عنوان

بررسی برخی ویژگی‌های مولکولی و زیستی ‮‭Pseudomonas syringae pv. syringae‬ عامل شانکر باکتریایی درختان بادام و زردآلو در استان آذربایجان‌شرقی و بیان افتراقی برخی ژن-های مرتبط با بیماری‌زایی و پرآزاری بیمارگر تحت شرایط تنش,‮‭Vasebi, Yalda‬

شماره

‭۲۰۲۳۳پ‬

زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن

per

عنوان اصلي

بررسی برخی ویژگی‌های مولکولی و زیستی ‮‭Pseudomonas syringae pv. syringae‬ عامل شانکر باکتریایی درختان بادام و زردآلو در استان آذربایجان‌شرقی و بیان افتراقی برخی ژن-های مرتبط با بیماری‌زایی و پرآزاری بیمارگر تحت شرایط تنش

عنوان اصلي به زبان ديگر

‮‭Vasebi, Yalda‬

نام نخستين پديدآور

/یلدا واصبی

نام ناشر، پخش کننده و غيره

: کشاورزی

تاریخ نشرو بخش و غیره

، ‮‭۱۳۹۷‬

نام توليد کننده

، میرزائی

نام خاص و کميت اثر

‮‭۱۳۹‬ص‬

متن يادداشت

چاپی - الکترونیکی

جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن

دکتری

نظم درجات

گیاه‌پزشکی - بیماری‌شناسی گیاهی

زمان اعطا مدرک

‮‭۱۳۹۷/۰۹/۲۸‬

کسي که مدرک را اعطا کرده

تبریز

متن يادداشت

بیماری شانکر باکتریایی درختان میوه هسته‌صدار با عامل ‮‭Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss)‬ یکی از بیماری‌صهای مهم و خسارت‌صزا در بسیاری از نقاط دنیا می‌صباشد .این بیماری در ایران از استان‌صهای مختلف گزارش شده است و تهدیدی جدی برای درختان میوه هسته‌صدار در کشور به-شمار می‌صرود .در پژوهش حاضر با توجه به گسترش چشم‌صگیر علایم شانکر درختان زردآلو و بادام مشکوک به آلودگی با باکتری ‮‭Pss‬ در استان آذربایجان‌صشرقی، جهت ردیابی و شناسایی برخی از خصوصیات فنوتیپی و ژنوتیپی جدایه‌صهای بیمارگر‮‭Pss‬ ، نمونه‌صبرداری از ‮‭۱۳‬ منطقه مختلف جغرافیایی استان انجام شد .در بررسی‌صهای انجام گرفته، از نمونه‌صهایی با علایم ظاهری شانکر تنه و شاخه همراه با ترشح صمغ، بلاست شکوفه و مرگ سرشاخه، تنها تعداد ده جدایه باکتری گرم منفی و تولیدصکننده رنگدانه فلورسنت، بر اساس آزمون‌صهای بیوشیمیایی و افتراقی ‮‭LOPAT‬ و ‮‭GATTa‬ به عنوان ‮‭Pss‬ شناسایی شدند .جدایه‌صهای ‮‭Pss‬ اختلاف بسیار جزیی در آزمون‌صهای مورفولوژیکی و فیزیولوژیکی نشان دادند .جدایه‌صها بر اساس آزمون بیماری‌صزایی روی سرشاخه‌صهای بریده زردآلو به دو گروه پرآزار و کم‌صآزار تقسیم شدند .نتایج آزمون دامنه میزبانی نشان داد که جدایه‌صها تخصص میزبانی نداشته و شدت علایم ایجاد شده روی برگ انبه، میوه لیموترش، غلاف لوبیا سبز و گیاهچه گوجه‌صفرنگی در میان جدایه‌صها متفاوت بود .جدایه‌صها تفاوت معنی‌صداری در مهار رشد رویشی پرگنه قارچ ‮‭Geotrichum candidum‬ با تولید زهرابه نشان دادند .نتایج بررسی مقاومت جدایه‌صها به آنتی‌صبیوتیک‌صها نشان داد که همه جدایه‌صهای ‮‭Pss‬ مقاوم به سفتریاکسون و اریترومایسین بوده در حالی که تتراسایکیلین بیشترین بازدارندگی را بر رشد پرگنه باکتری‌صها اعمال نمود .همه جدایه‌صهای ‮‭Pss‬ با داشتن ‮‭MIC‬ کمتر از ‮‭۸/۰‬ میلی‌صمولار به عنوان جدایه‌صهای حساس به مس شناسایی شدند .با استفاده از توالی‌صیابی بخشی از ناحیه ژنی‮‭۱۶S rRNA‬ ص‍، ‮‭۱۱۱‬ جدایه باکتریایی شامل ‮‭۵۴‬ جدایه به‌صدست آمده از زردآلو و ‮‭۵۷‬ جدایه به‌صدست آمده از بادام مورد شناسایی قرار گرفتند که ‮‭۱۴‬ جنس باکتریایی گرم منفی و مثبت متعلق به هشت خانواده از شش راسته به عنوان جدایه‌صهای باکتری رورست و درون‌صدرست درختان معرفی شدند .تنوع ژنتیکی جدایه‌صها با استفاده از توالی‌صیابی بخشی از ژن‌صهای‮‭rpoD‬ ،‮‭syrB‬ ، ‮‭inaZ‬ و ‮‭copA‬ و رسم تبارنما با استفاده از روش بایزین و همچنین انگشت‌صنگاری ‮‭DNA‬ با نشانگر‮‭PCR - IS۵۰‬مورد بررسی قرار گرفت .نتایج نشان داد که بر اساس توالی‌صیابی بخشی از ژن خانه‌صداری و ژن‌صهای حفاظت‌صشده و مرتبط با بیماری‌صزایی و پرآزاری، در میان جدایه‌صهای ‮‭Pss‬ تنوع ژنتیکی وجود داشته و در همه تبارنماها جدایه‌صها با بیشترین احتمال پسین به دو گروه کاملا متمایز تقسیم شدند .بعلاوه تجزیه‌صی خوشه‌صای جدایه‌صها بر اساس ضریب تشابه جاکارد و روش ‮‭UPGMA‬ نشان داد که در میان جدایه‌صهای ‮‭Pss‬ تنوع ژنتیکی بالایی وجود داشته و در سطح تشابه ‮‭۳۵‬ درصد جدایه‌صها بر اساس منشا میزبانی به دو گروه متمایز تقسیم شدند .نتایج بررسی بیان ژن‌صهای‮‭algD‬ ،‮‭copA‬ ،‮‭fliC‬ ،‮‭hrpA‬ ، ‮‭syrB‬ و ‮‭tatC‬ با روش‮‭time PCR - Real‬تحت تنش مس در جدایه حساس به مس‮‭۱۷۰ - Pss‬نشان داد که تمامی ژن‌صها در برابر تنش مس در مقایسه با شاهد فاقد مس در زمان‌صهای مختلف تغییر بیان داشته و در این میان ژن‌صهای ‮‭algD‬ و ‮‭copA‬ بیشترین میزان بیان را به ترتیب به میزان‮‭۷/۴‬ -برابر و‮‭۷/۲‬ -برابر درمقایسه با شاهد فاقد مس نشان دادند

متن يادداشت

Bacterial canker disease of stone fruit trees caused by Pseudomonas syringae pv. syringae (Pss) is one of the most important and damaging diseases in the world. This disease has been reported from different provinces in Iran and is a serious threat to stone fruit trees in the country. In the present study, due to increases in canker symptoms on almond and apricot trees suspected tobe infected with Pss strains in East Azarbaijan province, detection and determination of some phenotypic and genetic characteristics of these strains were performed after sampling from 13 different geographical regions. In the diseased samples with apparently symptoms including stem and twig canker, oozing, blossom blast and apical dieback, a total of 10 Gram negative and fluorescent-producing bacterial strains were identified as Pss based on biochemical and differential LOPAT and GATTa tests. Strains showed slight differentiation in morphological and physiological tests. Strains were divided into two virulent and less virulent groups based on the pathogenicity tests on cutting apricot twigs. Results of host range showed that strains did not have host specificity and severity of symptoms caused by strains was variable on mango leaves, lemon fruits, bean pods and tomato seedlings. Strains showed significant differences in regard to inhibition of Geotrichum candidum mycelial growth by toxin production. Results of antibiotic assays showed that all strains were resistant to ceftriaxone and erythromycin while strongly inhibited by tetracycline. All Pss strains with MICs less than 0.8 mM CuSO4 were identified as copper sensitive. A number of 111 bacterial strains including 54 strains isolated from apricot and 57 strains isolated from almond were identified using the partial sequencing of 16S rRNA gene. Fourteen Gram negative and positive bacterial genera belonging to eight families and six orderes were introduced as endophytic and epiphytic strains. Genetic diversity of strains were evaluated using partial sequencing of rpoD, syrB, inaZ and copA genes with constructing a dendrogram using Bayesian inference and DNA fingerprinting using IS50-PCR analysis. Results showed high genetic diversity among Pss strains using partial sequencing of housekeeping, pathogenicity- and virulence-related genes. In all phylogenetic trees strains were divided into two groups with high posterior probability. Cluster analysis performed using Jaccards similarity coefficients showed high genetic diversity among strains being divided into two distinct clusters at the 35 similarity level based on host of origin. Results of expression of algD, copA, fliC, hrpA, syrB, and tatC genes using Real-time PCR in the copper sensitive Pss 170 strain upon exposure to copper showed that all genes had change in its expression compared to control. Among the tested genes, the algD and copA genes showed the highest increase in expression 4.75-fold and 2.68-fold, respectively compared to a non-copper control

عنوان اصلي به زبان ديگر

‮‭Vasebi, Yalda‬

مستند نام اشخاص تاييد نشده

واصبی، یلدا

مستند نام اشخاص تاييد نشده

Study of Some Molecular and Biological Features of Pseudomonas syringae pv. syringae, Causal Agent of Bacterial Canker of Almond and Apricot Trees, in East Azarbaijan Province and Differential Expression of Some Pathogenicity- and Virulence-Related Genes of Pathogen Under Stress Condition

مستند نام اشخاص تاييد نشده

خاک‌ور، رضا، استاد راهنما

مستند نام اشخاص تاييد نشده

ویناتزر، بوریس، استاد راهنما

مستند نام اشخاص تاييد نشده

صابری‌وند، عادل، استاد مشاور

مستند نام اشخاص تاييد نشده

فقیهی، محمدمهدی، استاد مشاور

يادداشت عمومي

سیاه و سفید

وضعیت فهرست نویسی

نمایه‌سازی قبلی