بررسی شیوع ژن های عامل مقاومت به کوئینولون پلاسمیدی و موتاسیون های gyrA و parC در سویههای اشریشیاکلی مقاوم به کوئینولون جداشده از نمونههای انسانی و حیوانی
عنوان اصلي به زبان ديگر
Assessing the prevalence of plasmid mediated quinolone resistance genes and gyrA and parC mutations in quinolone resistant Escherichia coli isolated from animal and human sources
نام نخستين پديدآور
/سمیه میرزایی
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
: علوم طبیعی
تاریخ نشرو بخش و غیره
، ۱۳۹۹
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
۷۱ص
یادداشتهای مربوط به نشر، بخش و غیره
متن يادداشت
چاپی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
کارشناسی ارشد
نظم درجات
زیست شناسی گرایش میکروبیولوژی، میکروب های بیماری زا
زمان اعطا مدرک
۱۳۹۹/۰۶/۲۹
کسي که مدرک را اعطا کرده
تبریز
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
سیپروفلوکساسین یک آنتی بیوتیک از خانواده فلوروکوئینولونصها می باشد که برای درمان عفونتصهای ادراری و بیمارستانی ناشی از باکتری اشریشیاکلی به کار می رود .امروزه به دلیل گزارشات مبنی بر افزایش مقاومت نسبت به این آنتی بیوتیک بررسی دلایل مقاومت یک امر مهم می باشد .هدف از این مطالعه تعیین شیوع ژنصهای Plasmid Mediated Quinolone Resistance (PMQR) و جهشصهای ناحیه QRDR در ژنصهای gyrA و parC می باشد که منجر به مقاومت نسبت به کوئینولونصها می شوند .در این مطالعه ۱۵ جدایه مقاوم) ۱۰ جدایه حیوانی و ۵ جدایه انسانی (و ۴ جدایه حساس) انسانی (به سیپروفلوکساسین از کشتارگاه طیور و بیمارستانصهای آموزشی امام رضا) ع (و مدنی به دست آمدند .حساسیت جدایهصها به کلاسصهای مختلف آنتی بیوتیکی با روش انتشار از دیسک مورد بررسی قرار گرفت .حضور ژنصهایqnrA ،qnrB ، qnrC، qnrD،qnrS ، oqxAB،qepA ، qepB وaac(۶ لإcr -)Ibبا روش PCR بررسی و توالی نوکلئوتیدی ژنصهای gyrA و parC تعیین شد .براساس نتایج تست حساسیت ضد میکروبی تایگی سایکلین، آمیکاسین و ایمیصپنم موثرترین آنتی بیوتیکصها بر علیه باکتریصهای مورد مطالعه بودند .تمام جدایهصهای انسانی به نیتروفورانتوئین، فسفومایسین و کلرامفنیکل حساس بودند اما در جدایهصهای حیوانی به ترتیب مقاومت ۱۰، ۲۰ و ۹۰ به این آنتی بیوتیکصها رویت شد .مقاومت بالایی نسبت به کلرامفنیکل و تتراسایکلین در جدایهصهای حیوانی یافت شد که احتمالا می تواند به دلیل کاربرد وسیع این آنتی بیوتیکصها در مزرعه حیوانات باشد .۲ جدایه مولد ESBL بودند که هر دو به کوئینولونصها مقاومت نشان دادند .از میان ۱۹ باکتری مورد مطالعه) ۱۰ باکتری حیوانی و ۹ باکتری انسانی (۹ باکتری دارای ژنصهای PMQR بودند qnrS .شایع ترین ژن PMQR بود) فراوانی ۳۶/۸ از تعداد کل (و غالبا در جدایهصهای حیوانی مشاهده شد .همچنین ژنصهایaac(۶ لإcr -)Ibو qepA به ترتیب در ۲ و ۱ جدایه انسانی مشاهده شدند .ژنصهایqnrA ،qnrB ، qnrC، qnrD و oqxAB در هیچ کدام از جدایهصها رویت نشدند .آنالیز نواحی QRDR وجود جهش در ژنصهای gyrA و parC را نشان داد .تمام جدایهصهای مقاوم دارای جهش مضاعف gyrA در کدونصهای ۸۳ و۸۷ بودند .جایگزینی آمینواسیدی L۸۳S در تمام جدایهصهای مقاوم دیده شد اما جایگزینیصهایN ۸۷D،G ۸۷ DوY۸۷ Dبه ترتیب در ۱۲، ۲ و ۱ مورد از جدایهصها رویت شدند
متن يادداشت
Ciprofloxacin is an antibiotic from the fluoroquinolone family that is used to treat urinary tract and nosocomial infections caused by Escherichia coli. Nowadays, due to reports on increased resistance to this antibiotic, it is important to investigate the causes of resistance. The aim of this study was to determine the prevalence of Plasmid Mediated Quinolone Resistance (PMQR (genes and QRDR mutations in gyrA and parC genes that lead to resistance to quinolones. In this study, 15 ciprofloxacin resistant (10 animal and 5 human isolates) and 4 ciprofloxacin susceptible isolates (of human origin) were obtained from poultry slaughterhouse and Imam Reza (AS) and Madani training hospitals. The susceptibility of isolates to different classes of antibiotics was evaluated by disk diffusion method. The presence of qnrA, qnrB, qnrC, qnrD, qnrS and oqxAB, qepA, qepB genes and aac (6لإcr was analyzed by PCR and the nucleotide sequence of the gyrA and parC genes was determined. According to the antimicrobial susceptibility testing results tigecycline, amikacin and imipenem were the most effective agents against the studied bacteria. All human isolates were susceptibile to nitrofurantine, fosfomycin and chloramphenicol, but in animal isolates 10, 20 and 90 resistance to these antibiotics were seen. High resistance to chloramphenicol and tetracycline was found in animal isolates, possibly due to the widespread use of these antibiotics in animal farms. Two isolates produced ESBLs, both of witch were resistant to quinolones. Of the 19 bacteria studied (10 animal and 9 human bacteria), 9 carried PMQR genes. The qnrS was the most common PMQR gene (frequency = 36.8 of the total) predominating in animal isolates. The aac (6-) IbلإE84V substitutions being abserved in 14 isolates and 1 isolate, resepectively. GyrA and parC mutations were not observed in any of the susceptible strains. Finally, it can be concluded that high level resistance to ciprofloxacin in the studied strains occurred mainly due to gyrA and parC mutations. +cr and qepA genes were also observed in 2 and 1 isolates, respectively. The qnrA, qnrB, qnrC, qnrD and oqxAB genes were not detected in any of the isolates. Analysis of QRDR regions showed mutations in gyrA and parC genes with all resistant isolates carrying double gyrA mutation in codons 83 and 87. The S83L amino acid substitution was seen in all resistant strains but D87N, D87G and D87Y substitutions were seen in 12, 2 and 1 isolates, respectively. The parC alterations included single S80I and double S80I -) Ib
عنوان اصلی به زبان دیگر
عنوان اصلي به زبان ديگر
Assessing the prevalence of plasmid mediated quinolone resistance genes and gyrA and parC mutations in quinolone resistant Escherichia coli isolated from animal and human sources
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )