بررسی شیوع و مکانیسم های مولکولی مقاومت به آنتی بیوتیک کولیستین در انتروباکتریاسه های جدا شده از نمونه های طیور شمال غرب ایران
عنوان اصلي به زبان ديگر
Assessing the prevalence and molecular mechanisms of colistin resistance in Enterobacteriaceae isolated from poultry samples in northwest of Iran
نام نخستين پديدآور
/زینب پیشنیان
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
: علوم طبیعی
تاریخ نشرو بخش و غیره
، ۱۳۹۷
نام توليد کننده
، میرزائی
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
۱۰۲ص
یادداشتهای مربوط به نشر، بخش و غیره
متن يادداشت
چاپی - الکترونیکی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
کارشناسی ارشد
نظم درجات
میکروبیولوژی
زمان اعطا مدرک
۱۳۹۷/۱۱/۱۶
کسي که مدرک را اعطا کرده
تبریز
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
ظهور انتروباکتریاسه های مقاوم به کولیستین از منابع انسانی و حیوانی یک نگرانی برای سلامت جامعه می باشد و چون این آنتی بیوتیک به عنوان آخرین گزینه درمانی برای عفونت های ایجاد شده بوسیله باکتری های گرم منفی مقاوم چند دارویی می -باشد .هدف ما در این تحقیق تعیین فروانی مقاومت به کولیستین در میان انتروباکتریاسه های جدا شده از ماکیان و تعیین مکانیسم های مولکولی مقاومت به کولیستین می باشد .در این پروژه ۹۴۴ نمونه سوآپ کلواک طیور جمع آوری و برای مقاومت به کولیستین غربالگری شدند .برای شناسایی مکانیسم های مولکولی عامل مقاومت، حضور ژن های پلاسمیدی۱- mcr،۲- mcr،mcr - ۳وmcr - ۴با روشPCR مورد بررسی قرار گرفتند .توالی نوکلئوتیدی ژن های ,mgrB, pmrA, pmrB, phoP, phoQ crrA و crrB تعیین شدند .ارتباط ژنتیکی جدایه های مقاوم به کولیستین بوسیله روش Multilocus sequence typing تعیین شد ۳ .جدایه مقاوم به کولیستین با روش القا در آزمایشگاه در حضور غلظت های افزایشی آنتی بیوتیک ایجاد شد .در مجموع از ۹۳۱ باکتری انتریک جدا شده از نمونه های طیور به دست آمده از ۱۳۱ مزرعه، ۹ باکتری مقاوم به کولیستین با سطح مقاومت بالا mg/l ۶۴ MICبدست آمد که همگی به عنوان کلبسیلا نومونیه شناسایی شدند .باکتری های بدست آمده از مزارع مختلف جدا شده و به ۷ سکانس تایپ مختلف شامل، ( ۲۲.۲ ) ۱۱ ST و (۲۲.۲ )۷۲۶ST با بیشترین فراوانی و ۵۲۵ ST ،۴۸۵ ST،۷۴ST ، ۳۷ST و یک سکانس تایپ جدید ۳۳۸۰ هر کدام با فراوانی ۱/۱۱ درصد تعلق یافتند .ژن mcr در هیچکدام از جدایه های مقاوم شناسایی نشد .در ۸/۸۸ درصد جدایه ها (۸ جدایه از ۹ جدایه مقاوم (پروتئین MgrB بوسیله قطعات الحاقی) IS از خانواده هایlike -like, IS۵-like, IS۳- IS۱در موقعیت های۱۱۳ +،۱۱۷ +،۱۱۳ + و۷۵ + (و همچنین موتاسیون های بی معنی (nonsence)در کدون های۸ ،۱۶ ، ۳۰ غیر فعال شده بود .همه جدایه های مقاوم دارای پروتئین های PmrA, PhoP, PhoQ وحشی و واریانت های مختلف از PmrB بودند .آنالیز توالی CrrB یک جایگزینی اسیدآمینه ای شناخته شده ۱۹۵ S N و ۴ جایگزینی جدید۳۰۳ F S،۱۵۰T R ، V۲۷I و ۳۲۵ K R را مشخص نمود .جایگزینی۹۳ T N در PmrB و حذف کامل لوکوس mgrB در دو سویه القا شده شناسایی شد و دیگر سویه مقاوم القا شده فاقد تغییر در ژن های مورد مطالعه در این تحقیق بود .در یکی از سویه های مقاوم با MgrB وحشی یک جایگزینی اسید آمینه ۸۳A V در CrrA شناسایی شد .نتایج بررسی های انجام گرفته در این تحقیق نشان داد که مقاومت به کولیستین در کلبسیلا نومونیه های حیوانی مطالعه شده بیشتر مربوط به تغییرات پروتئین MgrB می باشد
متن يادداشت
The emergence of colistin-resistant Enterobacteriaceae from human and animal sources is a public health concern as this antibiotic is considered to be the last line therapeutic option for infections caused by multidrug-resistant Gram-negative bacteria. Here we aimed to determine the prevalence of colistin resistance, among enterobacteria isolated from poultry and the possible underlying colistin resistance mechanisms. A collection of 944 cloacal samples were obtained from poultry and screened for colistin resistance. To uncover the molecular mechanism behind colistin resistance, the presence of plasmid encoded colistin resistance genes mcr-1, mcr-2, mcr-3 and mcr-4 was examined by PCR. The nucleotide sequences of the mgrB, pmrA, pmrB, phoP, phoQ, crrA and crrB genes were determined. The genetic relatedness of the colistin resistant (ColR) isolates was evaluated by Multilocus sequence typing. Three ColR mutants were generated in vitro by repetitive drug exposure. Overall from 931 enteric bacteria isolated from poultry samples obtained from 131 farms, nine ColR bacteria (0.96 ) with high level colistin resistance (MICs 64 mg/L) were detected all being identified as K. pneumoniae. The 9 ColR bacteria originated from different farms and belonged to 7 distinct Sequence types including ST11 (22.2 ) and ST726 (22.2 ) being the most prevalent STs followed by ST37, ST74, ST485, ST525 and novel sequence type 3380 (11.1 each). mcr-type genes were not detected in any isolate. In 88.8 of the isolates (n = 8), MgrB was inactivated by Insertion of IS elements (IS1-like, IS3-like, IS5-like families, positions + 75, + 113, + 117, + 135) and nonsense mutations at codons 8, 16, 30. All ColR isolates harboured wild type PmrA, PhoP, PhoQ or polymorphic variants of PmrB. Sequence analysis of the CrrB revealed a familiar S195N and 4 novel I27V, T150R, F303S and K325R substitutions. PmrB T93N substitution and mgrB locus deletion were identified in two laboratory induced ColR mutants and one mutant lacked alteration in the studied loci. In one ColR isolate with wild type MgrB an A83V substitution was detected in CrrA. It is concluded from our results that colistin resistance in the studied avian K. pneumoniae isolates was mostly linked to alterations identified within the mgrB gene
عنوان اصلی به زبان دیگر
عنوان اصلي به زبان ديگر
Assessing the prevalence and molecular mechanisms of colistin resistance in Enterobacteriaceae isolated from poultry samples in northwest of Iran
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )