شماره کتابشناسی ملی
شماره
۴۴۷۳پ
زبان اثر
زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن
per
عنوان و نام پديدآور
عنوان اصلي
انتقال پذیری نشانگرهای SSR گندم برای تعیین تنوع ژنتیکی و ساختار جوهای بومی ایران
نام نخستين پديدآور
/علی شوروزدی
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
تبریز : دانشگاه تبریز ، دانشکده کشاورزی، گروه اصلاح نباتات
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
۸۳ ص
یادداشتهای مربوط به نشر، بخش و غیره
متن يادداشت
چاپی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
کارشناسی ارشد
نظم درجات
به نژادی
زمان اعطا مدرک
۱۳۹۱/۰۶/۰۷
کسي که مدرک را اعطا کرده
تبریز : دانشگاه تبریز ، دانشکده کشاورزی، گروه اصلاح نباتات
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
نشانگرهای SSR به علت چند شکلی بالا، امتیازدهی همبارز، توزیع ژنومی فراوان، تکرارپذیری بالا، ابزارهای قوی برای مطالعات ژنتیکی و تکاملی می‌باشند .با توجه به اینکه طراحی آغازگرهای اختصاصی براساس توالی‌های احاطه کننده حفاظت شده جایگاه‌های ریزماهواره‌ها نیازمند صرف هزینه و زمان و امکانات آزمایشگاهی پیشرفته است، استفاده از آغازگرهای طراحی شده یک گونه در گونه‌صهای خویشاوند، برای غلبه بر این مشکل مد نظر قرار گرفته است .در مطالعه حاضر، انتقال‌پذیری و چندشکلی ۱۵۳ جفت آغازگر SSR گندم در ۱۴۴ توده بومی، رقم تجاری و لاین اصلاحی جو مورد بررسی قرار گرفت .از بین آغازگرهای بررسی شده، ۱۳۲ آغازگر ( (۸۶ در جو تکثیر نشان دادند و فقط شش جفت آغازگر چندشکل بودند .در مجموع ۲۵ آلل با متوسط ۵۷/۳ آلل به ازای هر جایگاه تولید شد .متوسط میزان اطلاعات چندشکلی (PIC) برای نشانگرهای چندشکل، ۴۶/۰ با دامنه ۳۷/۰ و ۶۲/۰ به‌ترتیب برای نشانگرهای BARC۶۶ و WMC۳۲۷ بدست آمد .تجزیه خوشه‌ای با استفاده از الگوریتم صJoining -Neighborو ضریب فاصله تکاملیdistance - Pبراساس داده‌صهای حاصل از این نشانگرها، ژنوتیپ‌صها را به چهار گروه منتسب کرد .علاوه بر این، ۶۳ جفت آغازگر SSR جو نیز برای بررسی تنوع ژنوتیپ‌صها استفاده گردید و ۴۵ جفت آغازگر چندشکل در مجموع ۲۲۵ آلل با دامنه ۲ تا ۱۴ و میانگین ۵ آلل به ازای هر جایگاه تکثیر کردند .میزان اطلاعات چندشکلی برای این نشانگرها بین ۰۵/۰ تا ۹۰/۰ با میانگین ۵۱/۰ متغیر بود .کمترین و بیشترین فراوانی آلل شایع مربوط به نشانگرهای EBMAC۰۷۸۸ (۱۳/۰) و GBM۱۴۱۱ (۹۷/۰) بود .تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که واریانس درون گروهی (۹۴ درصد (سهم بیشتری در تبیین واریانس مولکولی کل در مقایسه با واریانس بین گروهی داشت .حداکثر و حداقل شاخص‌های شانون و تنوع ژنی نی به توده‌های بومی ایران و مصر تعلق داشت .تجزیه خوشه‌ای با استفاده از الگوریتم صJoining -Neighborو ضریب فاصله اقلیدسی ژنوتیپ‌ها را به شش گروه منتسب کرد .این گروه‌بندی تا حدودی با مناطق جغرافیایی ژنوتیپ‌ها مطابقت داشت
متن يادداشت
SR markers due to high polymorphic, codominanac scoring, abundance genomic distribution and high reproducibility are powerful tools for evolutionary and genetic studies. Since development of primers based on flanking sequences of SSR loci is extremely expensive, time and labor consuming and required advanced laboratory equipments, use of primers developed for one species in the related species has been used to overcome these problems. In the present study, transferability and polymorphism of 153 wheat SSR primer pairs were assessed in 144 barley landraces, cultivars and advanced breeding lines. Among the analyzed primer pairs, 132 (86 ) showed amplification and only six were polymorphic. In total, 25 alleles with an average of 3.57 alleles per locus were generated. The average PIC for polymorphic markers was 0.46 with a minimum and maximum of 0.37 to 0.62, for BARC66 and WMC327 markers, respectively. Cluster analysis using Neighbor-joining algorithm and P-distance coefficients, assigned the genotypes into four groups. In addition, 63 barley SSR primer pairs were used to assess genetic diversity of the studied genotypes and 45 polymorphic primer pairs produced 225 alleles with the range of 2 to 14 and an average of 5 alleles per locus. The PIC ranged 0.05 to 0.89 with an average of 0.50. The lowest and highest frequency of common allele belonged to EBMAC0788 (0.13) and GBM1411 (0.97) markers, respectively. Analysis of molecular variance (AMOVA) revealed high within group variation (94 ) compared with between groups. Maximum and minimum Shannon's and Nei gene diversity indices were observed in Iranian and Egyptian landraces, respectively. Cluster analysis using Neighbor-Joining algorithm and Euclidean distance assigned the studied genotypes into four groups. This grouping was partly consistent with geographical origins of the genotypes.
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )
مستند نام اشخاص تاييد نشده
شوروزدی، علی
نام شخص - ( مسئولیت معنوی درجه دوم )
مستند نام اشخاص تاييد نشده
محمدی، ابوالقاسم، استاد راهنما
مستند نام اشخاص تاييد نشده
نوروزی، مجید، استاد راهنما
مستند نام اشخاص تاييد نشده
صادق زاده، مجید، استاد مشاور
دسترسی و محل الکترونیکی
يادداشت عمومي
سیاه و سفید
وضعیت فهرست نویسی
وضعیت فهرست نویسی
نمایه‌سازی قبلی
