عنوان

بررسی تنوعات تعداد کپی های نوکلئوتیدی (CNV) در ژن های GATA4, NKX2-5, TBX5, CRELD, BMP4 در پنجاه فرد با ناهنجاری مادرزادی قلبی غیرسندرمیک تک گیر با استفاده از روش MLPA

Number

۳۰۸۸پ

.Language of Text, Soundtrack etc

فارسی

Title Proper

بررسی تنوعات تعداد کپی های نوکلئوتیدی (CNV) در ژن های GATA4, NKX2-5, TBX5, CRELD, BMP4 در پنجاه فرد با ناهنجاری مادرزادی قلبی غیرسندرمیک تک گیر با استفاده از روش MLPA

General Material Designation

[پایان نامه]

Parallel Title Proper

Investigation of copy number variation (CNV) in GATA4, NKX2.5,TBX5, CRELD and BMP4 genes in 50 patients with non syndromic sporadic congenital heart defect using MLPA technique

Name of Publisher, Distributor, etc.

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation

Date of Publication, Distribution, etc.

۱۳۹۷

Specific Material Designation and Extent of Item

۹۶ص.

Dissertation or thesis details and type of degree

کارشناسی ارشد

Discipline of degree

ژنتیک انسانیHuman genetic

Date of degree

۱۳۹۷/۰۷/۲۶

Text of Note

مقدمه: بیماری مادرزادی قلبی یکی از شایع¬ترین دلایل نقص تولد در نوزادی است. موفقیت¬های حاصل در پروسه درمان قلبی این افراد، سبب افزایش طول عمر و در نتیجه گسترش واریانت¬¬های ژنتیکی که همراه با نقایص قلبی است، در جمعیت شده است. اگرچه هنوز علت¬های دقیق و ژن¬های دخیلی که در اختلالات تکاملی قلب نقش دارند، در ابهام است، وقوع تنوعات تعداد کپی (CNV)در ژن¬های حساس به دوز از جمله ژن¬های دخیل در پروسه انتقال پیام و ژن¬های کدکننده فاکتورهای رونویسی قلب در بروز CHD غیر سندرمیک به اثبات رسیده است. اخیراً محققان، CNV پاتوژن را در تعدادی از بیماران CHD، شناسایی کرده¬اند. هدف: مطالعه حاضر به بررسی نقش CNV در پنج ژن GATA4, TBX5, NKX2-5, BMP4, CRELD و ناحیه 22q11.2 که دخیل در بیماری¬زایی CHD هستند، در 50 فرد بیمار غیر سندرمیک تک گیر پرداخته است. روش اجرا: تکنیک MLPA روش مولکولی برای تشخیص CNV ها در لوکوس های از پیش تعیین شده است. کیت MLPA استفاده شده MLPA P311 B1بود که ژن های GATA4, TBX5, NKX2-5, BMP4, CRELD و ناحیه 22q11.2 را پوشش می داد. آزمایش MLPA برای والدین بیماران مبتلا به نتایج غیر طبیعی انجام شد تا وضعیت ارثی CNV مشخص گردد. میانگین سن بیماران18ماه (2 ماه-15 سال) بود. نتایج: نتایج ما نشان می داد تمام سیگنال¬های MLPA برای اگزون های مورد بررسی پنج ژن ,GATA4 TBX5, NKX2-5, BMP4, CRELD برای تمام بیماران در محدوده نرمال (0.7-1.3) است، اما برای ناحیه 22q11.2 سه بیمار با عدم تعادل برای این منطقه (6%) پیدا کردیم. حذف 22q11.2 در دو بیمار وجود داشت که یک بیمار فنوتیپ¬ بالینی TOF و دیگری PA,VSD,MAPCAs را نشان می داد و یک اضافه¬شدگی در ناحیه 22q11.2 برای بیمار با فنوتیپ PDA یافت شد. همه CNV ها تک گیر بودند.نتیجه گیری: تشخیص عدم تعادل ژنوم در 6% از بیماران تایید می کند که CNVهای مجدد با CHD غیر سندرمی مرتبط هستند. مطالعه MLPA برای ناحیه 22q11.2 باید در بیماران مبتلا به ضایعات قلبی به ویژه نارسایی های کاناترونیک، برای ارایه مشاوره ژنتیکی مناسب با برآورد دقیق تر از خطر عود و در نهایت تشخیص پیش از تولد در خانواده های تحت تاثیر قرار گیرد. نوع اختلالات ژنتیکی همچنین می تواند به درمان دقیق تر بیماران و همچنین مدیریت بهتر آنها کمک کند. تشخیص به هنگام آنها باعث بهبود روند درمان و پروگنوز این بیماران می¬شود. با توجه به اطلاعات ما این مطالعه اولیــــن بار است که در جمعیت ایران انجام شده است. واژگان کلیدی: بیماری مادرزادی قلبی غیرسندرومی و اسپورادیک، تنوعات تعداد کپی، MLPA، جمعیت

Text of Note

Background: Congenital Heart Disease (CHD) is one of the common causes of birth defects in newborns. The successive progresses in cardiac therapeutic strategies, have led to increase in life expectancy of these patients. This can lead to an increase in genetic variants associated with congenital heart defects in the population. However, the primary causes of disrupted cardiac development have remained elusive. The occurrence of Copy Number Variations (CNVs) in dosage-sensitive genes such as genes involved in signal transduction pathways and those encoding for cardiac transcription factors have been found as one of the genetic causes of non-syndromic CHD. Lately researches have detected potentially pathogenic copy number variations (CNV) in a proportion of patients with CHD.Objective:The present case–control study, evaluated whether CNV in the GATA4 and NKX2-5 and TBX-5 and CRELD and BMP4 genes and 22q11.2 region contribute to the pathogenesis of non-syndromic CHD in 50 patients with sporadic non-syndromic CHD.Methods: Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA) technique as a molecular method to identify CNVs in predefined loci was used. The MLPA kit used was P311-B1. Median age of the patients at the time of study was 18 months (2m‐15y).Results: Our results indicate that MLPA picks for GATA4, NKX2-5, TBX-5, CRELD and BMP4 genes are within the normal range values (0.7-1.3) for all the examined exons in the patients. But for 22q11.2 region, we found three patients with imbalances for this region (6%).The deletion of 22q11.2 was present in two patients, where One patient had TOF and the other had VSD/ PA/ MAPCAs. A duplication of 22q11.2 was detected in one patient with PDA.All the CNVs were de novo.Conclusion: The identification of genomic imbalances in 6% of the patients confirms that recurrent CNVs are associated with non-syndromic CHD. Chromosome 22q11.2 MLPA study should be considered in patients with cardiac lesions particularly conotruncal abnormality to provide an appropriate genetic counseling with more accurate estimation of recurrence risk and ultimately prenatal diagnosis in affected families.The type of genetic abnormality can also contribute to a more accurate treatment of the patients and hence their better management. To our knowledge, this research study was done in Iranian cardiac patients for the first time. KeywordsSporadic Non-Syndromic CHD, CNV, MLPA, Iranian patients

MLPA

خاکساری,سهیلا

KHaksari, Soheila

بهجتی,فرخنده

آقایی مقدم,احسان

Country

ایران

Agency

دانشگاه علوم توان بخشی و سلامت اجتماعی

D

TF

92029

a

Y