بررسی بیان توالی غیر کدکننده بلند MEG3 و ژنهای T-bet، INF-y و RORγt در ساولهای تک هستهای خون بیماران مبتلا به بیماری مالتیپل اسکلروزیس
First Statement of Responsibility
روژین دباغی
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
علوم طبیعی
Date of Publication, Distribution, etc.
۱۳۹۹
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
۹۰ص.
Accompanying Material
سی دی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
علوم جانوری ژنتیک
Date of degree
۱۳۹۹/۱۱/۲۹
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
مالتیپل اسکلروزیس(Multiple Sclerosis, MS) یک بیماری خودایمنی مرتبط با التهاب سیستم عصبی مرکزی انسان است. این بیماری اولین بار در سال 1868 توسط ژان مارتین شارکو ثبت گردیده است. این بیماری یکی از شایع ترین اختلالات نورولوژیک و از دلایل ناتوانی جسمی در بالغین جوان به ویژه در زنان است اگرچه در کودکان و افراد مسن نیز گزارش شده است. در MS سلول های ایمنی بدن به سلول های سیستم عصبی مرکزی حمله کرده و باعث تخریب میلین و در موارد حاد باعث تخریب خود سلول عصبی میشود. جایی که میلین در سیستم عصبی مرکزی از بین میرود، پلاکهایی ایجاد میشود که اسکلروزیس (سخت شدگی بافتی) نام برده میشود. این آسیبها با انتقال عادی پالسهای الکتریکی در طول اعصاب مداخله میکند. عوامل ژنتیکی و محیطی در ابتلا به این بیماری مؤثر هستند. از موضوعاتی که همیشه در مداخلات ژنتیکی از اهمیت خاصی برخوردار بوده است، تنظیم بیان ژنها میباشد. در پستانداران بخش عمدهای از فراوردههای بیان ژن را توالیهای ریبونوکلئوتیدی غیر کدکننده شکل میدهند، که بخش عمده این توالیها microRNA و LncRNA هستند. ما در این تحقیق به بررسی تعدادی از LncRNA ها و ژن های هدفشان پرداختهایم. LncRNA ها طولهایی بیش از 200 نوکلئوتید دارند. در این نوع RNA ها فرایندهایی مثل کلاهکگذاری ، پلیآدنیلاسیون و پیرایش متناوب انجام میگیرد و تنها تفاوت آن با microRNA ها، عدم تولید پروتئین میباشد. LncRNA ها بیان ژنها را در سطح پس از رونویسی تنظیم میکنند. بسیاری از فرایندهای زیستی مانند رشد و تمایز، هموستازی، تغییرات آسیب شناسی اندام (Pathophysiologic Changes) و پاسخهای ایمنی توسط LncRNA ها تنظیم میشوند. بسیاری از این LncRNA ها مختص سلول هستند. RORγt یک فاکتور رونویسی اختصاصی سلولهای Th17 میباشد و در تمایز آن نقش دارد. سطح بیان T-betو INF-γ به طور غیر مستقیم تعداد سلولهای Th1 و RORγt تعداد سلولهای Th17 را منعکس میکند. طبق آزمایشات کاهش میزان بیان LncRNA MEG3 با افزایش بیان RORγt ، T-bet و INF-γ در سطح ژن و پروتئین همراه است. این نتایج نشان میدهد که LncRNA MEG3 در تنظیم تعداد سلولهای Th17 و Th1 نقش دارد، که مکانیسم مهمی در بیماریهای خودایمنی و التهابی به شمار میرود. در این پژوهش بیان ژن LncRNA MEG3 و تاثیر آن بر بیان RORγt و T-betو INF-γ و ارتباط آن با مسیر التهابی Th1 مورد بررسی قرار گرفته است.مواد و روش: در این پژوهش خون گیری از 52 بیمار MS و 20 فرد سالم انجام شد. PBMC توسط فایکول استخراج گردید. جدا سازی RNA توسط محلول استخراج ترایزول انجام شد. سپس سنتز cDNA و در ادامه Real-time PCR انجام شد و در نهایت آنالیز آماری انجام گردید.نتایج: بیماران را بر حسب دریافت دارو یا عدم دریافت و همچنین نوع داروی دریافتی دسته بندی کردیم و سپس بیان ژنها را بین سه گروه کنترل، بیماران تحت درمان و بیماران new case مقایسه کردیم. افزایش بیان تمام ژنها در بیماران new case نسبت به افراد کنترل سالم مشاهده شد، هرچند این افزایش فقط در ژنهای T-bet و RORC معنادار بود. کاهش بیان ژنها در بیمارن تحت درمان با دارو نسبت به کنترل در بین گروههای دارویی متفاوت بود و همچنین همبستگی بین بیان این چهار ژن در هر گروه و به تفکیک نوع داروی دریافتی سنجیده شد. بحث و نتیجهگیری: داروهای تاثیرات مختلفی بر بیان ژنها نشان دادند. ژنهای MEG3 و T-bet پتانسیل بایومارکری بالایی در این بیماری نشان دادند. تحقیقات بیشتر برای شناخت ارتباط بیان این داروها با ژنها در سلولهای ایمنی و در هر دو محیط پریفرال و CNS بیماران MS نیاز میباشد
Text of Note
Multiple Sclerosis (MS) is an autoimmune disease associated with inflammation of the human central nervous system. It is one of the most common neurological disorders and one of the causes of physical disability in young adults, especially women, although it has been reported in children and the elderly. In MS, immune cells attack neurons in the central nervous system, destroying myelin and in acute cases, destroying the nerve cell. These injuries interfere with the normal transmission of electrical pulses along the nerves. Genetic and environmental factors play a role in the development of this disease. One of the topics that has always been of special importance in genetic interventions is the regulation of gene expression. In mammals, the major part of gene expression products is formed by ribonucleotide sequences other than protein encoders, most of which are microRNA and LncRNA sequences. In this study, we examined a number of LncRNAs and their target genes. LncRNAs have lengths of more than 200 nucleotides. In these types of RNAs, processes such as capillary, polyadenylation, and alternative splicing are performed and the only difference with mRNAs is the lack of protein production. LncRNAs regulate gene expression at the post-transcriptional level. Many biological processes, such as growth and differentiation, homeostasis, pathophysiological changes, and immune responses, are regulated by LncRNAs. Many of these LncRNAs are cell-specific. . RORγt is a specific transcription factor for Th17 cells and is involved in its differentiation. The expression levels of T-bet and INF-γ indirectly reflect the number of Th1 and RORγt cells, the number of Th17 cells. According to experiments, decreased expression of LncRNA MEG3 is associated with increased expression of RORγt, T-bet and INF-γ at the gene and protein levels. These results indicate that LncRNA MEG3 is involved in regulating the number of Th17 and Th1 cells, which is an important mechanism in autoimmune and inflammatory diseases. In this study, the expression of LncRNA MEG3 gene and its effect on RORγt, T-bet and INF-γ expression and its relationship with Th1 inflammatory pathway were investigated. In this study, blood samples were taken from 52 MS patients and 20 healthy individuals. PBMC was extracted by ficoll. RNA extraction was performed by Trizol extraction solution, then cDNA synthesis and then Real Time PCR and finally statistical analysis was performed. Increased expression in all genes was observed in new case patients compared to healthy controls, although this increase was significant only in T-bet and RORC genes. We categorized patients according to the drug received or not received, as well as the type of drug received, and then compared the expression of genes between the three control groups, patients under treatment and new case patients. The medication received was weighed.Drugs showed different effects on gene expression. MEG3 and T-bet genes showed high biomarker potential in this disease. Further research is needed to understand the association between the expression of these drugs and genes in immune cells and in both the peripheral and CNS environments of MS patients.
OTHER VARIANT TITLES
Variant Title
Evaluation of Long Non-Coding RNA MEG3 expression and genes expression of t-bet, INF-y and RORγt in peripheral blood mononuclear cells of Multiple Sclerosis patients