مباحث این پایان نامه در سه باب تدوین شده است؛باب نخست، معانی لغوی و اصطلاحی تفسیر و تأویل،تفاوت تفسیر و تأویل و اقسام تفسیر شامل تفسیر به مأثور و تفسیر به رأی. باب دوم، در زمینه پیشینه تفسیرقرآن به قرآن، احادیث مربوط به تفسیر قرآن به قرآن،مفسران شیعه و اهل سنت و تفسیر قرآن به قرآن، قرآن چگونه خود را تفسیر می کند؟ نمونه ای از تفسیر قرآن به قرآن. باب سوم، به بررسی تفسیر موضوعی،اصطلاحات علوم قرآنی مربوط به تفسیر قرآن به قرآن و شیوه تفسیر علامه طباطبائی در المیزان.