بازنگري موقعيت سيستماتيكي Salsola aucheri بر اساس توالي ژن matk
First Statement of Responsibility
عاطفه ميرزايي
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
علوم طبیعی
Date of Publication, Distribution, etc.
۱۴۰۰
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
۶۶ص.
Accompanying Material
سی دی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
زيستشناسي گياهي گرايش سيستماتيك و بومشناسي
Date of degree
۱۴۰۰/۱۱/۱۰
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
گونهیSalsola aucheri در آسیای مرکزی ، جنوب غربی آسیا ، شمال آفریقا و مدیترانه پراکنده است و این گیاه بومی شمال ایران می باشد. این گونه قبلاً در تیره Chenopodiaceae ردهبندی میشد اما در سالهای اخیر به تیره Amaranthacaea منتقل گردیده است. نکتهی قابل توجه در گونههای مربوط به جنس Salsola شباهت مورفولوژیکی بالای آنها میباشد که ردهبندی مبتنی بر صفات مورفولوژیکی میتواند نادرست باشد. فلذا استفاده از آنالیز توالی نوکلئوتیدی ژنها مانند ژن matK میتواند موجب بازنگری صحیح ردهبندی مربوط به گونههای این جنس باشد. ژن matK یکی از مناسبترین ژنها برای شناسایی خویشاوندیهای درون و بین جنسهای مختلف گیاه به کار میرود وبه عنوان مارکر فیلوژنتیک مطرح است. در پژوهش حاضر به منظور بازسازی روابط فیلوژنی و برای یافتن رابطهی خویشاوندی بین گونه Salsola aucheri و سایر گونههای جنس Salsola، توالی ناحیهی matK، 11 گونه از جنس Salsola به عنوان درون گروه و 2 گونه از جنس Salicornia به عنوان برون گروه از سایت NCBI اخذ و با استفاده از روشهای Maximum parsimony، Distance و Neighbor-joining آنالیز گردید. نتایج آنالیز حاصل از متد Distance نشان داد که گونهیS.aucheri دارای کمترین فاصله ژنتیکی با دو گونهی Salsola canescens و Salsola baryosma که به ترتیب به اندازهی 06/0 و 08/0 میباشد و بیشترین فاصلهی ژنتیکی مربوط به گونهی S. aucheri با دو گونهی برون گروهSalicornianatalensis وSalicornia decumbens به ترتیب به اندازهی 83/1 و 82/1 میباشد. و همچنین درختهای فیلوژنتیکی رسم شده از روشهای Maximum parsimony و Neighbor- joining نشان میدهد که گونه Salsola aucheri با دوگونهی S.canescens و S.baryosma دارای رابطهی خویشاوندی نزدیکتری در قیاس با سایر گونههای جنس Salsola مطالعه شده دارد. با توجه به بررسیها و مقایسهی انجام شده از نتایج بدست آمده از روابط فیلوژنی بین گونهی Salsola aucheri با سایر گونهها براساس توالی کلروپلاست matK و توالی ناحیهی ITS متوجه میشویم که نتایج حاصل از دو توالی مورد استفاده با هم مغایرت دارد
Text of Note
Abstract:Salsola aucheri is distributed in Central Asia, Southwest Asia, North Africa and the Mediterranean, and this plant is native to northern Iran . This plant was previously classified in the family Chenopodiaceae but in recent years has been transferred to the genus Amaranthaceae .An important point in the species related to the genus Salsola is their high morphological similarity, that the classification based on morphological traits can be incorrect. So, the use of nucleotide sequence analysis of genes such as matK gene can lead to a correct revision of the classification of species of this genus. The matK gene is one of the most suitable genes used to identify relatives within and between different plant genera, and this gene is considered as a phylogenetic marker. In this study , in order to reconstruct phylogenetic relationships between Salsola aucheri and other species of the genus Salsola , the sequence of matK of 11 other species of the genus Salsola as ingroups and 2 species of the genus Salicornia as out-groups taken from NCBI site and were analyzed using the method of distance , maximum parsimony and neighbor- joining. the results of the analysis distance method showed that , the lowest genetic distance was related to S. aucheri with S. canescens and S. baryosma is 0.06 and 0.08 respectively and the highest genetic distance was related to S. aucheri with Salicornia natalensis and Salicornia decumbens is 1.83 and 1.82 respectively. Also, phylogenetic trees drawn using maximum parsimony and neighbor- joining methods show that Salsola aucheri have closely relationships with 2 species of S. canescens and S. baryosma compared with other species of the genus Salsola. According to the studies and comparison of the results obtained from phylogentic relationships between S. aucheri and other species based on the sequence of chloroplast matK and the sequence of ITS region , we find that the result of the two sequences used are different.
OTHER VARIANT TITLES
Variant Title
A systematic revision of Salsola aucheri based on the matK gene sequence