عنوان
پدید آورنده
موضوع
رده
کتابخانه
محل استقرار
شماره کتابشناسی ملی
شماره
LA26f5z8cn
عنوان و نام پديدآور
عنوان اصلي
Detection of homologous recombination events in bacterial genomes.
نام عام مواد
[Article]
نام نخستين پديدآور
Wang, Wei-Bung; Jiang, Tao; Gardner, Shea
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
We study the detection of mutations, sequencing errors, and homologous recombination events (HREs) in a set of closely related microbial genomes. We base the model on single nucleotide polymorphisms (SNPs) and break the genomes into blocks to handle the rearrangement problem. Then we apply a dynamic programming algorithm to model whether changes within each block are likely a result of mutations, sequencing errors, or HREs. Results from simulation experiments show that we can detect 31%-61% of HREs and the precision of our detection is about 48%-90% depending on the rates of mutation and missing data. The HREfinder software for predicting HREs in a set of whole genomes is available as open source (http://sourceforge.net/projects/hrefinder/).
مجموعه
تاريخ نشر
2013
عنوان
UC Riverside
دسترسی و محل الکترونیکی
نام الکترونيکي
مطالعه متن کتاب اطلاعات رکورد کتابشناسی
نوع ماده
[Article]
کد کاربرگه
275578
اطلاعات دسترسی رکورد
سطح دسترسي
a
تكميل شده
Y
