تنوع اللی ژنهای مقاومت به زنگ قهوهای و نشانگرهای ریزماهواره پیوسته با ژنصهای زنگ زرد در گندمهای بومی ایران
First Statement of Responsibility
/زهرا شرابیانلو
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
: پردیس بینالمللی ارس
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
۶۹ص
NOTES PERTAINING TO PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC.
Text of Note
چاپی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
گروه به نژادی و بیوتکنولوژی گیاهی
Date of degree
۱۳۹۱/۱۱/۱۶
Body granting the degree
دانشگاه تبریز
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
زنگ قهوهصای و زرد از جمله بیماریصهای مهم کاهنده کمیت و کیفیت محصول گندم در دنیا و ایران میصباشند .در این مطالعه، تنوع اللی برخی از ژنصهای مقاومت به زنگ قهوهصای (Lr) و نشانگرهای ریزماهواره پیوسته با ژنصهای مقاومت به زنگ زرد (Yr) در ۳۹۵ ژنوتیپ گندم بومی ایران، شامل ۱۵۴ ژنوتیپ بهاره، ۱۹۳ ژنوتیپ پاییزه، ۴۶ ژنوتیپ با عادت رشدی ناشناخته و دو ژنوتیپص بینابین همراه با دو رقم استاندارد Chinese Spring و Thatcher بررسی گردید .با استفاده از آغازگرهای اختصاصی طراحی شده براساس ژنLr۱ ، دو قطعه تکثیر با اندازهصهای ۵۶۰ و ۴۹۰جفت باز تکثیر شد که به ترتیب دارای فراوانی ۵۱/۲۱ و ۱۳/۵۱درصدی بودند .برای ژن Lr۹ ، علاوه بر قطعات مورد انتظار ۱۱۰۰ و ۸۰۰ جفت بازی، قطعه جدید ۱۰۹۰ جفت بازی در دو ژنوتیپ پاییزه تکثیر گردید .با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژنLr۱۰ ، الل جدید ۳۲۰ جفت بازی در یک ژنوتیپ پاییزه علاوه بر نوارهای ۳۱۰ جفت بازی تکثیر گردید .علاوه بر قطعه مورد انتظار ۷۰۰ جفت بازی با فراوانی ۰۷/۴۶ درصد بر اساس نشانگر SCAR طراحی شده برای ژنLr۲۴ ، اللصهای جدید۶۵۰ ، ۷۹۰ و ۹۰۰ جفت بازی با مجموع فراوانی ۵۳/۲ درصد نیز در این جایگاه مشاهده شد .در ناحیه ژنومی مربوط به ژنLr۲۸ ، ژنوتیپصهای مورد مطالعه برای قطعه ۳۷۸ جفت بازی تک شکل) با فراوانی ۳۶/۸۹ درصد (بودند و در تعدادی از ژنوتیپصها قطعهصای تکثیر نشد .در تکثیر ناحیه ژنومی حامل ژنصهایLr۳۴/Yr۱۸ ، دو قطعه ۱۵۰ و ۲۲۹ جفت بازی تکثیر گردید .میزان اطلاعات چندشکلی (PIC) این نشانگرها از صفر تا ۳۵۹/۰ (Lr۹) با متوسط ۱۰۵/۰ متغیر بود .هتروزیگوتی مشاهده شده از صفر) برای ژنصهایی با یک الل و Lr۵۱ با دو الل (تا ۶۱۲/۰ (Lr۹) با میانگین ۱۰۲/۰ در ژنوتیپهای مورد بررسی بر آورد گردید .تنوع ژنی نیز دارای دامنه صفر تا ۴۷۰/۰ (Lr۹) و میانگین ۱۲۸/۰ بود .با استفاده از سه نشانگرریزماهواره پیوسته با ژنصهای مقاومت به زنگ زرد در مجموع ۳۳ الل در ژنوتیپصهای مورد بررسی تکثیر شد .میانگین PICبرابر ۷۳۳/۰ با حداقل ۶۴۷/۰برای آغازگر GWM۵۲۶ و حداکثر ۶۹۰/۰ برای آغازگر WMC ۱۷۵ به دست آمد .کمترین تعداد الل ۴ برایGWM۵۲۶ و بیشترین آن ۱۸ برای آغازگر WMC۱۷۵با میانگین ۱۱ بود .تنوع ژنی با حداکثر ۸۷۵/۰ برای نشانگر GWM۴۱۳ و حداقل ۷۰۱/۰ برای نشانگرهای GWM۵۲۶ و WMC ۱۷۵ با میانگین ۷۵۹/۰ برآورد شد
Text of Note
Leaf and yellow rusts are the most important diseases decreasing quality and quantity of wheat production in the world and Iran. In this study, allelic variation of some leaf rust resistance genes and microsatellite markers linked to yellow rust resistance genes was investigated in 395 Iranian wheat landraces including 154 spring, 193 winter, 46 with unknown growth habit and two facultative genotypes along with two cultivars, Thatcher and Chinese Spring. Two 490 and 560 bp fragments with frequency of 21.51 and 51.13 , respectively, were amplified using specific primers designed base on Lr1 gene. For Lr9 gene, in addition to expected 1100 and 800 bp fragments, one new 1090 bp fragment was also amplified into two winter type genotypes. A new 320 bp fragment in addition to expected 310 bp allele was amplified using Lr10 gene specific primers. Based on Lr24 gene specific SCAR marker, the expected fragment of 700 bp with frequency of 46.07 and three new 650, 790 and 900 bp alleles with total frequency of 2.53 were observed. For amplified genomic region of Lr28, the studied genotypes were monomorphic ( 89.36) for 378bp fragment and in some of the genotypes no fragment was amplified. In genomic region carrying Lr34/Yr18 genes, two fragments with length of 150 and 229 bp were amplified. For the studied markers, polymorphism information content (PIC) varied from zero to 0.359 (Lr9) with average of 0.015. Observed heterozygosity ranged from zero (genes with one allele and Lr51 with two alleles) to 0.612 (Lr9) with an average of 0.102. Gene diversity showed range of zero to 0.470 (Lr9) with an average of 0.128. In total, 33 alleles were amplified in the studied genotypes using three microsatellite markers linked to yellow rust resistance genes. PIC with mean of 0.733 showed minimum value of 0.647 (GWM526 marker) and maximum value of 0.690 (WMC175 marker). The number of alleles ranged from 4 (GMW526) to 18 (WMC175) with mean of 11. Gene diversity showed range of 0.875 (GWM413) and 0.701 (GWM526,WMC175) with average of 0.759