عنوان

مطالعه تنوع تعداد کپی ژنومی در بیماران ایرانی مبتلا به اوتیسم و ناتوانی ذهنی با علت ناشناخته با استفاده از تکنیک‌صصهای MLPA وCGH- array

Country Code

IR

Number

۲۳۵۰پ

.Language of Text, Soundtrack etc

فارسی

Country of publication

IR

Title Proper

مطالعه تنوع تعداد کپی ژنومی در بیماران ایرانی مبتلا به اوتیسم و ناتوانی ذهنی با علت ناشناخته با استفاده از تکنیک‌صصهای MLPA وCGH- array

General Material Designation

[پایان‌نامه]

Parallel Title Proper

Evaluation of copy number variations in Iranian patients with Idiopathic Autism and Intellectual disability using MLPA and array-CGH

Name of Publisher, Distributor, etc.

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation Sciences))

Date of Publication, Distribution, etc.

، ۱۳۹۵

Specific Material Designation and Extent of Item

۱۷۱ص

Text of Note

چاپی

Dissertation or thesis details and type of degree

دکترا

Discipline of degree

ژنتیک Genetics

Date of degree

۱۳۹۵/۰۹/۳۰

Body granting the degree

علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation Sciences))

Text of Note

اوتیسم با شیوع 1 در 68 از مشکلات عمده دوران کودکی در جوامع مختلف است معهذا تنها در حدود30 - 40بیماران می توان علت بیماری را مشخص نمود .با وجود هتروژنیتی گسترده اتیولوژیک این بیماری، ژنتیک بعنوان اصلی‌صترین عامل دخالت کننده در بروز اوتیسم شناخته شده است .ازجمله مهمترین علل شناخته‌صشده ژنتیک، تنوع در تعداد کپی ژنومی (CNVs) است که با فراوانی10 - 15در بیماران اوتیسم و بیش از 20 زمانیکه اوتیسم همراه با علائم جانبی باشد، سهم بسزایی را در پاتوژنز این بیماری بخود اختصاص می‌صدهد .در همین راستا، در این مطالعه 50 بیمار اسپورادیک مبتلا به اوتیسم، ناتوانی ذهنی و حداقل یک علامت اضافی ابتدا مورد مطالعه سیتوژنتیک و سپس با استفاده از کیت‌صهای MLPA ساب-تلومریک و کیت‌صص‍ های MLPA اختصاصی اوتیسم مورد بررسی قرار گرفتند .در مرحله بعد، 15 بیمار بر اساس علائم جانبی همراه با اوتیسم انتخاب و با استفاده از تکنیک array CGH از نظر CNV بررسی شدند و با آنالیز محتوای ژنتیکی نواحی دارای حذف یا دوپلیکاسیون، احتمال نقش CNV های یافت شده در بروز اوتیسم در کودکان مشخص شد .در مطالعه سیتوژنتیک در 2 بیمار ناهنجاری کروموزومی مشاهده شد و در بررسی از طریق تکنیک MLPA در 5 بیمار CNV ژنومی شناسایی گردید .با احتساب یک مورد مشترک میان دو تکنیک، قدرت شناسایی تغییرات ژنومی با استفاده از این دو تکنیک 12 بود .در بررسی aCGH از میان 15 بیمار 6 بیمار CNV معنادار نشان دادند که معادل قدرت تشخیص 40 درصد است .برای CNV های شناسایی شده مطالعه ژنوتیپ-فنوتیپ انجام گرفت و یافته ها با نتایج سایر مطالعات مقایسه شد .نهایتا لکوس های پاتوژن از نظر محتویات ژنی مورد بررسی قرار گرفتند و ژن های کاندید معرفی شدند .در این پژوهش موفق به شناسایی و گزارش یک سندرم دوپلیکاسیون جدید) دوپلیکاسیون 10q21.2q21.3) شدیم و شاهدی جدید برای درگیری ژن VIPR2 در بروز اوتیسم ارائه نمودیم .بعلاوه اولین زن ناقل حذف ژن های SLC6A8 و) BCAP31 در موقعیت Xq28) را توصیف کردیم .این مطالعه که اولین مطالعه در نوع خود در ایران است نشان دهنده اهمیت استفاده از بررسی CNV بعنوان روش تشخیصی بویژه در زمانی است که بیمار اوتیسم بهمراه ناتوانی ذهنی و دیگر علائم جانبی مراجعه میکند .کلمات کلیدی :اوتیسم، تغییر در کپی ژنومی(CNV) ،MLPA ، array

Text of Note

Autism is a common neurodevelopmental disorder estimated to affect 1 in 68 children. Although ASD is one of the leading problems of children in different populations, the etiological diagnosis is possible only in about 30-40 of affected patients. ASD has a heterogenous etiology with the genetic factors as the major cause. Many studies have shown the role of copy number variants (CNVs) as a major contributor in the etiology of autism with the overall detection rate of about 10-15 , and over 20 when syndromic forms of autism exist. In the current project, we studied 50 sporadic patients with autism, intellectual disability and at least one additional feature using karyotyping and MLPA kits (subtelomeric and autism kits). Then we studied 15 patients with autism and their parents using array CGH techniques to detect pathogenic CNVs. Genetic content of copy number losses and gains were analysed to detect the clinical importance of the CNVs. Chromosome abnormality was detected in two patients (4 ) and copy number variations (deletion/duplication) were found in 4 patients using MLPA technique. Totally our detection rate using both cytogenetic and MLPA techniques was 10 . 6 out of 15 patients (40 ) showed significant CNVs including pathogenic and likely pathogenic. We performed genotype-phenotype analysis and compared our results with the other studies. Finally, we investigated the pathogen loci to detect candidate genes causing the disease. We report a novel gene duplication syndrome (10q21.2q21.3 microduplication) and present a new evidence for VIPR2 duplication, as a candidate gene for autism. Furthermore, we describe the first manifesting carrier female with deletion of SLC6A8 and BCAP31 genes on Xq28. This study is performed in Iran for the first time. We recommend to survey patients with autism and additional feature for CNVs. Keywords: Autism, CNV, array CGH, MLPA

ba

Parallel Title

Evaluation of copy number variations in Iranian patients with Idiopathic Autism and Intellectual disability using MLPA and array-CGH

قاسمی فیروزآبادی، ساغر

Ghasemi Firouzabadi,Saghar

نجم آبادی، حسین

روشنک، وامقی

Country

ایران

Agency

دانشگاه علوم توان بخشی و سلامت اجتماعی

Host name

2350t.pdf

Access number

محرمانه

Compression information

محرمانه

Date and Hour of Consultation and Access

2350t.pdf

Bits per second

3500715

Contact for access assistance

مرجع

Electronic Format Type

متن

File size

0

Record control number

۰۵۳۲پ

Tag of the Source Format Field

محل نگهداری: دانشگاه علوم بهزیستی وتوانبخشی

نمایه‌سازی قبلی

چاپی-الکترونیکی

TF

1

a

Y