عنوان

Analysis of H. pylori cagA and vacA promoter sequence in Iranian strains and their association gastrointestinal disease

Number

T27609

.Language of Text, Soundtrack etc

انگلیسی

Title Proper

Analysis of H. pylori cagA and vacA promoter sequence in Iranian strains and their association gastrointestinal disease

General Material Designation

Dissertation

First Statement of Responsibility

Sajjad Alnajar

Name of Publisher, Distributor, etc.

Natural science

Date of Publication, Distribution, etc.

1401

Specific Material Designation and Extent of Item

123p.

Other Physical Details

cd

Dissertation or thesis details and type of degree

Ph.D.

Discipline of degree

Animal Biology

Date of degree

1401/06/30

Text of Note

Background and Aims: Helicobacter pylori (H. pylori) is the main cause of various gastroduodenal diseases. It is estimated that app roximately, more than half of the adult population in developed countries and 90% of people in developing countries infected with H. pylori. H. pylori infection may be related to Genetic of virulence factors and environmental factors. The aim of this study was to assess of frequency cagA and vacA genes of H. pylori isolated from patients with gastrointestinal disorders.Materials and Methods: This cross-sectional descriptive study was conducted on 65 patients with gastrointestinal diseases (gastritis (75.38%), gastric ulcer (15.38%) and gastric cancer (9.23%)) who were hospitalized in Al-Zahra Hospital (Tabriz-Iran). After genomic DNA extraction, PCR was performed using H. pylori specific primers.Results: Phylogenetic analysis using cagA and vacA gene sequences showed four and three separate lineages, respectively. The gene lineage of 4 cagA genes showed a wide genetic diversity in comparison with the lineage of other lineages. Also, the strains with lineage 3 genotype of vacA gene showed a very high frequency compared to other lineages.Conclusion: According to the results of this study, it can be said that there are different lineages of H. pylori in Iran that have been created due to exchange with other geographical regions, which shows a strong evolutionary trend.

Text of Note

مقدمه: هلیکوباکتر پیلوری عامل اصلی انواع بیماری‌های گوارشی است. تخمین زده می¬شود که تقریباً بیش از نیمی از جمعیت بزرگسال در کشورهای توسعه یافته و 90 درصد از افراد در کشورهای در حال توسعه آلوده به هلیکوباکتر پیلوری هستند. عفونت هلیکوباکتر پیلوری ممکن است به ژنتیک فاکتورهای حدت و عوامل محیطی مرتبط باشد. هدف از این مطالعه بررسی فراوانی ژن‌های cagA و vacA هلیکوباکتر پیلوری جدا شده از بیماران مبتلا به اختلالات گوارشی بود.مواد و روش‌ها: این مطالعه توصیفی مقطعی بر روی 65 بیمار مبتلا به بیماری‌های گوارشی [(گاستریت (38/75%)، زخم معده (38/15%) و سرطان معده (23/9%)] بستری در بیمارستان الزهرا (س) تبریز انجام شد. پس از استخراج DNA ژنومی، PCR با استفاده از پرایمرهای اختصاصی هلیکوباکتر پیلوری انجام شد. یافته‌ها: آنالیز فیلوژنتیک با استفاده از توالی‌های ژن cagA و vacA به ترتیب چهار و سه دودمان جداگانه را نشان داد. دودمان ژنی 4 مربوط به ژن cagA تنوع ژنتیکی وسیعی در مقایسه با سایر دودمان¬ها نشان داد. همچنین، سویه‌های دارای ژنوتیپ دودمان 3، ژن vacA نسبت به سایر دودمان‌ها فراوانی بسیار بالایی داشتند.نتیجه گیری: با توجه به نتایج این مطالعه می¬توان گفت که دودمان¬های مختلفی از هلیکوباکتر پیلوری در ایران وجود دارد که به دلیل تبادل با سایر مناطق جغرافیایی ایجاد شده¬اند که روند تکاملی قوی را نشان می¬دهد.

Variant Title

بررسی توالی پروموتری ژن¬های cagA و vacA در سویه های ایرانی هلیکوباکتر پیلوری و ارتباط آنها با بیماری های گوارشی

Subject Term

H. pylori, cagA, vacA

Subject Term

هلیکوباکتر پیلوری، cagA، vacA

Entry Element

Alnajar,

Part of Name Other than Entry Element

Sajjad

Relator Code

Producer

Entry Element

Safaralizadeh,

Entry Element

Latifi Navid,

Entry Element

Haghi,

Part of Name Other than Entry Element

Reza

Part of Name Other than Entry Element

Said

Part of Name Other than Entry Element

Mehdi

Relator Code

Thesis advisor

Relator Code

Thesis advisor

Relator Code

Thesis advisor

Entry Element

Tabriz

Country

ایران

Agency

Central Library of Tabriz University

Date of Transaction

20221121

Call Number

دکتری پایاننامه QL351.A4 1401

Electronic name

Sajjad Alnajar

Contact for access assistance

عبادی

e

TL

276903

a

Y