نمایش منو
صفحه اصلی
جستجوی پیشرفته
فهرست کتابخانه ها
عنوان
#بررسی ترانس کریپتومهای زیتون (Olea europaea L.) با استفاده از نسل جدید توالییابی و توسعه نشانگرهای مولکولی EST-SSR
پدید آورنده
موضوع
رده
کتابخانه
كتابخانه مركزی و مركز اطلاع رسانی دانشگاه شاهد
محل استقرار
استان:
تهران
ـ شهر:
تهران
تماس با کتابخانه :
51214110
-
021
شناسگر مقاله
شناسگر مقاله
پ۴۶۲۲#
کد سيستم
#۴۲،S
عنوان و نام پديدآور
عنوان اصلي
#بررسی ترانس کریپتومهای زیتون (Olea europaea L.) با استفاده از نسل جدید توالییابی و توسعه نشانگرهای مولکولی EST-SSR
مشخصات ظاهری
نام خاص و کميت اثر
#دوازده، ۱۲۰ ص.: شکل، جدول
نام خاص و کميت اثر
1
یادداشتهای مربوط به نمایه ها، چکیده ها و منابع اثر
يادداشت هاي مربوط به نمايه ها، چکيده ها و منابع
#زیتون (Oleaeuropaea L.) یک محصول روغنی مهم است، اما اطلاعات ژنومی و ترانسصکریپتومی موجود برای این گیاه محدود است .این اطلاعات جهت آشکار ساختن مکانیزمصهای مولکولی بیوسنتز اسیدصهای چرب و توسعه نشانگرهای مولکولی ضروری میصباشد .در مجموع مقادیر کمی از نشانگرهای مولکولی بر پایهصی توالیصهای بیانی در زیتون، کارآمدی و صحت اصلاح ژنتیکی را محدود ساخته است .توالیصیابی ترانسصکریپتومی با کارآمدی بالا برای تولید یک پایگاه بزرگ از توالی صهای ترانس کریپتومی، جهت کشف ژن و توسعه نشانگرهای مولکولی ضروری است .در این تحقیق،ترانسصکریپتومصهای زیتون از میوهصی آن، با استفاده از تکنولوژی توالیصیابی دوطرفهIllumina ، توالیصیابی گشت .قرائت های خام فیلتر شده، به صورت تعداد کلی 32902 ،Unigene، با میانگین طول 789 جفت باز مونتاژ گردیدند .از این Unigene ها، 20821(63.28 ) شباهت معنی داری با پروتئین های موجود در پایگاه اطلاعاتی پروتئینی غیر تکراری NCBI داشتند5). -value < 10-(Eعلاوه برصاین، 587 Unigene با 519 ژن آرابیدوپسیس برپایه آنالیز BLASTx در منابع اطلاعاتی آرابیدوپسیس همولوژی نشان دادند (TAIR, Version 10).درصکل، 4459 Unigene به نشانگر SSR تبدیل شدندSSR). SSR-(ESTصهای دو نوکلئوتیدی بیشترین تکرار بودند (57.52، 2565) و به دنبال آن، SSR های سه نوکلئوتیدی ها (40.30،1797) ، چهار نوکلئوتیدی ها (1.27،57) ، شش نوکلئوتیدی ها (0.58، 26) و پنج نوکلئوتیدی ها (0.31، 14)قرارصدارند .غالبترین واحد تکراری AG/CT(45.11 ) و به دنبال آنAAG/CTT(12.92 ) ،AT/AT(8.98 ) ،AGG/CCT(8.29 ) ، و AC/GT(4.58 ) قرارصدارندSSR -. 39 ESTانتخاب گشته و جهت تکثیر و تعیین درجه چندصشکلی در خزانهصهای DNA ژنومی برای آنها پرایمر طراحی گشت .این مطالعه ثابت کرد که توالیصیابی دوطرفهIllumina ، یک رویکرد سریع و کارآمد و کم هزینه برای کشف ژن و توسعه نشانگرهای مولکولی در موجودات غیر مدل است .نتایج این پژوهش منبع جامعی از توالیصهای ترانس کریپتومی را برای تحقیقات ژنومی زیتون فراهمصآورد .
یادداشتهای مربوط به پایان نامه ها
کسي که مدرک را اعطا کرده
شاهد
زمان اعطا مدرک
۱۳۹۱
جزئيات پايان نامه و نوع درجه آن
دانشکده کشاورزی
نام شخص به منزله سر شناسه - (مسئولیت معنوی درجه اول )
عنصر شناسه اي
#فرهاد موحدی پویا
ساير عناصر نام
T
نام / عنوان به منزله شناسه افزوده
عنصر شناسه اي
#قاسم حسینی سالکده، مهرشاد زینالعابدینی
عنصر شناسه اي
#علیرضا قنبری، علیاصغر زینانلو
پیشنهاد / گزارش اشکال
×
پیشنهاد / گزارش اشکال
×
اخطار!
اطلاعات را با دقت وارد کنید
گزارش خطا
پیشنهاد