همسانه سازی راه انداز ژن gpd در قارچ های خوراکی صدفیPleurotus ostreatus))
First Statement of Responsibility
/علی اکبر بخششی
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
: پردیس بین المللی ارس
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
۱۰۵ص
NOTES PERTAINING TO PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC.
Text of Note
چاپی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
در رشته بیوتکنولوژی کشاورزی
Date of degree
۱۳۹۲/۱۱/۲۵
Body granting the degree
تبریز
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
راهصاندازهای ژنهای رمز کننده پروتئینی، بخشی از بالا دست ژنصها را به طول چند صد تا بیش از یک هزار جفت باز را شامل می شوند که جایگاه نزدیک به شروع رونویسی در این ناحیه محل اتصال RNA پلیمراز II میباشد .آنچه در یوکاریوتصها باعث تمایز سلولی و ایفای نقش معین در بافتصها می شوند بیان اختصاصی ژنصها است و راهصاندازصهای اختصاصی یکی از اصلیترین وظایف را در این مورد بر عهده دارند .با توجه به این نکته که امروزه قارچها نیز برای تولید فراوردهصهای نوترکیب مورد استفاده قرار میگیرند جداسازی راهصانداز اختصاصی و قوی ژن گلیسرآلدئید-۳- فسفات دهیدروژناز (gpd) از قارچصهای خوراکی صدفی هدفصگیری گردید .بدین منظور پس از دریافت اطلاعات موجود از بانکص نوکلئوتیدیNCBI ، اقدام به طراحی آغازگرهای اختصاصی از توالیصهای مرتبط نموده و با استفاده از آنها تکثیر و همسانهصسازی راهصانداز مورد نظر انجام شد .جهت تهیهDNA ی الگو ابتدا اقدام به استخراج DNA ژنومی از قارچص مورد نظر به روش CTAB شد .پس از واکنش زنجیرهای PCR و ارزیابی محصول تکثیری با الکتروفورز ژل آگارز، خالص سازی قطعه تکثیر یافته انجام، سپس اقدام به اتصال راه انداز تکثیر یافته به حامل خطی۱۹ -pTGو تراریختهصسازی سلولصهای مستعد باکتریایی گردید .کلنیصهای سفید که حضور قطعه درجی در آنصها با کلنی PCR تایید شده بود برای کشت مایع و استخراج پلاسمید انتخاب شدند .حضور قطعه درجی از طریق برش آنزیمی با اطمینان بیشتری مورد تایید قرار گرفته و پلاسمید نوترکیب به منظور توالیصیابی به شرکت ژنصفناوران ارسال شد .بررسی بیوانفورماتیکی نتایج توالیصیابی، حاکی از همسانهسازی موفق راهصانداز gpd بود .این راهصانداز میصتواند به عنوان ابزار بیان اختصاصی در فرایند تراریختهصسازی قارچصهای صدفی و احتمالا قارچصهای دکمهصای مورد استفاده قرار گیرد
Text of Note
19 linear vector and transformed into E.coli .Two positive PCR colonies were chosen and inoculated for plasmid extraction. The presence of promoter in plasmids were confirmed by restriction analysis, and the recombinant plasmid were sent to Genfanavaran company for sequencing purpose. The bioinformatics analysis of sequencing results showed the correct cloning of gpd promoter. Now, this promoter could be used experiment analysis and involved in applied purposes-Promoters of protein coding genes include a part of gene upstream which has got hundreds to more than one thousand base pairs length. The place near to transcriptional starting site is the place where RNA polymerase II assembled and transcription is being started. What dues to cell differentiation and determined role in tissues in eukaryotes is gene specific expression and specific promoters have the most basic role in this work. Since mushrooms are also being used to produce recombinant products the isolation of specific promoter for an important gpd gene in button and oyster mushrooms was targeted. For this purpose, after gathering information on object from nucleotide banks, designing of specific primers from related sequences was done and PCR cloning of promoter has been taken place. In order to prepare template DNA, at first step mushroom genomic DNA was extracted using CTAB method. After PCR amplification and evaluation of its product by agarose gel electrophoresis purification of DNA fragment was done. Then purified cloned fragment was ligated to pTG