بررسی تنوع گونهای و فیلوژنی مخمرها در خاک های حوزه دریاچه ارومیه و کنترل زیستی بیماریصهای پوسیدگی خوشه انگور با استفاده از گونهصهای جنس Pichia
عنوان اصلي به زبان ديگر
B
نام نخستين پديدآور
/لاچین مختارنژاد
وضعیت نشر و پخش و غیره
نام ناشر، پخش کننده و غيره
: کشاورزی
تاریخ نشرو بخش و غیره
، ۱۳۹۴
نام توليد کننده
، راشدی
یادداشتهای مربوط به نشر، بخش و غیره
متن يادداشت
چاپی
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
دکتری
نظم درجات
بیماری شناسی گیاهی (گرایش قارچ_شناسی)
زمان اعطا مدرک
۱۳۹۴/۱۱/۱۳
کسي که مدرک را اعطا کرده
تبریز
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
به منظور مقایسه تنوع زیستی مخمرها در محیطصهای فرانرمال و محیطصهای نرمال، تنوع مخمرهای خاکصهای نواحی مختلف پارک ملی دریاچه ارومیه و همچنین مناطق مختلف کشور بررسی شد .برای این منظور نمونهصهای خاک از عمق۱۵ - ۵سانتیصمتری جمع آوری و مخمرهای آنها جداسازی و خالصصسازی شدند .گروهصبندی اولیه جدایهصهای مخمر از طریق انگشتصنگاری DNA با استفاده ازPCR - MSPصورت گرفت .یک یا چند جدایه منتخب از هر گروه با استفاده از دادهصهای توالیصیابی ناحیه D۱/D۲ ژن ۲۶s rDNA و ناحیه ITS و آزمونصهای فیزیولوژیک شناسایی شدند .در این تحقیق مشخص شد که تنوع بالایی از مخمرها هم در حوزه فرانرمال دریاچه ارومیه و همچنین حوزه نرمال خاکصهای سایر مناطق کشور وجود دارد .از ۱۴۴ جدایه جداسازی شده از حوزه دریاچه ارومیه، تعداد ۲۷ گونه متعلق به ۱۰ جنس شناسایی و معرفی شد که ۱۳ گونه متعلق به جنسCryptococcus (C. aerius ،C. adeliensis ،C. uzbekistansesis ،C. albidosimilis ،C. bhutanensis ،C. terreus ،C. ramirezgomezianus ،C. podzolicus ،C. saitoi ،C. friedmannii ،C. diffluens ، C. victoriae وC. albidus) ، چهار گونه متعلق به جنسRhodotorula (R. laryngis ،R. lysiniphila، R. mucilaginosa وR. minuta) ، دو گونه متعلق به جنس Holtermanniella (H. wattica وH. takashimae) ، دو گونه متعلق به جنس Debaryomyces (D. subglobosus و D. hansenii) و گونهصهایRhodosporidium kratochvilovae ،Trichosporon pullulans ،Torulaspora delbrueckii ،Metschnikowia sinensis ، Candida baotianensis و Meyerozyma guilliermondiiمیصباشند .از ۷۹ جدایه مورد بررسی از محیط های نرمال نقاط مختلف کشور، تعداد یازده گونه متعلق به جنسCryptococcus( C. adeliensis ،C. aerius ،C. albidus ،C. bhutanensis ،C. diffluens ،C. friedmannii ،C. flavescens ،C. podzolicus ،C. oeirensis ، C. terreus وC. uzbekistansis) ، چهار گونه متعلق به جنسRhodotorula (R. babjevae ،R. diobovatum ، R. kratochvilovae وR.larynges) ، دو گونه متعلق به جنس Candida (C. baotianensis وC. parapsilosis) ، سه گونه ناشناخته از .Metschnikowia و همچنین گونهصهایDebaryomyces subglobosus ،Issatchenkia orientalis ،Lindnera saturnus ، Meyerozyma guilliermondiiو Saccharomyces cerevisiae معرفی شدند .براین اساس جنس Cryptococcus بیشترین فراوانی را داشت ( ( ۸۴ و بهصخصوص گونه C. aerius گونه غالب حوزه دریاچه ارومیه و کل کشور میصباشد که از تمام مناطق نمونه برداری به جز جزیره اشک جداسازی و شناسایی شد .تمام جدایهصهای مخمر حاصل از محیط فرانرمال دریاچه ارومیه، قادر به رشد در دمای۴ ، ، ۱۰ ۲۰و ۳۰ درجه سانتیصگراد بودند اما تنها ۲۸ جدایه قادر به رشد در دمای ۴۰ درجه سانتیصگراد بودند که اغلب به جنس Cryptococcus (۱۸ جدایه (تعلق داشتند ۳/۶۳ .درصد جدایهصها بر روی محیط کشت حاوی ۱۰ نمک رشد کردند ولی از این تعداد جدایه فقط ۱۸ جدایه در محیط کشت با غلظت ۱۵ رشد نمودند که متعلق به جنس های) Cryptococcus هشت جدایه(،) Rhodotorula دو جدایه(،) Debaryomyces دو جدایه(،) Meyerozyma چهار جدایه(،) Metschnikowia یک جدایه(، و) Candida یک جدایه (بودند .از نظر توانایی جدایه های مخمری در تولید آنزیمصهای آمیلاز، استراز، پکتیناز و پروتئاز، آنزیم پکتیناز به طور گستردهصتری تولید شد .نه جدایه ازC. adeliensis ، پنج جدایه از C. albidosimilis دوجدایه از C. bhutanensis و یک جدایه از گونهصهایC. bhutanensis ،C. podzolicus ،C. saitoi ،C. terreus ، T. pullulans و M. guilliermondi دارای فعالیت پکتیناز بودند .بعد از پکتیناز، فعالیت استراز در تعداد بیشتری از جدایهصهای مخمر دیده شد و ۱۵ جدایه دارای فعالیت استرازی بودند .دو جدایهص T. pullulans و M. guilliermondi برای تولید هر چهارآنزیم مورد بررسی، نتیجه مثبت نشان دادند .نتایج توالیصهای ناحیه D۱/D۲ جنس Cryptococcus به طور جالبی تنوع درون گونه ای را نشان داد و بر این اساس، تقسیم این جنس به چهار بخش مختلف پیشنهاد میصشود .زیر همصچینی توالی ناحیه LSU گونه C. aerius و مقایسه آن با استرین تیپ موجود در بانک ژن، نشان دهنده تنوع گستردهصای در اعضای این گونه میصباشد .جدایه های C. aerius جداسازی شده از حوزه دریاچه ارومیه را به طور خاص در چهار گروه جداگانه می توان توصیف کرد .گروه A از گونه تیپ (CBS ۱۵۵) با جدایهصهایی با توالی مشابه یا همچنین جدایهصهایی با اختلاف یک نوکلئوتید در توالی ناحیه D۱/D۲ تشکیل شده است .بر اساس نتایج توالیصیابی ناحیه D۱/D۲ و تستصهای فیزیولوژیک، گونهصهای گروه B و Cبهصعنوان Cryptococcus cf. aerius مطرح میصشود .چهار جدایه قرار گرفته در گروه D را میصتوان به عنوان یک گونه جدید و توصیف نشده تعریف کرد .نتایج حاصل از بررسی فعالیت بازدارندگی یازده جدایه Pichia guilliermondii در مهار رشد دو قارچ Penicillium expansum وBotrytis cinerea ، عوامل پوسیدگی حبه انگور، به روش آزمون کشت متقابل روی محیط PDA نشان داد که سه جدایهPichia guilliermondii (۳ ، ۸ و ۱۰) تاثیر قابل قبولی در مهار دو قارچ مذکور دارند .تاثیر سه جدایه Pichia guilliermondii منتخب در کاهش پوسیدگی حبه های انگور مایه زنی شده با قارچ های P. expansum و B. cinerea در شرایط انبار مشخص کرد که هر سه مخمر به طور معنیصداری از میزان کپکصزدگی و پوسیدگی حبه های انگور ممانعت می کنند .مخمر شماره ۸ با ۳/۸۲ درصد کاهش تعداد حبه های آلوده موثرترین تیمار در کنترل P. expansum بود .مخمر شماره ۱۰ با ۵/۷۸ درصد کاهش تعداد حبهصهای آلوده، موثرترین تیمار در کنترل پوسیدگی ناشی از B. cinerea بود
متن يادداشت
In the present study the biodiversity of yeasts species in the soils of different areas of the National Park of Urmia Lake (extreme environment) as well as the soils of different regions of the Iran (normal environments) was studied in order to compare distribution of yeast species in extreme and normal environments. Soil samples were collected from 515 cm depth, subsequently yeast strains were isolated and purified. Yeast isolates were primary screened using MSP-PCR DNA fingerprinting. One or a few selected representatives from each cluster were identified using sequence data (D1/D2 domains of the 26S rDNA gene and the ITS region) and physiologic tests. A total number of 144 yeast strains were isolated from National Park of Urmia Lake that 27 species belonging to 10 genera were introduced: viz., Cryptococcus aerius, C. adeliensis, C. uzbekistansesis, C. albidosimilis, C. bhutanensis, C. terreus, C. ramirezgomezianus, C. podzolicus, C. saitoi, C. friedmannii, C. diffluens, C. Victoria, , C. albidus, Rhodotorula mucilaginosa, R. laryngis, R. lysiniphila, R. minuta, Holtermanniella wattica, H. takashima Debaryomyces hansenii, D.subglobosus, Meyerozyma guilliermondii, Torulaspora delbrueckii, Metschnikowia sinensis, Rhodosporidium kratochvilovae, Trichosporon pullulans and Candida baotianensis. Among the 79 yeast isolates from normal environment of other region of Iran, 11 species Cryptococcus (C. adeliensis, C. aerius, C. albidus, C. bhutanensis, C. diffluens, C. friedmannii, C. flavescens, C. podzolicus, C. oeirensis, C. terreus and C. uzbekistansis; 4 species belonged to Rhodotorula (R. babjevae, R. diobovatum, R. kratochvilovae and R.larynges); 2 species belonged to Candida (C. baotianensis and C. parapsilosis); three unknown species of Metschnikowia; Debaryomyces subglobosus; Issatchenkia orientalis; Lindnera saturnus; Meyerozyma guilliermondii and Saccharomyces cerevisiae. The genus Cryptococcus represented the dominant genus with an isolation frequency of 84 ; in particular C. aerius were isolated from almost all of the sampling sites (except of Ashk island). All yeast isolates obtained from extreme environment of National Park of Urmia Lake grew at various temperatures such as 4, 10, 20 and 30 while 28 isolates (mainly members of the genus Cryptococcus (18 isolates)) had ability to grow at 40. However, 63.3 of isolates could grow at culture medium with 10 NaCl2 while 18 isolates (8 isolates of Cryptococcus; 2 isolates of Debaryomyces; 2 isolates of Rhodotorula, 4 isolates of Meyerozyma and 1 isolate of Metschnikowia and Candida) could grow at culture medium with 15 NaCl2. The ability of yeast isolates to produce four enzymes (amylase, esterase, pectinase and protease) showed that pectinase is the most prevalent enzyme that produces. Nine isolates of C. adeliensis; five isolates of C. albidosimilis; two isolates of C. bhutanensis and one isolate of C. bhutanensis, C. podzolicus, C. saitoi, C. terreus, T. pullulans and M. guilliermondi could produce pectinase. In addition, 15 isolates produced esterase. The co-production of four enzymes was determined in 2 isolates T. pullulans and M. guilliermondi. The alignment of LSU sequences of C. aerius isolates showed a widespread variability when compared with the type strain (CBS 155) and with other sequences of the same species found in GenBank database. In particular 4 separate groups can be described Group A includes strains exhibiting the same sequence of type strain, or differed from it in a single position. The isolates belong to both groups B and C were introduced as Cryptococcus cf. aerius. In addition, sequence data suggested that the 4 strains can be accommodated in the same cluster (Group D) and can be considered as an undescribed species. The results of inhibitory activity of 11 Pichia guilliermondii isolates against two postharvest pathogens of grape, Pencillium expansum and Botrytis cinerea, showed Pichia guilliermondii that three yeast isolates (3, 8 and 10) can considerably inhibit both fungi in dual culture method on PDA medium. Three promising isolates were selected to reduce postharvest decays of grape at the storage period. The results exhibited that three yeast isolates could significantly reduce grape decays. The yeast isolate 8 by reducing 82.3 of grape decays, showed the strongest activity against P. expansum. The yeast isolate 10 was found the most effective isolate to supress B. cinerea decay on grape by 78.5
عنوان اصلی به زبان دیگر
عنوان اصلي به زبان ديگر
B
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )