی نوکلئوتیدی ژن¬های ramR،acrR ،rpsJ ،tetA و mgrB (برای بررسی مقاومت به کولیستین) تعیین شد. حضور ژن¬های پلازمیدی tetX، tetX1 و کارباپنمازهای مختلف در جدایه¬های مورد مطالعه به روش PCR بررسی شد. حساسیت جدایه¬ها به آنتی بیوتیک¬های مختلف با روش¬های دیسک دیفیوژن و براث ماکرو دایلوشن مورد بررسی قرار گرفت. سطح رونویسی ژن acrB با روش RT-qPCR ارزیابی شد. 12 جدایه¬ی غیرحساس به تایگی سایکلین به 10 سکانس تایپ مختلف شامل، ( 2=n) ST37، ST11، ST45، ST15، ST1326 در جدایه¬های حیوانی، ( 2=n ) ST147 در جدایه¬های حیوانی و انسانی، ST16، ST377، ST893، ST2935 در جدایه-های انسانی، تعلق یافتند. مقاومت همزمان به تایگی سایکلین و کولیستین در % 57 از جدایه¬های حیوانی و %40 از جدایه¬های انسانی مشاهده شد. تمام جدایه¬های انسانی دارای ژن¬های کارباپنماز (48-blaOXA، 1-blaNDM یا 5-blaNDM) بودند. در هیچ یک از جدایه¬ها ژن¬های tetX/X1 مشاهده نشد. تقریبا در %88 جدایه¬های غیرحساس به تایگی سایکلین (16=n) تغییرات ژنتیکی در ramRو acrR شناسایی شد، که شامل جهش¬های بد معنی و بی معنی (A19V، L44Q، I141T، G180D، A28T، R114L، T119S، Y59stop، (Q122stop، جهش¬های درج شدگی ( موقعیت¬های 205+، 342+)، جهش¬ حذفی (در جایگاه 205+) یا حذف کامل لوکوس در ramR و جهش بد معنی R90G، جهش¬های فریم شیفت (جهش¬های حذفی در موقعیت¬های 58+ یا حذف یک گوانین در موقعیت 134-139) یا جهش حذفی (موقعیت 430+) در acrR بود. همه¬ی جدایه¬ها دارای RpsJ و TetA (در صورت وجود) وحشی بودند. افزایش بیان ژن acrB در تمام جدایه¬های غیر حساس به تایگی سایکلین شناسایی شد.در اکثر جدایه¬های مورد مطالعه ترکیبی از تغییرات RamR و AcrR در عدم حساسیت به تایگی سایکلین نقش داشتند. این مطالعه اولین گزارش از شناسایی Klebsiella pneumoniae مقاوم به تایگی سایکلین از حیوانات با کاربرد غذایی است.
متن يادداشت
Abstract: Tigecycline (TGC) is one of the last-resort therapeutic agents to combat multidrug-resistant Gram-negative bacteria (GNB) including Klebsiella pneumoniae. Although it happens rarely, resistance to tigecycline has been reported in Klebsiella pneumoniae. To study the mechanisms of tigecycline resistance among 18 TGC-nonsusceptible Klebsiella pneumoniae (TGC-NSKP) isolates obtained from human (n=5), food animals (n=7) and in vitro selection experiment (n=6).Isolates were genotyped by MLST. The ramR, acrR, rpsJ, tetA and mgrB (for colistin resistance) genes were sequenced. The presence of tetX, tetX1 and carbapenemase genes was examined by PCR. Susceptibility to different classes of antibiotics was evaluated by disc diffusion and broth macrodilution methods. The expression level of acrB was quantified by RT-qPCR assay.The 12 TGC-NSKP isolates (MICs=4-32mg/l) belonged to 10 distinct sequence types including ST37 (n=2), ST11, ST15, ST45, ST1326 (animal isolates), ST147 (n=2, human and animal isolates), ST16, ST377, ST893, ST2935 (human isolates). Co-resistance to TGC and colistin was identified among 57% and 40% of animal and human isolates respectively. All human TGC-NSKP isolates carried carbapenemse genes (blaOXA-48, blaNDM-1, blaNDM-5). The tetX/X1 genes were not detected in any isolates. About 88% of TGC-NSKP isolates (n=16) carried ramR or acrR alterations including missense/nonsense mutations (A19V, L44Q, I141T, G180D, A28T, R114L, T119S, Y59stop, Q122stop), insertions (positions +205, +342) or deletions (position +205) for the ramR, and R90G or frameshift mutations for AcrR. All isolates revealed wild-type RpsJ and TetA (if present). Increased expression of acrB gene was detected among all resistant isolates.A combination of RamR and AcrR alterations were involved in TGC non-susceptibility in the majority of studied isolates. To the best of our knowledge, this is the first identification of TGC-RKP from food animals.
عنوانهای گونه گون دیگر
عنوان گونه گون
eeessessing the role of RamR alterations in reduced susceptibility to tigecycline in Klebsiella pneumoniae
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )