عنوان

بررسی تنوع ژنتیکی گله اصلاح نژادی گوسفند قره‌گل با استفاده از تجزیه و تحلیل شجره

شماره

‭۱۸۶۷۵پ‬

زبان متن نوشتاري يا گفتاري و مانند آن

per

عنوان اصلي

بررسی تنوع ژنتیکی گله اصلاح نژادی گوسفند قره‌گل با استفاده از تجزیه و تحلیل شجره

نام نخستين پديدآور

/سعیده صادقی

نام ناشر، پخش کننده و غيره

: کشاورزی و منابع طبیعی اهر

تاریخ نشرو بخش و غیره

، ‮‭۱۳۹۶‬

نام توليد کننده

، میرزائی

متن يادداشت

چاپی

جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن

کارشناسی ارشد

نظم درجات

علوم دامی گرایش ژنتیک و اصلاح دام

زمان اعطا مدرک

‮‭۱۳۹۶/۱۱/۱۰‬

کسي که مدرک را اعطا کرده

تبریز

متن يادداشت

هدف :هدف از تحقیق حاضر بررسی تنوع ژنتیکی گله اصلاح نژادی گوسفند قره‌صگل با استفاده از تجزیه و تحلیل شجره بود .روش‌صشناسی پژوهش :سطح کامل بودن شجره، همخونی، همتباری و روند آن در طول سال‌صهای مورد بررسی با استفاده از اطلاعات شجره‌صای جمع‌صآوری شده بین سال‌صهای ‮‭۱۳۶۸‬ تا ‮‭۱۳۹۳‬ برآورد گردید .دامهای متولد شده در ‮‭۴‬ سال آخر فایل شجره با شاخص تکامل شجره بالای ‮‭۶/۰‬ به عنوان جمعیت مرجع جهت برآورد فراسنجه‌صهای احتمال منشاء ژن و اندازه موثر جمعیت مورد استفاده قرار گرفتند .همخونی حیوانات جمعیت مرجع به ضریب همخونی جزئی حاصل از ‮‭۲۸۰‬ حیوان بنیانگذار جمعیت مرجع تجزیه گردید .همچنین همخونی اجدادی بالو، همخونی جدید و همخونی اجدادی کالینفسکی برای کل دامها برآورد گشته و روند آن در طول سالها مورد بررسی قرار گرفت .یافته‌ها :میانگین شاخص کامل بودن شجره و تعداد معادل نسل‌صهای کامل حیوانات جمعیت مرجع به ترتیب ‮‭۷۱‬ درصد و ‮‭۸/۴‬ سال بود .میانگین همخونی در کل حیوانات و در حیوانات جمعیت مرجع به ترتیب ‮‭۸۵/۰‬ و ‮‭۳۶/۱‬ درصد بود .با برازش خط رگرسیون همخونی بر سال تولد، میزان افزایش سالانه همخونی ‮‭۰۵/۰‬ درصد در سال و ‮‭۱۶/۰‬ به ازای هر نسل برآورد گردید ‮‭۱۰۸‬ .فرد از ‮‭۲۸۰‬ فرد بنیانگذار جمعیت مرجع در ضریب همخونی جمعیت مرجع مشارکت مثبت داشتند ‮‭۱۰‬ .و ‮‭۲۵‬ فرد بنیانگذار با بیشترین مشارکت در همخونی، به ترتیب ‮‭۴۲‬ و ‮‭۶۶‬ درصد همخونی جمعیت مرجع را تبیین می‌صکردند .میانگین همخونی اجدادی بالو در کل جمعیت و در افراد جمعیت مرجع به ترتیب ‮‭۱۷/۱‬ و ‮‭۱۲/۲‬ درصد بود .مقدار همخونی اجدادی کالینفسکی در این جمعیت پایین بود بطوریکه میانگین همخونی اجدادی کالینفسکی در کل جمعیت و در افراد جمعیت مرجع به ترتیب ‮‭۰۷/۰‬ و ‮‭۰۴/۰‬ درصد بود .بدین ترتیب قسمت عمده همخونی در طول سال‌صهای مورد مطالعه به همخونی جدید مربوط می‌صگردید .در این تحقیق اندازه موثر جمعیت با استفاده از روش افزایش همخونی فردی و افزایش همتباری فردی به ترتیب ‮‭۵۷/۱۳۹‬ و ‮‭۶۳/۱۰۰‬ رأس برآورد گردید .بر اساس نتایج حاصل از آنالیز احتمال منشاء ژن، تعداد کل حیوانات بنیان‌صگذار جمعیت مرجع ‮‭۲۸۰‬ رأس بود .در حالیکه تعداد مؤثر حیوانات بنیان‌صگذار ‮‭۷۴‬ رأس بود .تعداد اجداد اصلی جمعیت جهت تبیین‮‭۱۰۰‬ ، ‮‭۷۰‬ و ‮‭۵۰‬ درصد مخزن ژنتیکی جمعیت مرجع به ترتیب‮‭۲۴۲‬ ، ‮‭۳۶‬ و ‮‭۱۷‬ رأس بود .تعداد مؤثر اجداد و تعداد مؤثر ژنوم حیوانات بنیان‌صگذاربه ترتیب ‮‭۴۷‬ و ‮‭۶/۲۲‬ رأس برآورد گردید .نتیجه‌صگیری :با در نظر گرفتن بسته بودن این گله اصلاح نژادی، روند همخونی و اندازه موثر جمعیت برآوردشده برای جمعیت در سطح قابل قبولی بود .با این وجود، بر اساس نتایج آنالیز فراسنجه‌صهای احتمال منشأ ژن، جمعیت تحت بررسی بخشی از تنوع ژنتیکی خود را در اثر مشارکت نامتعادل حیوانات بناینگذار، وقوع تنگناصها و همچنین رانش ژنتیکی تصادفی از دست داده است .از اطلاعات حاصل از تجزیه ضریب همخونی به ضرایب همخونی جزئی، می‌صتوان برای طراحی تلاقی‌صهایی در جهت کاهش پسروی همخونی در گله استفاده نمود .با توجه به ضریب همخونی اجدادی بالو برآورد شده برای جمعیت مرجع در این تحقیق، بررسی امکان وقوع پدیده حذف آلل‌صهای مغلوب در این جمعیت پیشنهاد می‌صگردد .همچنین استفاده از روشهایی همچون مشارکت بهینه والدین در کنار برنامه انتخاب می‌صتواند به پیشرفت ژنتیکی مطلوب با کمترین کاهش در تنوع ژنتیکی گله کمک نماید

متن يادداشت

Research Aim:The objectives of this study was to evaluate the genetic diversity in the breeding flock of Karakul sheep using pedigree analysis. Research method: Pedigree completeness level, Inbreeding, coancestry and its evolution in the studied years were estimated using the pedigree information collected from 1989 to 2014. Animals born between 2011 and 2014 with a pedigree completeness index of at least 0.6 were selected as a reference population for estimating parameters derived from probability of gene origin and effective population size. Inbreeding of the animals in the reference population decomposed to the partial inbreeding from 280 founders of the reference population. Also, Ballou ancestral inbreeding, new inbreeding and Kalinowski ancestral inbreeding of the all animals were estimated and their evolution over time were evaluated. Findings: Mean pedigree completeness index and complete generation equivalent for animals of the reference population were 71 percent and 4.8 years, respectively. Average inbreeding in all animals and in animals of the reference population were 0.85 and 1.36 percent, respectively. Linear regression of inbreeding on year of birth resulted in an estimated rate of inbreeding of 0.05 per year and 0.16 per generation. Among 280 founders of the reference population, 108 animals have positive contribution to the inbreeding of the reference population. The 10 and 25 founders contributing the most to inbreeding explained 42 and 66 of the inbreeding of the reference population, respectively. Mean Ballou ancestral inbreeding of the all animals and animals of the reference population were 1.17 and 2.12, respectively. The amount of Kalinowski ancestral inbreeding was low in this population, as mean Kalinowski ancestral inbreeding for all animals and animals of the reference population were 0.07 and 0.04, respectively. Therefore, a large part of the inbreeding in the studied years was from New inbreeding. In this study, effective population size estimated from individual increase in inbreeding and individual increase in coancestry was 139.57 and 100.63, respectively. Based on the results from probability of gene origin analysis, total number of founders of the reference population was 280. Whereas, effective number of founders was 74. Number of ancestors explaining 100, 70 and 50 of the gene pool of the reference population were 242, 36 and 17, respectively. Effective number of ancestors and effective number of founder genomes of the reference population were 47 and 22.6, respectively. Conclusion: Considering that this breeding flock is close, the trends of inbreeding and estimated effective population size were in acceptable level. However, based on the probability of gene origin analysis, population under study has lost a part of its genetic diversity due to unbalanced contribution of founders, bottlenecks and genetic drift. The information derived from the decomposition of the inbreeding to the partial inbreeding coefficients can be used in mating decisions for reducing inbreeding depression in this herd. Considering the estimated Ballous ancestral inbreeding for the reference population in this study, testing the incidence of purging of the deleterious alleles in this population are suggested. Also, implementation of the methods such as optimum contribution of parents beside the selection programs, can help to achieve desired genetic gain with minimum loos of genetic diversity in this herd

مستند نام اشخاص تاييد نشده

صادقی، سعیده

مستند نام اشخاص تاييد نشده

صادقی، سعیده، استاد راهنما

مستند نام اشخاص تاييد نشده

صفری، رشید، استاد مشاور

مستند نام اشخاص تاييد نشده

بحری بیناباج، فاطمه، استاد مشاور

يادداشت عمومي

سیاه و سفید

وضعیت فهرست نویسی

نمایه‌سازی قبلی