عنوان

توالی یابی تمام اگزومی در افراد وابسته به تزریق خون مداوم مشکوک به آنمی های نادر که عدم تشخیص دقیق مدیریت درمانی آنان را با چالش مواجه کرده است

Number

ط۱۳۲۶

.Language of Text, Soundtrack etc

فارسی

Title Proper

توالی یابی تمام اگزومی در افراد وابسته به تزریق خون مداوم مشکوک به آنمی های نادر که عدم تشخیص دقیق مدیریت درمانی آنان را با چالش مواجه کرده است

General Material Designation

[طرح‌های تحقیقاتی و پروژه‌ها]

First Statement of Responsibility

مریم نیشابوری

Subsequent Statement of Responsibility

آزیتا آذرکیوان

Place of Manufacture

علوم توان بخشی و سلامت اجتماعیUniversity of Social Welfare and Rehabilitation

Date of Manufacture

۱۴۰۰

Text of Note

در مطالعه حاضر با استفاده از توالی یابی کل اگزوم علل ژنتیکی کم خونی شدید وابسته به تزریق خون در چهارده خانواده ایرانی بررسی گردید. این پروژه موفق به شناسایی 9 واریانت (شامل دو واریانت قبلا گزارش نشده) در 5 ژن شناخته شده و مرتبط با کم خونی گردید. یافته ها شامل چهار واریانت در ژن PKLR مرتبط با نارسایی آنزیم پیروات کیناز، یک واریانت کسب جایگاه خاتمه زودرس در ژن SLC25A38 مرتبط با آنمی سیدروبلاستی ، یک واریانت بد معنی در ژن ADA2 مرتبط با نارسایی آنزیم آدنوزین د آمیناز، یک واریانت بد معنی در ژن PIEZO1 مرتبط با آنمی استوماتوسیتوزیس و دو واریانت بد معنی در ژن SEC23B مرتبط با آنمی دیس اریتروپوئتیک تیپ 2 اشاره کرد. در نتیجه ی این یافته ها واریانت توجیه کننده ی فنوتیپ بیماران در 57 درصد( 14/8 ) از خانواده ها شناسایی شد که شش مورد از این خانواده ها به تشخیص قطعی رسیدند. نتایج مطالعه ی جدید نقص آنزیمی پیروات کیناز، آنمی سیدروبلاستی و نقص آنزیمی آدنوزین د آمیناز را در تایید مطالعه ی قبلی در همین مرکز، بعنوان بیماریهای نادر خونی که در ایران بدون بهره جستن از توالی یابی تمام اگزومی ناشناخته باقی می مانند را معرفی کرد. علاوه بر این نتایج این تحقیق توانست طیف بیماریهای نادر خونی در جمعیت ایران را با شناسایی دو بیماری دیگر از جمله آنمی دیس اریتروپوئتیک تیپ 2 مرتبط با ژن SEC23B و آنمی استوماتوسیتوزیس مرتبط با ژن PIEZO گسترش دهد. نتایج این مطالعه لزوم بهینه سازی روش های هماتولوژیکی و بیوشیمیایی در کنار استفاده از توالی یابی تمام اگزومی را در راستای افزایش توانمندی تشخیص کم خونیهای کم یاب در کشور پیشنهاد می نماید. این مطالعات همچنین نشان می دهند که اگرچه توالی یابی تمام اگزومی روش تشخیصی بسیار قدرتمند می باشد، نمی تواند در صد در صد موارد به نتیجه برسد و بهره جویی از تکنیک های پیشرفته تر برای آنالیز داده های توالی یابی اگزومی برای بررسی CNV ، آنالیز مجدد داده ها بارعایت پروتوکول زمانی و همچینی استفاده از روش های دیگر همچون توالی یابی تمام ژنومی در موارد به تشخیص نرسیده ضروری می باشد.

Text of Note

In the present study, the genetic causes of severe transfusion-dependent anemia in fourteen Iranian families were investigated using whole exome sequencing (WES). Nine variants (including two previously unreported) were identified in 5 known genes related to anemia. These included four variants in PKLR gene associated with pyruvate kinase deficiency, a premature termination variant in SLC25A38 gene associated with sideroblastic anemia, a missense variant in ADA2 gene associated with adenosine deaminase deficiency, a missense variant in PIEZO1 gene, associated with stomatocytosis and two missense variants in SEC23B gene associated with type 2 erythropoietic anemia. With a detection rate of 57% (8 of14), diagnosis was concluded in six families. In accord with our previous investigation, pyruvate kinase deficiency, sideroblastic anemia and adenosine deaminase deficiency were shown as rare blood disorders that could remain unidentified in Iran without using WES. In addition, this study could expand the spectrum of rare blood diseases in the Iranian population by identifying two other diseases, including dyserythropoietic anemia type 2 associated with SEC23B and stomatocytosis associated with PIEZO1 genes.. The results of this study suggest the need for optimizing hematological and biochemical methods along with the use of whole exome sequencing to improve diagnosis of rare anemias in the country. It was also shown that although WES is a very powerful diagnostic method, it can’t succeed in 100% of the cases. Therefore, the use of more advanced techniques for the analysis of WES data is essential for detection of possible CNVs, re-analysis of data in accordance with the time protocol, use of other methods such as whole-genome sequencing and trio analysis in undiagnosed cases.

Parallel Title

Exome sequencing in blood transfusion dependent individuals suspected to rare types of anemia, who are faced with challenges in clinical management due to ambiguity in diagnosis

ADA2

نیشابوری، مریم

آذرکیوان، آزیتا

Country

ایران

Date of Transaction

20221024

D

XF

272498

a

Y