عنوان

Genetic evaluation in a patient with kidney and atrophy disease by whole-exome sequencing

Number

T27202

.Language of Text, Soundtrack etc

انگلیسی

Title Proper

Genetic evaluation in a patient with kidney and atrophy disease by whole-exome sequencing

General Material Designation

Dissertation

First Statement of Responsibility

Hasan Abbodi Hasan al-Saigh

Name of Publisher, Distributor, etc.

Natural Sciences

Date of Publication, Distribution, etc.

1401

Specific Material Designation and Extent of Item

91p.

Other Physical Details

cd

Dissertation or thesis details and type of degree

M.S.

Discipline of degree

genetics

Date of degree

1401/04/29

Text of Note

The NGS method includes initial preparation, fragmentation of the desired genome, imaging sequencing, assembly of the sequenced fragments, and data analysis. This technology uses platforms to isolate millions of DNA fragments in different positions. The patient was a 25-year-old man who was consulted for evaluation of nephrotic range proteinuria and hypertension. He has diagnosed with idiopathic thrombocytopenic purpura about nine years prior to this admission. He had received multiple corticosteroid courses and intravenous immunoglobulin therapy without any meaningful success over those years. The mutation in the GNE gene is the cause of this disease. This is the first report of this disease in the northwest of the country.The disease symptoms showed muscle atrophy, epilepsy, proteinuria (discharge of protein from the kidney), and enlargement of blood platelets.The proband received the disease with recessive autosomal recessive disease from the carrier parents due to a mutation in the GNE gene on chromosome 9 and suffered from Nonaka syndrome.Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase is an enzyme that in humans is encoded by the GNE gene. The bifunctional enzyme UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase (UDP-GlcNAc 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase) regulates and initiates the biosynthesis of N-acetylneuraminic acid (NeuAc), a precursor of sialic acids. UDP-GlcNAc 2-epimerase activity is rate-limiting for the biosynthesis of sialic acid and is required for sialylation in hematopoietic cells. The enzyme’s activity can be controlled at the transcriptional level and affect the sialylation and function of specific cell surface molecules expressed on B cells and myeloid cells. Modifying cell surface molecules with sialic acid is crucial for their function in many biologic processes, including cell adhesion and signal transduction. Differential sialylation of cell surface molecules is also implicated in the tumorigenicity and metastatic behavior of malignant cells. Sialuria is a rare inborn error of metabolism characterized by cytoplasmic accumulation and increased urinary excretion of free NeuAc.

Text of Note

روش NGS شامل آماده سازی اولیه، تکه تکه شدن ژنوم مورد نظر، توالی یابی تصویربرداری، مونتاژ قطعات توالی شده و تجزیه و تحلیل داده ها است. این فناوری از پلتفرم هایی برای جداسازی میلیون ها قطعه DNA در موقعیت های مختلف استفاده می کند. بیمار مردی 25 ساله بود که برای ارزیابی پروتئینوری با دامنه نفروتیک و پرفشاری خون تحت مشاوره قرار گرفت. او حدود نه سال قبل از این بستری، پورپورای ترومبوسیتوپنیک ایدیوپاتیک را تشخیص داده است. او دوره‌های متعدد کورتیکواستروئید و درمان با ایمونوگلوبولین وریدی را بدون هیچ موفقیت معناداری در طی آن سال‌ها دریافت کرده بود. جهش در ژن GNE علت این بیماری است. این اولین گزارش از این بیماری در شمال غرب کشور است.علائم بیماری آتروفی عضلانی، صرع، پروتئینوری (ترشح پروتئین از کلیه) و بزرگ شدن پلاکت های خون را نشان داد.پروباند این بیماری را با بیماری اتوزومال مغلوب مغلوب از والدین ناقل به دلیل جهش در ژن GNE در کروموزوم 9 دریافت کرد و از سندرم Nonaka رنج برد. UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinaseآنزیم دو عملکردی است که در انسان توسط ژن GNE کدگذاری می شود. آنزیم دو عملکردی UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase (UDP-GlcNAc 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase) بیوسنتز N-acetylneuraminic acid (NeuAc) پیش ساز اسیدهای سیالیک را تنظیم و آغاز می کند. فعالیت UDP-GlcNAc 2-اپی مراز محدود کننده سرعت برای بیوسنتز اسید سیالیک است و برای سیالیلاسیون در سلول های خونساز مورد نیاز است. فعالیت آنزیم را می توان در سطح رونویسی کنترل کرد و سیالیلاسیون و عملکرد مولکول های سطح سلولی خاص بیان شده روی سلول های B و سلول های میلوئید را تحت تاثیر قرار داد. اصلاح مولکول های سطح سلول با اسید سیالیک برای عملکرد آنها در بسیاری از فرآیندهای بیولوژیکی، از جمله چسبندگی سلولی و انتقال سیگنال، حیاتی است. سیالیلاسیون دیفرانسیل مولکول های سطح سلولی نیز در تومورزایی و رفتار متاستاتیک سلول های بدخیم نقش دارد. سیالوریا یک خطای نادر متابولیسم ذاتی است که با تجمع سیتوپلاسمی و افزایش دفع NeuAc آزاد از طریق ادرار مشخص می شود.

Variant Title

بررسی ژنتیکی فرد مبتلا به بیماری کلوی و آتروفی با روش توالی یابی کل اگزوم

Subject Term

kidney and atrophy disease- whole-exome sequencing

Subject Term

کلیه و بیماری آتروفی- توالی یابی کل اگزوم

Entry Element

Abbodi Hasan al-Saigh,

Part of Name Other than Entry Element

Hasan

Relator Code

Producer

Entry Element

Haghi,

Entry Element

Jabbarpour Bonyadi,

Entry Element

Reza Ardalan,

Part of Name Other than Entry Element

Mehdi

Part of Name Other than Entry Element

Mortaza

Part of Name Other than Entry Element

Mohammad

Relator Code

Thesis advisor

Relator Code

Thesis advisor

Relator Code

Consulting advisor

Entry Element

Tabriz

Country

ایران

Agency

Central Libarary of Tabriz

Call Number

ارشد پایاننامه QL351.A2 1401

Electronic name

Hasan Abbodi Hasan al-Saigh

Contact for access assistance

عبادی

e

TL

276903

a

Y