عنوان

شناسایی واریانت های نادر ژنی در پنج خانواده مبتلا به اختلال طیف اوتیسم فامیلی در قومیت فارس با استفاده از روش توالی یابی کل اگزوم

Country Code

IR

Number

۲۸۷۶پ

.Language of Text, Soundtrack etc

فارسی

Country of publication

IR

Title Proper

شناسایی واریانت های نادر ژنی در پنج خانواده مبتلا به اختلال طیف اوتیسم فامیلی در قومیت فارس با استفاده از روش توالی یابی کل اگزوم

General Material Designation

[پایان‌نامه]

Parallel Title Proper

Identification of rare gene variants in five families with Familial Autism Spectrum Disorder in Fars ethnicity using Whole Exome Sequencing technique

Name of Publisher, Distributor, etc.

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))

Date of Publication, Distribution, etc.

، ۱۳۹۷

Specific Material Designation and Extent of Item

ط،۱۴۵ص.

Text of Note

پیوست

Text of Note

چاپی

Dissertation or thesis details and type of degree

کارشناسی ارشد

Discipline of degree

ژنتیک انسانی Human Genetics

Date of degree

۱۳۹۷/۰۷/۱۵

Body granting the degree

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation))

Text of Note

اتیسم از جمله اختلالات پیچیده رشد عصبی است که هم از لحاظ ژنتیکی و هم از لحاظ فنوتیپی هتروژن است .عوامل ژنتیکی از عوامل موثر در بروز این اختلال است .اخیرا تلاش های بسیاری بر روی خانواده های دارای چند بیمار مبتلا با استفاده از تکنیک توالی یابی کل اگزوم انجام شده است .ما به منظور شناسایی واریانت ها نادر ژنی ارثی اختلال طیف اتیسم، از تکنیک توالی یابی کل اگزوم بر روی ۵ خانواده دارای اتیسم خانوادگی استفاده کردیم .هدف هدف از این پروژه شناسایی ژن ها و واریانت های وراثتی مسئول بروز اختلال طیف اتیسم با ۵ خانواده با قومیت فارس با استفاده از توالی یابی کل اگزوم است .مواد و روش ها :در این مطالعه ۵ خانواده دارای دو فرد مبتلا به اختلال طیف اتیسم در نظر گرفته شد DNA .ژنومی برای تعیین توالی کل اگزوم مورد استفاده قرار گرفت .پس از آنالیز نهایی لیستی از ژن هایی که از نظر بیولوژیکی مانند عملکرد مغزی، رشد مغزی و اختلالات نورولوژیکی شناخته شده دارای اهمیت بودند مورد بررسی قرار گرفتند .تایید واریانت های احتمالی توسط روش توالی یابی سنگر به انجام رسید .نتیجه گیری :به طور کلی ما دو ژن کاندید اختلال طیف اتیسم(EFCAB ۵ وALDH ۵A۱) را که قبلا در مطالعات قبلی با اختلال طیف اتیسم همراهی داشتند را شناسایی کردیم .در مطالعه ما، یک واریانت جدید در ژنALDH ۵A۱ که منجر به اختلال SSADH می شود و همچنین یک جهش مخرب در ژنEFCAB ۵ را در خانواده ای دیگر شناسایی کردیم .در نتیجه داده های ما نشان می دهند که جهش های مخرب ارثی در خانواده هایی که دو فرد مبتلا دارند نقش مهمی در بروز این اختلال دارند . پیشنهاد می شود که این تکنیک می تواند در تشخیص اختلالات پیچیده دیگر که فرم های خانوادگی دارند نقش مهمی را ایفا کند .کلید واژه :اختلال طیف اتیسم، توالی یابی کل اگزوم،EFCAB ۵،ALDH ۵A۱

Text of Note

Autism spectrum disorder (ASD) is a complex neurodevelopmental disorder with genetic and clinical heterogeneity. Heritability is estimated as high as 90 for ASD with a recently reported compilation of 800 clinically relevant candidate and known genes. Family and twin studies provide strong evidence that genetic factors have a major role in the etiology of this disease. However, even the high mutation rate observed (approximately one de novo single-nucleotide variant in the exome per autistic child) cannot fully explain the etiology of the disorder, in which additive effects of several gene mutations are expected under a multihit model of inheritance. Recently, whole exome sequencing (WES) efforts have focused mainly on rare inherited variants in multiplex families. we performed exome sequencing of 5 autism multiplex families with the aim of investigating the role of rare variants that are inherited in the affected sibs. Objective The principal aim of this project is to identify ASD genes and variants responsible for familial ASD in 5 Iranian families in Fars enthnicity using Whole Exome Sequencing (WES). Methods We considered 5 families, each with 2 individuals affected by ASD. Participants were diagnosed according to Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders, 5th Edition (DSM-V) criteria. Diagnoses were made by experienced child psychiatrists. Genomic DNA was used for whole exome sequencing. Exome libraries were prepared using the SureSelect Human All Exon V6 Kit (Agilent) and sequenced using the HiSeq4000 system (Illumina). We narrowed the variant list to 10 to 20 genes and screened for biological significance including neural development, function and known neurological disorders. To validate variations identified by WES, Sanger sequencing was performed in all five family members. Finally, we excluded variations present in unaffected sibling. Conclusion In summary, we identifed two candidate genes for ASD ( ALDH5A1 and EFCAB5) which have been previously implicated in other studies, or have a strong biological argument for their relevance. In the present study, one novel mutation identified in ALDH5A1 gene that caused SSADH deficiency and One truncating variant (EFCAB5 p.S307X) identified in other family. suggesting that this rare truncating variation may have a role in the genetic etiology of ASD. To our knowledge, this is the first time that this variations have been associated with ASD. In conclusion, our data suggest that inherited disrupting mutations in multiplex families may have a major role in the etiology of ASD. This approach would be useful in other complex disorders where familial forms exist. Keywords autism spectrum disorder; exome sequencing; multiplex families; novel candidate genes; rare genetic variants; truncating mutations

ba

Parallel Title

Identification of rare gene variants in five families with Familial Autism Spectrum Disorder in Fars ethnicity using Whole Exome Sequencing technique

autism spectrum disorder

Subject Category Entry Element Text

اختلال طیف اتیسم

Subject Category Entry Element Text

autism spectrum disorder

فتاحی، مهشید

Fattahi, Mahshid

شفقتی، یوسف

علوی، آفاق

بهجتی، فرخنده

Country

ایران

Agency

دانشگاه علوم توان بخشی و سلامت اجتماعی

Host name

2876t.pdf

Access number

محرمانه

Compression information

محرمانه

Date and Hour of Consultation and Access

2876t.pdf

Bits per second

4739819

Contact for access assistance

مرجع

Electronic Format Type

متن

File size

0

Record control number

۶۷۸۲پ

Tag of the Source Format Field

محل نگهداری: دانشگاه علوم بهزیستی و توانبخشی

نمایه‌سازی قبلی

چاپی-الکترونیکی

TF

1

a

Y