عنوان

شناسایی واریانت های شناخته شده و جدید رتینیت پیگمنتوزای اتوزومی مغلوب غیر سندرمی در ۲۵ خانواده با حداقل ۲ بیمار ارجاع شده از استان یزد به روش توالی یابی کل اگزوم

Country Code

IR

Number

۲۹۲۷پ

.Language of Text, Soundtrack etc

فارسی

Country of publication

IR

Title Proper

شناسایی واریانت های شناخته شده و جدید رتینیت پیگمنتوزای اتوزومی مغلوب غیر سندرمی در ۲۵ خانواده با حداقل ۲ بیمار ارجاع شده از استان یزد به روش توالی یابی کل اگزوم

General Material Designation

[پایان‌نامه]

Parallel Title Proper

Investigation of Genetic Causes of Familial Non-Syndromic Retinitis Pigmentosa in 25 Iranian families with 2 affected family members using Whole Exome Sequencing (WES) Technique

Name of Publisher, Distributor, etc.

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))

Date of Publication, Distribution, etc.

، ۱۳۹۸

Specific Material Designation and Extent of Item

و،۲۴۹ص.

Text of Note

پیوست

Text of Note

چاپی

Dissertation or thesis details and type of degree

دکترا

Discipline of degree

ژنتیک پزشکی Medical Genetics

Date of degree

۱۳۹۸/۰۶/۳۱

Body granting the degree

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))

Text of Note

مقدمه:بیماری های ارثی شبکیه چشم، باعث بروز از کار افتادگی قابل توجه بینایی به ویژه در دوران کودکی می گردند .رویکرد تشخیصی کلاسیک به دیستروفی های شبکیه شامل مرتبط ساختن الگوی فوندوس( ظاهر مورفولوژیکی) و الگوی توارثی با نتایج آزمایش الکتروفیزیولوژیک مانند الکترورتینوگرام(ERG) ، الکترواکولوگرافی(EOG) ، تطبیق تاریکی و آزمایش میدان دید می باشد .با توجه به مشکل در تعیین دقیق تشخیص بالینی به دلیل این واقعیت که بسیاری از بیماری های شبکیه دارای تظاهرات فوندوس مشابه و یا ناهنجاری های غیر اختصاصی( ناهمگنی فنوتیپی) هستند، استفاده از آزمایشات ژنتیک مولکولی به لحاظ تعیین تشخیص دقیق بسیار مهم است .برای تعیین قدرت WES در شناسایی ژن های نهفته برای رتینیت پیگمنتوزا(RP) ، این مطالعه نتایج WES را در ۲۵ خانواده خویشاوند با دیستروفی های ارثی شبکیه (RD) نمایان می کند، در حالی که تشخیص قطعی برای بیماران وجود نداشته است .هدف :هدف اصلی این مطالعه شناسایی ژن ها و واریانت های پاتوژن مسئول بروز بیماری RP و ارتباط آن با تشخیص بالینی است .موفقیت در شناسایی علل بیماری های ارثی شبکیه دارای پیامدهای فراوانی است از جمله درک بهتر مبانی بیولوژیکی بینایی و آگاهی به فرآیندهای آسیب شناسی شبکیه .روش اجرا :در این مطالعه، ۲۵ خانواده خویشاوند غیر مرتبط ایرانی با حداقل دو فرد مبتلا به RP غیر سندرومی اتوزومال مغلوب وارد شدند .برای بررسی از WES و به دنبال آن توالی یابی Sanger برای شناسایی جهش های ژنی نهفته مسبب RP غیر سندرمی استفاده شد .نتایج :این مطالعه جهش های بیماری زا را برای همه ۲۵ خانواده( ۱۰۰) با استفاده از WES نمایان کرد .این پروژه موفق به شناسایی یک ژن جدید در دو خانواده غیر مرتبط( یک واریانت بدمعنی محتملا پاتوژن در ژنPROS۱) و ۲۰ واریانت( ۱۱ واریانت جدید و ۹ واریانت گزارش شده) در ۱۴ ژن شناخته شده و مرتبط با RP گردیده است .از این جمله می توان به شناسایی ۵ واریانت بی معنی در ۶ خانواده با درگیری ژن هایRPE ۶۵،CERKL ،RPGRIP ۱،AIPL ۱ و( MERTK یک واریانت مشترک در ژن CERKL در ۲ خانواده)، شناسایی ۲ واریانت تغییر چارچوب در ۲ خانواده با درگیری ژن هایABCA ۴ وRPE ۶۵، ۲ واریانت تغییر پیرایش در ۲ خانواده با درگیری ژن هایABCA ۴ وEYS ، ۱۲ واریانت بدمعنی در ۱۵ خانواده با درگیری ژن هایPROS ۱( یک واریانت در ۲ خانواده)،AIPL ۱( یک واریانت در ۲ خانواده)،RDH ۱۲( ۲ واریانت در ۲ خانواده)،ABCA ۴،CNGB ۱( یک واریانت در ۲ خانواده)،CNGA ۱،MFSD ۸( ۲ واریانت در ۲ خانواده)،POMGNT ۱،CDHR ۱وCRB ۱ اشاره کرد .نتیجه گیری : این مطالعه از ناهمگنی ژنتیکی RP غیر سندرومی در بیماران ایرانی حمایت می کند و فرصتی برای نشان دادن اثربخشی WES در شناسایی جهش های پاتوژن در بیماران مبتلا به RP غیر سندرومی متولد شده در والدین خویشاوند است .کلمات کلیدی :رتینیت پیگمنتوزا، خویشاوندی، غیر سندرمی، توالی یابی کامل اگزوم WES))

Text of Note

Inherited diseases of the retina cause significant visual morbidity especially during early childhood. The classical diagnostic approach to retinal dystrophies is to correlate the fundus pattern (morphological appearance) and inheritance pattern with the results of electrophysiological and psychophysical tests such as the electroretinogram (ERG), electrooculogram (EOG), dark adaptation, and visual field test. Given the difficulty in accurately establishing the clinical diagnosis due to the fact that many retinal diseases have similar fundus appearances or nonspecific abnormalities (phenotypic heterogeneity), application of molecular genetic testing seems to be crucial in terms of precise diagnosis. To determine the power of WES in identification of underlying genes for retinitis pigmentosa (RP), this perspective demonstrates the results of WES in 25 consanguineous families with hereditary retinal dystrophies (RD), while there were no clear-cut diagnosis established for the patients. Objective The goal of this perspective is to address the application of the molecular diagnosis of RP and its relevance to clinical practice. Success in identifying the causes of inherited retinal diseases has many implications, including a better understanding of the biological basis of vision and insights into the processes involved in retinal pathology. Methods 25 Iranian unrelated consanguineous families with at least two affected individuals suffering from autosomal recessive non-syndromic RP were recruited in our study. We used WES, followed by the Sanger sequencing to identify the underlying gene mutations causing non-syndromic RP. Results Our study revealed disease-causing mutations for all 25 families studied (100 ) using WES. We identified a putative novel gene for two unrelated families (a missense likely pathogenic variant in PROS1 gene) and 20 variants in 14 known RP genes, mostly not reported previously (11 novel and 9 reported variants). These mutations included 5 stop-gain mutations in AIPL1, RPGRIP1, RPE65, MERTK and CERKL genes for 6 families; 2 splicing mutations in EYS and ABCA4 in 2 families; 2 frameshift mutations in RPE65 and ABCA4 in 2 families; and 12 missense mutations in PROS1, AIPL1, CNGB1, CNGA1, CRB1, RDH12, MFSD8, CDHR1, ABCA4 and POMGNT1 for 15 families. Conclusion This study supports the genetic heterogeneity of non-syndromic arRP in Iranian patients, and provides an opportunity to show the effectiveness of WES in the identification of pathogenic mutations among patients with non-syndromic arRP born to consanguineous parents. Keywords: Retinitis Pigmentosa, Whole Exome Sequencing

ba

Parallel Title

Investigation of Genetic Causes of Familial Non-Syndromic Retinitis Pigmentosa in 25 Iranian families with 2 affected family members using Whole Exome Sequencing (WES) Technique

Retinitis Pigmentosa

Subject Category Entry Element Text

رتینیت پیگمنتوزا

Subject Category Entry Element Text

Retinitis Pigmentosa

بوشهری، عطا

Bushehri, Ata

خرم خورشید، حمیدرضا

علوی، آفاق

Country

ایران

Agency

دانشگاه علوم توان بخشی و سلامت اجتماعی

Host name

2927t.pdf

Access number

محرمانه

Compression information

محرمانه

Date and Hour of Consultation and Access

2927t.pdf

Bits per second

8914708

Contact for access assistance

مرجع

Electronic Format Type

متن

File size

0

Record control number

۷۲۹۲پ

Tag of the Source Format Field

محل نگهداری: دانشگاه علوم بهزیستی و توانبخشی

نمایه‌سازی قبلی

چاپی-الکترونیکی

TF

1

a

Y