Investigation of homB gene mutations in Helicobacter pylori isolated from the patients with gastric cancer
General Material Designation
Dissertation
First Statement of Responsibility
Hasan Ali Mohsin Alyaqoobi
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
Natural Sciences
Date of Publication, Distribution, etc.
1401
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
63p.
Other Physical Details
cd
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
M.S.
Discipline of degree
Cellular and Molecular Biology
Date of degree
1401/3/29
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
H. pylori is a gram negative, microaerophilic, spiral (helical) bacterium usually found in the stomach. It is known as one of the major pathogens responsible for gastric disease such as gastritis and gastric cancer. Gatric cancer is known as one of the prevalent cancers worldwide with high rate of mortality because of its potential for metastasis. Different virulence factors of H. pylori are known to be responsible for its mediated disease. The homB gene is known to have many roles in the bacterium virulence based on previous studies.In this study, we will look at single nucleotide mutations in this gene in people with gastric cancer. For this purpose, cancer tissue samples were collected from patients with gastric cancer and their Helicobacter pylori infection status were measured. To do this, samples were sent to a pathology laboratory and the culture medium and morphological properties were used. Then, using PCR technique, the presence or absence of genes in the samples were determined. Finally, the DNA of the bacteria with positive status for homB was sequenced.Results indicate that 60 percent of the strains in samples were homB positive and one third of these strains had one of the A:G or A:T mutation in 573rd nucleotide of homB gene from start codon. 23.3 percent of the mutations were A:G and 10 percent were A:T.These findings show that virulence of this gene might not be changed in spot mutations. But further studies with statistical analysis are necessary for certainty.
Text of Note
هلیکوباکتر پیلوری یک باکتری گرم منفی، میکروآئروفیل و مارپیچی (مارپیچ) است که معمولاً در معده یافت می شود. به عنوان یکی از عوامل بیماری زا اصلی مسئول بیماری های معده مانند ورم معده و سرطان معده شناخته می شود. سرطان معده به دلیل پتانسیل متاستاز به عنوان یکی از سرطان های شایع در سراسر جهان با نرخ مرگ و میر بالا شناخته می شود. عوامل بیماریزای مختلف هلیکوباکتر پیلوری مسئول بیماری واسطه آن هستند. بر اساس مطالعات قبلی، ژن homB نقش های زیادی در حدت باکتری دارد.در این مطالعه به بررسی جهش های تک نوکلئوتیدی در این ژن در افراد مبتلا به سرطان معده می پردازیم. برای این منظور، نمونههای بافت سرطانی از بیماران مبتلا به سرطان معده جمعآوری و وضعیت عفونت هلیکوباکتر پیلوری آنها اندازهگیری شد. برای انجام این کار، نمونه ها به آزمایشگاه پاتولوژی فرستاده شد و از محیط کشت و خواص مورفولوژیکی استفاده شد. سپس با استفاده از تکنیک PCR، وجود یا عدم وجود ژن در نمونه ها مشخص شد. در نهایت، DNA باکتری با وضعیت مثبت برای homB تعیین توالی شد.نتایج نشان میدهد که 60 درصد سویههای نمونهها homB مثبت بودند و یک سوم این سویهها دارای یکی از جهشهای A:G یا A:T در نوکلئوتید 573 ژن homB از کدون شروع بودند. 23.3 درصد جهش ها A:G و 10 درصد A:T بودند.این یافته ها نشان می دهد که حدت این ژن ممکن است در جهش های نقطه ای تغییر نکند. اما مطالعات بیشتر با تجزیه و تحلیل آماری برای اطمینان لازم است.
OTHER VARIANT TITLES
Variant Title
بررسی جهش های ژن homB در باکتری های Helicobacter pylori استخراج شده از بیماران مبتلا به سرطان معده