شناسایی گونه های Colletotrichum دخیل در بیماری آنتراکنوز توتفرنگی در استان کردستان براساس ویژگی های ریخت شناختی و مولکولی و کنترل زیستی این بیماری با استفاده از آنتاگونیست های قارچی و باکتریایی
نام نخستين پديدآور
/کیوان کریمی
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
: کشاورزی
تاریخ نشرو بخش و غیره
، ۱۳۹۵
یادداشتهای مربوط به نشر، بخش و غیره
متن يادداشت
چاپی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
دکتری
نظم درجات
بیماریشناسی گیاهی
زمان اعطا مدرک
۱۳۹۵/۱۰/۳۰
کسي که مدرک را اعطا کرده
تبریز
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
بیماری آنتراکنوز توتفرنگی که توسط گونهصهای جنس Colletotrichum ایجاد میصشود، یکی از عوامل محدود کننده اصلی کشت توتفرنگی در سرتاسر جهان به شمار میصرود .این بیماری اخیرا در مناطق عمده کشت توتفرنگی در ایران بصورت همهصگیری ظهور پیدا کرده است .از اینرو، در این مطالعه شناسایی گونهصهای Colletotrichum ایجادکننده آنتراکنوز توتفرنگی و کارآیی آنتاگونیستصهای قارچی و باکتریایی جهت کنترل این بیماری مورد بررسی قرار گرفت .به منظور شناسایی، ترکیبی از دادهصهای ریخت شناختی، مولکولی و تعامل میزبان - بیمارگر) اشاره به مفهوم تلفیقی گونه (برای تشخیص گونهصهای ایجادکننده بیماری آنتراکنوز توتفرنگی در استان کردستان بکار برده شد .در آنالیز تبارشناختی چند ژنی با توجه به نوع گروهصصهای قارچی مورد مطالعه و با استفاده از چهار ناحیه ژنیrDNA - ITS،rDNA-LSU،tubulin (TUB۲) - betaوphosphate dehydrogenase (GAPDH)-۳- glyceraldehyde، هویت اکثر جدایهصها (۹۵ جدایه (گونه Colletotrichum nymphaeae و تعداد ۱۸ جدایه نیز گونه Pilidium lythri تعیین گردید .هیچ تنوع درون گونهصای معنیصداری از لحاظ خصوصیات ریخت شناختی و بیماریصزایی میان جدایهصهای مورد بررسی مشاهده نشد .با استفاده از نشانگرهای چند شکلی توالیصهای تکرار شونده ساده بینابینی (ISSR) و توالیصهای تکراریPCR) - (repبرای جدایهصهای C. nymphaeae و نشانگرهای چند شکلی قطعات تکثیر شده تصادفی (RAPD) و ماهوارک (M۱۳ minisatellite) برای جدایهصهایP. lythri ، هیچ تنوع ژنتیکی میان جدایهصهای مورد بررسی مشاهده نشد .طبق نتایج این مطالعه میصتوان ادعا کرد که جمعیتصهای این دو گونه از طریق اثر بنیانگذار از یک منبع خاص نشأت گرفتهصاند .آنالیز زمانسنجی مولکولی برای گونه C. nymphaeae براساس ساعت زمانسنجی آرام، واگرایی همزمان زیر خوشه S۵ C. nymphaeae و گیاه توتفرنگی را نشان داد .نتایج این آنالیز وجود ارتباط بسیار نزدیک و تکامل همسو میزبان و بیمارگر را اثبات کرد .در این مطالعه همچنین کارآیی ۲۰ جدایه محلی جنس Trichoderma بدست آمده از ریزوسفر و فیلوسفر گیاه توتفرنگی و سه استرین تجاریT. atroviride SC۱ ، Pseudomonas chlororaphis M۱۷ وP. protegens Pf- ۵در مقابل استرین بیمارگر C. nymphaeae CCh۳۲ در شرایط in vitro و on plantaمورد ارزیابی قرار گرفت .در ابتدا، آنالیز تبارشناختی جدایهصهای Trichoderma با استفاده از توالیrDNA- ITSجدایهصهای مورد مطالعه را در پنج گونه) Trichoderma harzianum ده جدایه(،) T. virens سه جدایه(،) T. pleuroticola پنج جدایه(،) T. afroharzianum یک جدایه (و) T. asperellumیک جدایه (گروهبندی کرد .نتایج آزمونصهای کشت متقابل، ترکیبات خارج سلولی غیر فرار و فرار نشان دادند که این آنتاگونیستصها نسبت به شاهد به طور معنیصداری رشد میسلیومی بیمارگر را کاهش دادند .اکثر استرینصهای Trichoderma در این مطالعه قادر به بیان آنزیمصهای لیزکننده شامل کیتیناز، بتا۱ و ۳گلوکوناز، پروتئاز و سلولاز بودند .همچنین استرینصهای باکتریایی و قارچی از لحاظ تولید سیدروفور، توانایی حلالیت فسفات، پارازیتیسم و ایجاد ناهنجاری در رشد میسلیومی بیمارگر مثبت ارزیابی گردیدند .استرینصهای منتخب شاملT. virens CCTUT۴ ،T. atroviride SC۱ ، P. chlororaphis M۱۷ وP. protegens Pf- ۵توانستند وقوع و شدت بیماری را در مقایسه با شاهد آلوده به طور معنیصداری کاهش دهند هر چند که اختلاف قارچصکش سویچ با آنتاگونیستصها از لحاظ کاهش وقوع بیماری معنیصدار بود .میزان شدت بیماری در برگصهای مایهصزنی شده با T. atroviride SC۱ در هر سه غلظت استفاده شده در مقایسه با سایر آنتاگونیست کمتر بود هر چند که تفاوت معنیصداری با آنها نداشت .یک همبستگی مثبت در کاهش وقوع و شدت بیماری با افزایش جمعیت آنتاگونیستصها در این مطالعه مشاهده شد .براساس یافتهصهای بدست آمده در این تحقیق عوامل بیوکنترل استفاده شده در این مطالعه شامل استرینصهای Trichoderma و Pseudomonas میصتوانند جایگزین مناسبی برای قارچ-کشصهای شیمایی باشند اگرچه ارزیابی آنها در شرایط مزرعه و در تیمارهای ترکیبی باید مورد بررسی قرار بگیرد
متن يادداشت
fungicide was only able to reduce disease incidence completely compared with infected treatment while all treatments were able to reduce disease severity significantly compared with infected control. Meantime, disease severity rate on leaves inoculated with T. atroviride SC۱ was lower in the three concentrations used, although it had no significant difference with other treatments. A positive correlation in disease incidence and severity reduction was detected with increasing population density of antagonists in present study. Findings from this study suggest that the biocontrol agents used in this study including Trichoderma spp. and Pseudomonas spp. can be suitable alternatives for chemical fungicides although their assessment in field condition and as combined treatments remained to be examined ضfungicide on planta bioassays revealed that Switch ضStrawberry anthracnose caused by Colletotrichum spp. is one of the main constraints for strawberry production worldwide including Iran. The disease has recently reached to epidemic level in the major strawberry producing areas of Iran. Accordingly, in the current study the identity of Colletotrichum species causing strawberry anthracnose and the efficacy of fungal and bacterial antagonists against anthracnose disease was studied. A combination of morphological, molecular and pathogen-host interaction data (referred to as the Consolidated Species Concept) was applied to characterize Colletotrichum spp. occurring on strawberry in the Kurdistan province of Iran. Multi-gene phylogenetic analysis based on fungal group and using four loci of ITS-rDNA, LSU-rDNA, beta-tubulin (TUB۲) and glyceraldehyde-۳-phosphate dehydrogenase (GAPDH), revealed the identity of most isolates as being Colletotrichum nymphaeae (۹۵ isolates) and ۱۸ isolates as Pilidium lythri. No significant intra-species variation was observed in terms of morphology and the pathogenicity among both fungal populations. Genetic diversity among the isolates was evaluated using inter simple sequence repeat analysis (ISSR) and repetitive sequence-based PCR (rep-PCR) fingerprinting markers for some C. nymphaeae isolates and random amplified polymorphic DNA (RAPD) and M۱۳ minisatellite markers for P. lythri isolates. No significant genetic variation was observed among the isolates. Overall, based on the results of this study it can be postulated that C. nymphaeae and P. lythri populations over the strawberry fields in Kurdistan province have been established from a single origin by a founder effect. More generally, molecular dating based on relaxed clocks indicates co-radiation of C. nymphaeae S۵ and strawberry plants and suggests a high reciprocal specificity between the host and pathogen. Also, the efficacy of twenty indigenous Trichoderma spp. obtained from strawberry's rhizosphere and phyllosphere and three commercial strains of Trichoderma atroviride SC۱, Pseudomonas chlororaphis M۷۱ and P. protegens Pf-۵ was assessed against C. nymphaeae strain Cch۳۲ under in vitro and on planta conditions. ITS-rDNA phylogeny of Trichoderma isolates grouped all isolates in five species of T. harzianum (ten strains), T. pleuroticola (five isolates), T. virens (three isolates), T. asperellum (on isolate) and T. afroharzianum (one isolate). In vitro tests including dual culture, non-volatile and volatile compounds showed that all antagonistic isolates used in this study were able to significantly inhibit the mycelial growth of the pathogen. The majority of Trichoderma spp. isolates produced lytic enzymes including chitinase, ?-۱,۳gluconase, protease and cellulase. Also, Trichoderma spp. and Pseudomonas spp. isolates were positively detected for siderophore production, phosphate solubilisation, parasitism and malformation of host hyphae. In evaluation of the selected antagonistic strains including T. virens CCTUT۴, T. atroviride SC۱, P. chlororaphisM۱۷ and P. protgens Pf-۵ in comparison to Switch
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )