بررسی وضعیت عدم تعادل ژنومی در سی بیمار واجد ناهنجاری های چندگانه مادرزادی با کاریوتایپ نرمال با استفاده از روشCGH - array
General Material Designation
[پایاننامه]
Parallel Title Proper
Investigation of genomic imbalances in 30 patients with multiple congenital abnormalities and normal karyotype using array-CGH technique
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation Sciences))
Date of Publication, Distribution, etc.
، ۱۳۹۷
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
و،۱۱۴ص.
NOTES PERTAINING TO PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC.
Text of Note
چاپی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
دکترا
Discipline of degree
ژنتیک پزشکی Genetics))
Date of degree
۱۳۹۷/۱۰/۰۵
Body granting the degree
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation Sciences))
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
ناهنجاریهای مادرزادی ماژور آنومالیهای ساختاری یا عملکردی حین تولد که ناتوانی های طولانی مدت را سبب می شوند و تأثیرات نامطلوبی بر زندگی افراد، خانواده ها، سیستم های بهداشتی- درمانی و جوامع می گذارند .ناهنجاریهای مادرزادی ماژور ۳ درصد نوزادان تازه به دنیا آمده را مبتلا می کنند و ناهنجاریهای چندگانه مادرزادی (MCA) در ۱ درصد نوزادان دیده می شود .تقریبا ۲۰ درصد نقایص مادرزادی ناشی از علل کروموزومی و ژنتیکی هستند و تغییرات تعداد کپی (CNV) حدود ۱۵ درصد اتیولوژی ناهنجاریهای مادرزادی را تشکیل می دهند .با در نظر گرفتن این حقیقت که ناهنجاریهای مادرزادی عامل ۲۰ درصد و ۱۰ درصد مرگ و میر نوزادان به ترتیب در ایران و جهان هستند، این مطالعه برای بررسی نقشCNV ها در ناهنجاریهای چندگانه مادرزادی در برخی بیماران ایرانی انجام گرفت .در مرحله اول، کاریوتایپ برای همه بیماران و MLPA برای ۲۰ بیمار براساس تشخیص بالینی برای برسی از نظر ریزحذفها و ریزتکرارها انجام شد .در مرحله بعد، ۳۰ بیمار براساس انتخاب و با استفاده از تکنیک array CGH از نظر CNV بررسی شدند و با آنالیز محتوای ژنتیکی نواحی دارای حذف یا دوپلیکاسیون، احتمال نقشCNV های یافت شده در بروز ناهنجاریها در کودکان مشخص شد .در مطالعه سیتوژنتیک کلاسیک در ۳ بیمار( ۶ درصد) ناهنجاری کروموزومی مشاهده شد و در بررسی از طریق تکنیک MLPA در ۴ بیمار( ۸ درصد ( CNVژنومی شناسایی گردید .قدرت شناسایی تغییرات ژنومی با استفاده از این دو تکنیک ۱۴درصد بود .در بررسی array CGH از میان ۳۰ بیمار ۴ بیمار CNV معنادار نشان دادند که معادل قدرت تشخیص ۱۳/۳ درصد است .برای CNV های شناسایی شده مطالعه ژنوتیپ-فنوتیپ انجام گرفت و یافته ها با نتایج سایر مطالعات مقایسه شد .در نهایت لوکوس های پاتوژن از نظر محتویات ژنی مورد بررسی قرار گرفتند و ژن های کاندید مشخص شدند .در این مطالعه، یک مورد همراهی دوپلیکاسیونXp ۳۳.۲۲ با سندرم حذف ۱q۴۳q۴۴ و همچنین حذف ۶p۳۲.۲۱p۳۳.۲۱، حذف ۱q۱.۲۱ و حذفXp ۳۱.۲۲p ۳۲.۲۲ معرفی شدند .این مطالعه که جزو اولین مطالعات در نوع خود در ایران است، نشان دهنده اهمیت استفاده از بررسی CNV به عنوان روش تشخیصی به ویژه در زمانی است که بیمار با ناهنجاریهای چندگانه مادرزادی مراجعه میکند .کلمات کلیدی :بیماران ایرانی، ناهنجاری های چندگانه مادرزادی، ناهنجاری های کروموزومی، هیبریداسیون مقایسه ای ژنومی با آرایه، وب وا اق
Text of Note
Major birth defects are inborn structural or functional anomalies with long-term disability and adverse impacts on individuals, families, health-care systems, and societies. Major congenital anomlies affect 3 of all newborns and 1 of newborns have multiple defects. Approximately, 20 percent of birth defects are due to chromosomal and genetic conditions and copy number variations (CNV) comprise about 15 of the etiology. Inspired by the fact that neonatal deaths are caused by birth defects in about 20 and 10 of cases in Iran and worldwide respectively, the researchers set the present study to unravel the role of CNV in multiple congenital abnormalities in some Iranian patients. In this descriptive study, 50 sporadic patients with Multiple Congenital Anomalies (MCA) were selected. Conventional karyotyping was performed for all patients and MLPA was utilized for 20 patients according to the clinical diagnosis to rule out microdeletion/microduplication(s). Then we studied 30 patients with MCA and their parents using array CGH techniques to detect pathogenic CNVs. Genetic content of copy number losses and gains were analysed to detect the clinical importance of the CNVs. Chromosome abnormality was detected in 3 patients (6 ) and microdeletion/microduplication(s) were found in 4 patients (8 ) using MLPA technique. Totally our detection rate for fifty patients using both Karyotyping and MLPA techniques was 14 . Four out of 30 patients (13.3 ), using array CGH showed significant pathogenic CNVs. We performed genotype-phenotype analysis and compared our results with the other studies. In the present study, we reported a patient with a novel association of an Xp22.33 duplication with 1q43q44 deletion syndrome. Also, we reported 6p21.32p21.33 deletion, 1q21.1 deletion, and Xp22.31 p22.32 deletion, each in one patient. The present study is one of the first studies to investigate CNV in Iranian patients with MCA. Key words: Iranian Patients, Multiple Congenital Abnormalities, Chromosomal Abnormalities, Array Comparative Genomic Hybridization, Multiplex Ligation-Dependent Probe Amplification
ba
PARALLEL TITLE PROPER
Parallel Title
Investigation of genomic imbalances in 30 patients with multiple congenital abnormalities and normal karyotype using array-CGH technique