محاسبه ضریب همنسبی بر اساس شجره به منظور مدیریت بهینه تنوع ژنتیکی گاو هلشتاین
First Statement of Responsibility
سعید جاوید
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
کشاورزی
Date of Publication, Distribution, etc.
۱۴۰۱
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
۵۲ص.
Accompanying Material
سی دی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
علوم دامی گرایش ژنتیک و اصلاح دام و طیور
Date of degree
۱۴۰۱/۰۶/۲۸
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
عوامل مختلفی در کاهش بازده تولید گله نقش دارند از جمله این عوامل همنسبی و همخونی میباشند. به دنبال همنسبی همخونی افزایش پیدا میکند که، همخونی باعث کاهش ارزش فنوتیپی در گله شده و میانگین تولید را پائین میآورد، در نتیجه باعث زیان اقتصادی قابل توجهی میشود. همخونی از عوامل دیگری است که مربوط به خصوصیات ژنتیکی حیوان است و باعث افزایش وقوع بیماری در گاوهای شیری میشود. جهت بررسی میزان همنسبی بر اساس شجره و تأثیر اثرات آن بر صفات تولیدی و بیماری در گاوهای هلشتاین، از 2680 داده بیماری، شامل اطلاعات بیماری و 2856 داده تولیدی، شامل اطلاعات میزان تولید شیر در 305 روز، سوماتیک، چربی، پروتئین و شکمزایش و شجره 3005 رأس حیوان، از سال 1391 تا 1400 که توسط گاوداری شرکت دشت آذرنگین جمعآوری شده بود، استفاده شد.در تجزیه و تحلیلهای مربوطه ابتداء جهت بررسی میزان همنسبی از نرمافزار CFC استفاده شد، سپس برای بررسی اثر میزان همنسبی بر روی صفات بیماری از نرمافزار آماری SAS، نسخه 2.9، و از رویه LOGISTIC استفاده شد. در این پژوهش، ضریب همنسبی به صورت متغیر گسسته در 4 سطح در داخل مدل قرار گرفت، تا اثر همنسبی بر روی صفات بیماری مشخص شود. در نتایج به دست آمده اثر ضریب همنسبی معنیدار بود (05/0P <). ضریب همنسبی در طول 9 سال بین 00024/0 تا 625/0 با مقدار متوسط 125/0 به دست آمد. اثر همنسبی روی سه بیماری ورمپستان، پنومونی و اسهال که بیشترین درصد ابتلا را در گله داشتند مورد بررسی قرار گرفت. مشخص شد که همنسبی تأثیر معنیداری بر روی سه بیماری دارد (05/0P <). اگر همنسبی در گله از (05/0P <) بیشتر شود منجر به افزایش همخونی و به دنبال آن کاهش تولید و افزایش مبتلا شدن به بیماری و نواقص ژنتیکی میشود. سپس در آنالیز صفات تولیدی از رویه GLM استفاده شد، اثر همنسبی و شکمزایش و سه بیماری که درصد ابتلا بالایی داشتند روی میزان تولید شیر در 305 روز محاسبه شد. نتایج به دست آمده نشان داد که اثر ورم پستان روی میزان تولید شیر در 305 روز معنیدار نیست (05/0P > ). ولی اثر بیماری اسهال و پنومونی روی میزان تولید شیر در 305 روز معنیدار است (05/0P < ). با نتایج به دست آمده 75 درصد از تمام افراد گله در سطح همنسبی 0066/0، قرار داشتند. نتایج تحقیق حاضر نشان داد که اهمیت دادن به ضریب همخونی و همنسبی در انجام آمیزشها و کنترل همخونی به طور معنی داری می تواند میزان ابتلا به بیماریها را در سطح گاوداری کاهش و اقتصاد سالانه را بهبود بخشد.
Text of Note
Nowadys, various factors play a role in reducing the herd's production efficiency, including relatedness and inbreeding. Moverover, negative effects of inbreeding could reduce phenotypic value in the herd and average production, resulting in significant economic losses. Inbreeding is one of the genetic factors related to the genetic traits of the animal that can lead to an increase in the incidence of diseases in dairy cows. With tis motivation, in this study, data from Holstein dairy cows were used to investigate relatedness based on parentage and its impact on performance and disease traits. To do this, the data included 2680 disease data and this the data included 2856 production data (milk yield in 305 days, somatic, cell count, fat %, protein % and parity). 3005 animals collected from 2012 to 2021 from a large dairy farm were used. CFC software was initially used in the analyzes to check the degree of correlation. Next, the statistical software LOGISTIC method SAS was then used to examine how the correlation affects the characteristics of the disease. The relatedness coefficient was included in the model as a discrete variable at 4 levels to determine the effect of relatedness on disease traits. Our outcomes dislyed, the relatedness effect was significant (P<0.05). The relatedness coefficient was obtained between 0.00024 and 0.625 with a mean of 0.125 over 9 years. The study looked at the effects of kinship on the three diseases mastitis, pneumonia and diarrhea, which had the highest percentage of infections in the herd. Kinship was found to have a significant impact on three diseases (P<0.05). As relatedness in the herd increases, this leads to an increase in inbreeding, followed by a likely decline in production and an increase in disease and genetic defects. When analyzing the production characteristics, the GLM method was used. The effect of inbreeding and three diseases on milk production at 305 days was studied. When we included all diseases in the statistical model, the obtained results showed that the impact of mastitis on milk production is not significant (P > 0.05) at 305 days, but the impact of diarrhea and pneumonia on milk production is significant at 305 days is (P<0.05). With the results obtained, 75% of all herd individuals were at a relatedness of 0.006. On this basis, the results of the present research showed that the importance of the inbreeding coefficient and relatedness in mating and controlling inbreeding significantly reduces the incidence of disease at the cattle breed level and improves annual income.
OTHER VARIANT TITLES
Variant Title
Determination of Pedigree-based kinship coefficient for optimal genetic diversity management of Holstein cattle