شناسایی ژن های مرتبط با ناتوانی ذهنی اتوزومی مغلوب غیرسندرمی در ده خانواده از استان گلستان به روش نقشه برداری هموزیگوسیتی
General Material Designation
[پایاننامه]
Parallel Title Proper
Identification of genes related to non-syndromic autosomal recessive intellectual disability by homozygosity mapping in ten Golestan Provinces families
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation Sciences))
Date of Publication, Distribution, etc.
، ۱۳۹۳
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
ذ،۲۱۲ص
GENERAL NOTES
Text of Note
پیوست
NOTES PERTAINING TO PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC.
Text of Note
چاپی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
دکترا
Discipline of degree
ژنتیک پزشکی Medical Genetics
Date of degree
۱۳۹۳/۱۲/۱۷
Body granting the degree
علوم بهزیستی و توانبخشی University of Social Welfare and Rehabilitation Sciences))
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
هدف و زمینه : اختلال شناختی با شروع زودرس یا ناتوانی ذهنی یکی از مسائل حل نشده مراقبت های بهداشتی و بار عظیم اجتماعی-اقتصادی می باشد .از آنجا که ناتوانی ذهنی اتوزومی مغلوب در جمعیت هایی که ازدواج خویشاوندی در آن رایج می باشد، شیوع بیشتری دارد، شناسایی ژن های مرتبط با این نوع ناتوانی ذهنی نیز در این جوامع اهمیت بیشتری می یابد .هدف از این تحقیق شناسایی ژن های جدید برای ناتوانی ذهنی اتوزومی مغلوب با استفاده از روش نقشه برداری اتوزیگوسیتی و نسل جدید دستگاه های تعیین توالی بود .روش بررسی :پس از معاینات بالینی دقیق، ده خانواده از استان گلستان که دارای دو یا چند مبتلا به ناتوانی ذهنی اتوزومی مغلوب بودند، بررسی شدند .با بررسی پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی در کل ژنوم و سپس انجام آنالیز پیوستگی، نواحی با بیشترینLOD score ، درهر خانواده مشخص شد.بررسی توالی های کدکننده پروتئین در نواحی هموزیگوت توسط نسل های بعدی تعیین توالی انجام شد .یافته ها :دو خانواده از ده خانواده به لوکوس های MCPH5 و MCPH1 پیوستگی نشان داد .توسط Exome sequencing سه ژن کاندید جدید(ATF7IP ،NRD1، (SPP1 و یک ژن شناخته شده (AP4M1) ناتوانی ذهنی درچهار خانواده دیگر یافت شد .بحث :برای اثبات نقش این ژن ها در ناتوانی ذهنی نیازمند مطالعه عملکردی با استفاده از تکنیک هایPCR - RTو وسترن بلات و همچنین استفاده از مدل هایی همانند مگس میوه دروزوفیلا ملانوگاستر می باشیم .یافته ها در این مطالعه هتروژن بودن ناتوانی ذهنی را در ایران تایید نمود .شناسایی بیشتر یا تمامی ژن ها پیش نیازی برای تشخیص زود هنگام، پیشگیری و در نهایت درمان ناتوانی ذهنی است .اما با سرعت حاضر تشخیص، سال های زیادی برای به انجام رساندن این کار نیاز است و ما انتظار داریم که این یافته ها پیامدهای مستقیم برای تشخیص و پیشگیری از ناتوانی های ذهنی داشته باشد .کلید واژه ها :ناتوانی ذهنی اتوزومی مغلوب، ازدواج خویشاوندی ، نقشه یابی هموزیگوسیتی، توالی یابی نسل بعدی، توالی یابی کامل اگزوم، ایران .
Text of Note
Background: Early-onset cognitive impairment, or intellectual disability, is an unresolved health care problem and an enormous socio-economic burden. Autosomal recessive intellectual disability (ARID), which is mainly due to single gene disorders, is more prevalent among populations that consanguineous marriages are common. Detection of novel ARID genes with the help of autozygosity mapping and next generation sequencing was the aim of this study. Methods: Ten families with at least two affected children were selected after detailed clinical evaluation. Homozygous geneomic intervals with high LOD scores were detected by whole genome SNP genotyping and linkage analysis. Next generation sequencing following exon enrichment for homozygous coding regions was performed. Results: Two out of ten families showed linkage to one of the MCPH loci (one to MCPH1 and the other to MCPH5). Result of exome sequencing of four families identified three novel candidate genes (NRD1, SPP1, and ATF7IP) and a known gene implicated in ID (AP4M1). Conclusion: To confirm the role of these genes in ID functional studies by using techniques such as RT-PCR, western blotting needed. The applications of the lower-model organisms such as Drosophila melanogaster have often provided the first glimpse into the mechanism of action of human. Our data suggested that ARID is a very heterogeneous disorder in Iran and identification of most or all of these genes is a prerequisite for early diagnosis, prevention and eventually, therapy of ID, but at the present pace, many years would be required to accomplish this task. We expect that these findings will have direct implications for the diagnosis and prevention of intellectual disability. Key words: Autosomal recessive intellectual disability, consanguineous marriages, homozygosity mapping, next generation sequencing, whole exome sequencing, Iran.
ba
PARALLEL TITLE PROPER
Parallel Title
Identification of genes related to non-syndromic autosomal recessive intellectual disability by homozygosity mapping in ten Golestan Provinces families