تاثیر شوری بر تغییرات متیلهشدن DNA در بخش هوایی ارقام جو
عنوان اصلي به زبان ديگر
Effect of salinity on DNA methylation changes in shoot of barley cultivars Sahara۳۷۷۱ and Clipper
نام نخستين پديدآور
/فهیمه گلکار
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
: کشاورزی
تاریخ نشرو بخش و غیره
، ۱۳۹۲
نام توليد کننده
، میرزائی
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
۱۱۹ص
یادداشتهای مربوط به نشر، بخش و غیره
متن يادداشت
چاپی - الکترونیکی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
کارشناسی ارشد
نظم درجات
بیوتکنولوژی کشاورزی
زمان اعطا مدرک
۱۳۹۲/۰۶/۱۹
کسي که مدرک را اعطا کرده
تبریز
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
متیلهصشدن DNA یکی از سازوکارصهای کنترل بیان ژن در مراحل مختلف رشد گیاهان و تحت تنشصهای محیطی است .در این مطالعه، اثر تنش شوری بر برخی خصوصیات فنوتیپی و تغییرات متیله شدن DNA در بخش هوایی ارقام جو) Sahara۳۷۷۱ به شوری مقاوم (و) Clipper حساس به شوری (تحت تیمار صفر و ۱۰۰ میلی مولار NaCl در سه مرحله ۲۴ ساعت، سه و پنج هفته بعد از اعمال شوری مورد ارزیابی قرار گرفت .آزمایش به صورت فاکتویل در قالب طرح بلوکصهای کامل تصادفی با چهار تکرار انجام شد .صفات مورد اندازه گیری شامل ارتفاع بوته، وزن تر و خشک بخش هوایی، تعداد برگ و پنجه و غلظت یونصهای سدیم و پتاسیم بودند .تجزیه واریانس و متعاقب آن مقایسه میانگینصها نشان داد که وزن تر بخش هوایی، تعداد برگ و پنجه، میزان یونص پتاسیم و نسبت پتاسیم به سدیم تحت شوری ۱۰۰ میلیصمولار بطور معنیصدار کاهش، ولی میزان یونص سدیم افزایش یافت .بین مراحل رشدی از نظر صفات ارتفاع بوته، وزن تر و خشک بخش هوایی، تعداد برگ و پنجه و میزان یونص سدیم تفاوت معنیصدار وجود داشت و با پیشرفت مراحل رشدی میانگین این صفات افزایش یافت .برای بررسی الگوی متیله شدن بخش هوایی ارقام تحت شرایط نرمال و تنش شوری از پنج آغازگر تصادفی با ترکیب دو آنزیم برشی ایزوشیزومر HpaII و MspI براساس تکنیکRA - CREDاستفاده گردید .در مجموع، ۳۰۴ نوار چند شکل با ۲۴۹ ترکیب الگوی متیله شدن براساس DNA ژنومی برش یافته با آنزیمصها و پنج آغازگر تصادفی تکثیر شد .آغازگرMT۱۵ ، حداکثر تعداد نوارصهای چند شکل و ترکیب الگوی متیلهصشدن را در ارقام، در دو شرایط ایجاد کرد و حداقل تعداد نوارص چند شکل و الگوی متیلهصشدن مربوط به آغازگر MT۱۷ بود .براساس آغازگرMT۳ ، نوارصهای۱۳۰۰ ،۱۱۰۰ ،۱۰۵۰ ، ۶۰۰ و ۴۹۰ در رقم Sahrara۳۷۷۱ و نوارصهای۲۰۰۰ ،۱۲۰۰ ،۱۱۵۰ ،۱۱۰۰ ،۴۵۰ ،۳۸۰ ، ۳۶۰ و ۳۴۰ جفت بازی در رقمClipper ، دارای الگوی متیله شدن متمایز در شرایط نرمال و شوری بودند .نوار های۱۳۰۰ ،۱۱۰۰ ، ۱۰۵۰ و ۴۵۰ جفت بازی نیز با همین آغازگر الگوی متیله شدن متمایز در دو رقم نشان دادند .با استفاده از آغازگرMT۲ ، نوارصهای۵۲۰ ، ۴۲۰ و ۲۵۰ جفت بازی در رقم Sahrara۳۷۷۱ و نوار ۱۲۰۰ جفت بازی در رقمClipper ، دارای الگوی متیله شدن متمایز در شرایط نرمال و شوری بودند و قطعه ۲۵۰ جفت بازی با الگوی متیله شدن متمایز در ارقام تکثیر شد .براساس آغازگرMT۸ ، رقم Sahara۳۷۷۱ برای نوارصهای۱۵۰۰ ،۱۲۰۰،۱۱۰۰ ، ۶۰۰ و ۵۲۰ جفت بازی و رقم Clipper برای نوارصهای۱۰۰۰ ، ۷۶۰ ،۷۰۰ ،۶۸۰ ، ۶۰۰ و ۵۵۰ جفت بازی الگوی متیله شدن متفاوت را در دو شرایط شوری داشتند .در شرایط نرمال و شوری با استفاده از آغازگرMT۱۵ ، نوارصهای۹۰۰ ،۶۷۰ ،۵۷۰ ،۲۷۰ ، ۲۵۰ و ۲۰۰ جفت بازی در رقم Sahara۳۷۷۱ و نوارصهای ۲۸۰ و ۲۷۰ جفت بازی در رقمClipper ، الگوی متمایز متیله شدن را نشان دادند .برای آغازگرMT۱۷ ، نوار های۱۱۰۰ ، ۶۷۰ و ۵۹۰ جفت بازی در Sahara۳۷۷۱ و نوارهای ۶۷۰ و ۶۱۰ جفت بازی در Clipper دارای الگوی متمایز بودند .تغییرات متیله صشدن تحت شرایط نرمال و تنش شوری در هر دو رقم Sahara۳۷۷۱ و Clipper مشابه بوده و هر دو رقم در شرایط نرمال جایگاه متیله نشده بیشتری داشتند .بیشترین میزان متیلهصشدن در Sahara۳۷۷۱ مشاهده شد و رقم Clipper دارای کمترین میزان متیلهصشدن در شرایط نرمال بود
متن يادداشت
DNA methylation is one of the gene expression controlling mechanisms in plants at different growth stages and under environmental stresses. In this study, effect of salinity stress on some phonotypical traits and DNA methylation changes on shoot of barley cultivars Sahara3771 (resistant) and Clipper (sensitive) was assessed under 100 mM NaCl at 24 hour, three and five weeks after salt stress treatment as well as normal conditions. The trail was conducted using factorial experiment based on randomized complete block design with four replications. The measured traits were plant height, wet and dry weight of shoot, number of leaves and tillers as well as Na+ and K+ concentration. Analysis of variance revealed that wet weight of shoot, number of leaves and tillers, K+ concentration and the K+/Na+ ratio significantly were reduced under 100 mM NaCl salinity, but the concentration of Na+ was increased. Significant differences were observed among growth stages for plant height, wet and dry weight of shoot, number of leaves and tillers as well as Na+ concentration and mean of the traits was increased with advanced of growth stages. Varieties shoot methylation pattern under normal and salinity stress conditions was assessed using five random primers in combination with two isoschizomers restriction enzymes HpaII and MspI based on CRED-RA technique. In total, 304 polymorphic bands with 249 different methylation patterns were amplified using five primer and genomic DNA restricted with two enzymes. The maximum and minimum of polymorphic bands and methylation patterns in two varieties under both conditions were amplified using MT15 and MT17 primers, respectively. Using MT3 primer, 1300, 1100, 1050, 600 and 490 bp bands in Sahara3771 and 2000, 1200, 1150, 1100, 450, 380, 360 and 340 bp bands in the Clipper showed differential DNA methylation under normal and salinity conditions. The 1300, 1100, 1050 and 450 bp band amplified using same primers could differentiate two varieties. Based on MT2 primer, 520, 420 and 250 bp bands in Sahara3771 and 1200 bp band in the Clipper had different methylation pattern under salinity and normal conditions and 250 bp with differential methylation pattern was amplified in the varieties. The 1500, 1200, 1100, 600 and 520 bp bands amplified using MT8 primer revealed differential DNA methylation pattern in Sahara3771 and 1000, 760, 700, 680, 600 and 550 bp bands in the Clipper under normal and salinity conditions. Under normal and salinity conditions, MT15 primer produced 900, 670, 570, 270, 250 and 200 bp bands in Sahara3771 and 280 and 270 bp bands in the Clipper with differential DNA methylation pattern. For MT17 primer, 1100, 670 and 590 bp bands in Sahara3771 and 670 and 610 bp bands in the Clipper showed different DNA methylation pattern. DNA methylation changes in Sahara3771 were similar to the Clipper under normal and salinity conditions and both varieties had more demethylated sites under normal condition. The maximum DNA methylation was observed in Sahara3771 and Clipper had minimum DNA methylation under normal condition
عنوان اصلی به زبان دیگر
عنوان اصلي به زبان ديگر
Effect of salinity on DNA methylation changes in shoot of barley cultivars Sahara۳۷۷۱ and Clipper
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )