عنوان

DMRT1, RBMY, AZFb genes polymorphism and gene expression role in susceptibility to azospermatozoo

Number

T29479

.Language of Text, Soundtrack etc

انگلیسی

Title Proper

DMRT1, RBMY, AZFb genes polymorphism and gene expression role in susceptibility to azospermatozoo

General Material Designation

Dissertation

First Statement of Responsibility

Azeez Hasan Saleh

Name of Publisher, Distributor, etc.

Natural Sciences

Date of Publication, Distribution, etc.

1402

Specific Material Designation and Extent of Item

128p.

Other Physical Details

cd

Dissertation or thesis details and type of degree

Ph.D.

Discipline of degree

Genetics

Date of degree

1402/06/12

Text of Note

Male infertility can occur due to spermatogenesis defects. The most common reasons for male infertility are azoospermia and oligospermia. Azoospermia is the complete absence of sperm in the ejaculate with several underlying factors, one of which is genetic. Despite this advancement in diagnosis, azoospermia remains the most challenging issue in infertility treatment. This study aimed to investigate the association of azoospermia with the DMRT1 and RBMY genes polymorphisms and AZFb region microdeletions in Iranian men. Moreover, these genes expression profile were assessed by RT-PCR. A total of 100 Iranian men with azoospermia, oligozoospermia, or severe oligozoospermia and 100 fertile controls were included in this study. Subjects were genotyped for DMRT1 rs755383 and RBMY rs1481942953 polymorphisms using Tetra-ARMS PCR after DNA extraction from peripheral blood samples. The existence of two sequence-tagged sites (STSs) in the AZFb region was also investigated by multiplex PCR. RT-PCR was used to analyze the expression level of these genes, obtained from a cDNA library, in the testis tissue of azoospermia cases. With a P-value of 0.014, the TC heterozygous genotype of rs755383 in the DMRT1 gene was related to an elevated risk of azoospermia. However, no significant difference was found in genotype distribution or allelic frequency in the RBMY (rs1481942953) gene polymorphism. Four cases (3 with azoospermia and 1 with severe oligozoospermia) demonstrated Y chromosome microdeletions with sY127 and sY134 markers in the AZFb region. Infertile males' cDNA analysis revealed low expression levels for DMRT1 and PRY (one of the main genes in the AZFb region) with a p-value<0.0001. In contrast, RBMY expression level did not differ between patients and control groups, with a p-value of 0.112. The ROC curve analysis was done to detect genes with biomarker potential. With AUCs of 83% and 77%, DMRT1 and PRY had diagnostic marker potential in azoospermia detection.

Text of Note

ناباروری مردان می¬تواند به دلیل اسپرماتوژنز رخ دهد. شایع¬ترین دلایل ناباروری مردان آزواسپرمی و اولیگواسپرمی است. آزواسپرمی به معنای فقدان کامل اسپرم در انزال است که با چندین عامل زمینه¬ای که مهم¬ترین آن¬ها فاکتورهای ژنتیکی است، در ارتباط است. با وجود پیشرفت¬های اخیر در تشخیص، آزواسپرمی همچنان چالش برانگیزترین مسئله در درمان ناباروری است. این مطالعه با هدف بررسی ارتباط آزواسپرمی با پلی‌مورفیسم‌های ژن‌های DMRT1 و RBMY و ریزحذف‌های ناحیه AZFb در مردان ایرانی انجام گرفته است. علاوه بر این، سطح بیان این ژن¬ها توسط RT-PCR مورد ارزیابی قرار گرفت. در مجموع 100 مرد ایرانی مبتلا به آزواسپرمی، اولیگوزواسپرمی یا نوع شدید الیگوزواسپرمی و 100 فرد کنترل بارور در این مطالعه وارد شدند. پس از استخراج DNA از نمونه¬های خون محیطی، نمونه¬های جمع¬ آوری شده با استفاده از Tetra-ARMS PCR برای بررسی پلی مورفیسم های DMRT1 در ژن rs755383 و rs1481942953 در ژن RBMY تعیین ژنوتیپ شدند. وجود دو سایت STS در ناحیه AZFb نیز توسط Multiplex PCR مورد بررسی قرار گرفت. RT-PCR برای تجزیه و تحلیل سطح بیان این ژن¬ها، به دست آمده از یک کتابخانه cDNA، در بافت بیضه موارد آزواسپرمی استفاده شد. با P-value= 0.014، ژنوتیپ هتروزیگوت TC در ژن DMRT1 با افزایش خطر آزواسپرمی مرتبط بود. با این حال، هیچ تفاوت معنی‌داری در توزیع ژنوتیپ یا فراوانی آللی در پلی‌مورفیسم ژن RBMY (rs1481942953) یافت نشد. چهار مورد (3 مورد آزواسپرمی و 1 مورد الیگوزواسپرمی شدید) ریزحذف‌های کروموزوم Y با نشانگرهای sY127 و sY134 در ناحیه AZFb مشخص شدند. تجزیه و تحلیل cDNA مردان نابارور کاهش سطح بیان DMRT1 وPRY که یکی از ژن‌های اصلی در ناحیه AZFb است را با مقدار p-value کمتر از 0.0001 نشان داد. در مقابل، سطح بیان RBMY بین بیماران و گروه‌های کنترل با مقدار p-value= 0.112 تفاوت معناداری نشان نداد. تجزیه و تحلیل منحنی ROC برای شناسایی ژن‌های دارای پتانسیل نشانگر زیستی انجام شد که در نتیجه این تست DMRT1 و PRY با AUCهای 83 و 77 درصد، دارای پتانسیل نشانگر تشخیصی در تشخیص آزواسپرمی بودند.

Variant Title

ارتباط پلی مورفیسم ژن های DMRT1 ،RBMY، AZFb و نقش بیان این ژن ها با خطر ابتلا به آزواسپرماتوزو

Subject Term

Gene polymorphism, Gene expression, DMRT1, RBMY, AZFb, Infertility, Azoospermia

Subject Term

پلی مورفیسم، بیان ژن، AZFb، DMRT1، RBMY،آزواسپرمی

Entry Element

Hasan Saleh,

Part of Name Other than Entry Element

Azeez

Relator Code

Producer

Entry Element

Safaralizadeh,

Entry Element

Dastmalchi,

Entry Element

Banamolaei,

Part of Name Other than Entry Element

Reza

Part of Name Other than Entry Element

Narges

Part of Name Other than Entry Element

Parisa

Relator Code

Thesis advisor

Relator Code

Consulting advisor

Relator Code

Consulting advisor

Entry Element

Tabriz

Country

ایران

Agency

Central Library of Tabriz University

Date of Transaction

20231031

Call Number

دکتری پایاننامه QL351.H37 1402

Electronic name

Azeez Hasan Saleh

Contact for access assistance

عبادی

e

TL

276903

a

Y