مطالعه ی برهم کنش ترکیب آئوراپتن از مشتقات کومارینی با DNA ct- به روش تجربی و تئوری
First Statement of Responsibility
بهار دهقان
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
علوم طبیعی
Date of Publication, Distribution, etc.
۱۳۹۶
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
۸۴ص.
Accompanying Material
سی دی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
علوم جانوری گرایش بیوشیمی
Date of degree
۱۳۹۶/۰۶/۱۹
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
چکیده: سرطان مجموعه ای از ناهنجاری های مختلف می باشد که به طور کلی با رشد غیر کنترل شده و گسترش سلول های غیر طبیعی در بدن، توصیف می گردد.یکی از اهداف سلولی برای کنترل سرطان، DNA می باشد. DNA اطلاعات ژنتیکی را حمل می کند و عامل کلیدی در ترجمه (بیان ژن و سنتز پروتئین)، همانندسازی، دخالت در رشد سلولی و تقسیم است. نشان داده شده که مولکول های کوچک می توانند با روش های مختلفی با DNA برهم کنش کنند و بدین ترتیب باعث آسیب DNA در سلول های سرطانی و متوقف شدن تقسیم آن ها و نهایتاً مرگ آن سلول ها شوند. مشتقات کومارینی طبیعی، ترکیبات هتروسیکلیکی هستند که به طور گسترده در خانواده های گیاهی Rutaceae ، Apiaceae ، Umbelliferae و در بعضی از باکتری ها و قارچ ها یافت می شوند. ساختار شیمیایی کومارین ها، ظرفیتی برای اتصال آن ها به DNA فراهم می کند. ما نیز سعی کردیم ظرفیت برهم کنش آئوراپتن ، یکی از ترکیبات کومارینی با DNA را اثبات کنیم. این مطلب باعث می شود درک بهتری از مکانیسم ضد سرطانی آن داشته باشیم و هم چنین ممکن است اطلاعات مفیدی را برای طراحی داروهای ضد سرطانی جدید با فعالیت بهتر و اثرات جانبی کم تر فراهم کند. در این تحقیق ، نحوه برهم کنش آئوراپتن با DNA با استفاده از تکنیک های اسپکتروسکوپی UV-visible، اسپکتروسکوپی فلوروسانس، ویسکوزیمتری و FT-IR و داکینگ مولکولی بررسی شد. حالت هایپرکرومیسم در طیف سنجی جذبی مرئی- فرا بنفش و میزان ثابت اتصال ترکیب آئوراپتن به DNA M-1 ) 104 ×3/7) روشن می کند که آئوراپتن به DNA از طریق اتصال به شیار کوچک متصل می شود. وجود تغییرات نامحسوس در ویسکوزیته DNA در حضور آئوراپتن نیز دلیل بر اتصال به صورت غیر درج شونده است و باعث تأیید نتایج حاصل از طیف سنجی جذبی مرئی- فرا بنفش می شود. علاوه بر این، مطالعات فلورسانس نارقابتی نشان می دهد که در حضور DNA خاصیت فلورسانسی آئوراپتن که خود به طور ذاتی دارای نشر فلورسانس می باشد، افزایش می یابد و این نشان دهنده این مطلب است که بین DNA و آئوراپتن برهم کنش وجود دارد و بازده کوانتومی ترکیب افزایش می یابد. همچنین در مطالعه فلورسانس رقابتی شدت نشر کمپلکس ctDNA-MB در حضور غلظت های مختلف ترکیب آئوراپتن به صورت جزئی افزایش می یابد و مولکول های MB پس از اضافه کردن ترکیب آئوراپتن از DNA آزاد نمی شوند و این شواهدی برای اتصال غیر کووالان می باشد. همچنین مطالعات FT-IR و داکینگ مولکولی نیز نشان دهنده اتصال آئوراپتن به شیارکوچک DNA می باشد.
Text of Note
Cancer is a collection of different abnormalities,which is generally characterized by uncontrolled growth and spread of abnormal cells in the body.One of the cellular targets for controlling cancer is DNA. It carries the inheritance information and is the key element in transcription (gene expression and protein synthesis) ,replication , cell growth and cell division. It has been shown that small molecules can interact with DNA in different ways and by doing so they can couse DNA damage mostly in cancer cells ,blocking their division and resulting in cell death.Natural coumarin derivatives are hetero cyclic substances which are found in many plant families such as Rutaceae , Apiaceae , Umbelliferae and in some of Bacteria and Fungi. Chemistry of coumarins is well-studied because of their importance in medicine. The chemical structure of coumarins provides them with capacity to interact with DNA. We have tried to demonstrate the DNA interaction capability of Auraptene, a member of coumarins. This allows us to understand more about its anticancer mechanism and may provide usefull information for designing new anticancer drugs with better activity and less side-effects. In this work, the interaction of Auraptene with ct-DNA has been investigated using uv-visible spectroscopy, fluorescence spectroscopy، viscosimetry , FTIR and Molecular docking.Uv-visible absorption band of Auraptene showed hyperchromisity in the presence of AUR eside this , the low value of kb (7.3x104 M-1) , indicates that Auraptene binds to DNA by a non-intercalative mode .A little change in the DNA viscosity in the presence of increasing amounts of Auraptene is indicative of a non-intercalative mode of binding which is in agreement with spectroscopies studies. Furthermore, non-Competitive fluorescence spectroscopic study, Showed that the fluorescence emission spectra increases, which is a sign of the interaction between auraptene with CT-DNA and the quantum efficiency of complex was increased. Also, competitive fluorescence studies, shown that by adding Auraptene combined on DNA-MB complex, MB molecules are not released from the DNA helix after addition of auraptene and is an evidence for a nonintercalative mode of binding. Furthermore, Molecular docking and FTIR studies indicate that Auraptene binds into minor groove of DNA.
OTHER VARIANT TITLES
Variant Title
Interaction of Auraptene with ct-DNA : Experimental and Theoritical Investigations