عنوان
پدید آورنده
موضوع
رده
QH447
QH447
کتابخانه
محل استقرار
شابک
شابک
131514400X
شابک
1351386980
شابک
1351386999
شابک
1351387006
شابک
9781315144009
شابک
9781351386982
شابک
9781351386999
شابک
9781351387002
شابک اشتباه
1138500798
شابک اشتباه
9781138500792
عنوان و نام پديدآور
عنوان اصلي
Modeling the 3D conformation of genomes /
نام عام مواد
[Book]
نام نخستين پديدآور
edited by Guido Tiana, Luca Giorgetti.
وضعیت نشر و پخش و غیره
محل نشرو پخش و غیره
Boca Raton, FL :
نام ناشر، پخش کننده و غيره
CRC Press, Taylor & Francis Group,
تاریخ نشرو بخش و غیره
[2019]
تاریخ نشرو بخش و غیره
©2019
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
1 online resource
فروست
عنوان فروست
Series in computational biophysics
یادداشتهای مربوط به کتابنامه ، واژه نامه و نمایه های داخل اثر
متن يادداشت
Includes bibliographical references.
یادداشتهای مربوط به مندرجات
متن يادداشت
Cover; Half Title; Series Page; Title Page; Copyright Page; Contents; Preface; Editor; Contributors; 1: Job Dekker; 1.1 Introduction; 1.2 Chromosome Conformation Capture; 1.3 3C Variants to Obtain Genome-Scale and High-Resolution Chromatin Interaction Matrices; 1.4 Insights Obtained From Chromosome Interaction Data; 1.5 Dynamics and Cell-to-Cell Variation in Chromatin Interactions; 1.6 Polymer Models for Chromosome Folding; 1.7 Mechanisms of Chromosome Folding and Nuclear Organization; 1.8 Future Perspective; Acknowledgments; Part 1: First-Principles Models; 2: Cédric Vaillant and Daniel Jost
متن يادداشت
2.1 Introduction2.2 3D Chromatin Organization and Epigenomics; 2.3 Epigenome-Driven Phase Separation of Chromatin; 2.3.1 Block copolymer model; 2.3.2 Simulation methods; 2.3.3 Phase diagram of the model: Towards (micro) phase separation; 2.3.4 Comparison to experiments; 2.3.5 A dynamical, out-of-equilibrium and stochastic organization; 2.3.6 Relation to other approaches; 2.4 Role of 3D Organization in Epigenome Stability; 2.4.1 The "Nano-Reactor" hypothesis; 2.4.2 Epigenomic 1D-3D positive feedback; 2.4.3 The living chromatin model; 2.4.4 Stability of one epigenomic domain
متن يادداشت
2.4.5 Stability of antagonistic epigenomic domains2.4.6 Towards a quantitative model; 2.5 Discussion and Perspectives; Acknowledgments; References; 3: Simona Bianco, Andrea M. Chiariello, Carlo Annunziatella, Andrea Esposito, Luca Fiorillo, AND Mario Nicodemi; 3.1 Introduction; 3.2. The Basic Features of the Strings AND Binders Switch (SBS) Model; 3.2.1 The strings and binders switch model; 3.2.2 The phase diagram of the SBS homopolymer; 3.2.3 A switch-like control of folding; 3.2.4 Critical exponents of the contact probability; 3.3. A Model of Chromatin Folding
متن يادداشت
3.3.1 The mixture model of chromatin3.3.2 Pattern formation (TADs) in the SBS block copolymer model; 3.4 The SBS Model of the Sox9 Locus in mESC; 3.4.1 Molecular nature of the binding domains; 3.5. Predicting the effects of mutations on genome 3D architecture; 3.6 Conclusions; Acknowledgments; References; 4: Leonid A. Mirny and Anton Goloborodko; 4.1 Introduction; 4.2 Physics of Loop Extrusion and Chromosome Organization; 4.2.1 Loop extrusion during mitosis; 4.2.2 Loop extrusion during interphase; 4.3 Elements of Polymer Simulations; Acknowledgments; References
متن يادداشت
5: C.A. Brackley, M.C. Pereira, J. Johnson, D. Michieletto, and D. Marenduzzo5.1 Hi-C Experiments: Compartments, Domains And Loops; 5.2 The Transcription Factor Model: The Bridging-Induced Attraction, Protein Clusters and Nuclear Bodies; 5.3 The Transcription Factor Model: The Bridging-Induced Attraction Drives Chromosome Conformation; 5.4 The Active and Diffusive Loop Extrusion Models; 5.5 Some Consequences of the TF and LE Models; Acknowledgments; 6: Fabrizio Benedetti, Dusan Racko, Julien Dorier, and Andrzej Stasiak; 6.1 Introduction
بدون عنوان
0
بدون عنوان
8
بدون عنوان
8
بدون عنوان
8
بدون عنوان
8
یادداشتهای مربوط به خلاصه یا چکیده
متن يادداشت
This book provides a timely summary of physical modeling approaches applied to biological datasets that describe conformational properties of chromosomes in the cell nucleus. Chapters explain how to convert raw experimental data into 3D conformations, and how to use models to better understand biophysical mechanisms that control chromosome conformation. The coverage ranges from introductory chapters to modeling aspects related to polymer physics, and data-driven models for genomic domains, the entire human genome, epigenome folding, chromosome structure and dynamics, and predicting 3D genome structure.
یادداشتهای مربوط به سفارشات
منبع سفارش / آدرس اشتراک
Ingram Content Group
منبع سفارش / آدرس اشتراک
Ingram Content Group
شماره انبار
9781351386999
شماره انبار
9781351387002
ویراست دیگر از اثر در قالب دیگر رسانه
عنوان
Modeling the 3D conformation of genomes.
شماره استاندارد بين المللي کتاب و موسيقي
9781138500792
عنوان اصلی به زبان دیگر
عنوان اصلي به زبان ديگر
Modeling the three-dimensional conformation of genomes
موضوع (اسم عام یاعبارت اسمی عام)
موضوع مستند نشده
Genomes-- Data processing.
موضوع مستند نشده
Genomics-- Technological innovations.
موضوع مستند نشده
Chromosome Structures.
موضوع مستند نشده
Datasets as Topic.
موضوع مستند نشده
Electronic Data Processing-- methods.
موضوع مستند نشده
Models, Genetic.
موضوع مستند نشده
Genomes-- Data processing.
موضوع مستند نشده
SCIENCE-- Biotechnology.
موضوع مستند نشده
SCIENCE-- Life Sciences-- Biochemistry.
موضوع مستند نشده
SCIENCE-- Life Sciences-- Biology-- General.
موضوع مستند نشده
SCIENCE-- Physics.
مقوله موضوعی
موضوع مستند نشده
PS
موضوع مستند نشده
SCI-- 007000
موضوع مستند نشده
SCI-- 008000
موضوع مستند نشده
SCI-- 010000
موضوع مستند نشده
SCI-- 055000
رده بندی ديویی
شماره
572
.
8/6
ويراست
23
رده بندی کنگره
شماره رده
QH447
نام شخص - (مسئولیت معنوی برابر )
مستند نام اشخاص تاييد نشده
Giorgetti, Luca
مستند نام اشخاص تاييد نشده
Tiana, G., (Guido)
مبدا اصلی
تاريخ عمليات
20200822162654.0
قواعد فهرست نويسي ( بخش توصيفي )
pn
دسترسی و محل الکترونیکی
نام الکترونيکي
مطالعه متن کتاب اطلاعات رکورد کتابشناسی
نوع ماده
[Book]
اطلاعات دسترسی رکورد
تكميل شده
Y
