عنوان

روابط ژنتیکی لاین.های اینبرد ژرم‌پلاسم ذرت ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره و شناسایی نشانگرهای مثبت برای صفات مهم زراعی

Number

‭۳۵۸۸پ‬

.Language of Text, Soundtrack etc

per

Title Proper

روابط ژنتیکی لاین.های اینبرد ژرم‌پلاسم ذرت ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره و شناسایی نشانگرهای مثبت برای صفات مهم زراعی

First Statement of Responsibility

/آمنه عسکری سعادت آبادی

Name of Publisher, Distributor, etc.

تبریز : دانشگاه تبریز ، دانشکده کشاورزی

Text of Note

چاپی

Text of Note

فاقد اطلاعات کامل

Dissertation or thesis details and type of degree

کارشناسی ارشد

Discipline of degree

مهندسی کشاورزی

Date of degree

‮‭۱۳۸۵/۱۱/۲۵‬

Body granting the degree

تبریز : دانشگاه تبریز ، دانشکده کشاورزی

Text of Note

گام اول در برنامه‌های اصلاح ذرت هیبرید، اطلاع از سطح تنوع و روابط ژنتیکی لاین‌های اینبرد می‌باشد .در این تحقیق تنوع ژنتیکی و روابط خویشاوندی ‮‭۶۷‬ لاین اینبرد ژرم‌پلاسم ذرت ایران با استفاده از ‮‭۴۹‬ جفت نشانگر ریزماهواره از کروموزوم‌های مختلف ذرت مورد ارزیابی قرار گرفت .در مجموع ‮‭۴۱۰‬ الل چندشکل با میانگین‮‭۳۶۷/۸ ۶۹۹/۰‬الل به ازاء هر جایگاه ریزماهواره تکثیر شد .کمترین تعداد الل مربوط به نشانگرهای‮‭phi۱۲۷‬ ،‮‭phi۰۱۵۲‬ ،‮‭phi۰۴۶‬ ، ‮‭bnlg۱۸۶۳‬ و ‮‭nc۱۳۳‬ با ‮‭۳‬ الل و بیشترین آن مربوط به نشانگر ‮‭bnlg۱۰۴۵‬ با ‮‭۲۳‬ الل بود .میزان اطلاعات چندشکلی برای نشانگرهای مورد بررسی بین ‮‭۹۳۹/۰۲۰۰/۰‬ با میانگین‮‭۷۰۹/۰ ۰۲۴/۰‬متغیر بود .نشانگر ‮‭bnlg۱۰۹۲‬ بیشترین میزان اطلاعات چندشکلی ‮‭(۹۳۹/۰)‬ و نشانگر ‮‭nc۱۳۳‬ کمترین مقدار آن را ‮‭(۲۰۰/۰)‬ داشت .از نظر تنوع ژنی نیز دو نشانگر ‮‭bnlg۱۰۹۲‬ و ‮‭nc۱۳۳‬ به ترتیب بیشترین ‮‭(۹۴۲/۰)‬ و کمترین ‮‭(۲۱۱/۰)‬ مقدار را داشتند .تجزیه خوشه‌ای براساس الگوریتم‮‭Joining - Neighbor‬و ضرایب فاصله مبتنی بر وجود و عدم وجود نوارها و فراوانی اللی برای گروه‌بندی لاین‌های اینبرد انجام شد .در کلیه دندروگرام‌ها لاین‌های اینبرد گروه هتروتیک آمریکایی ‮‭RYD‬ شامل‮‭B۷۳‬ ، ‮‭A۶۷۹‬ و ‮‭B۸۴‬ به همراه لاین ‮‭A۶۳۲‬ از ژرم-پلاسم ذرت آمریکا، در یک گروه قرار داشتند .لاین‌های اینبرد ‮‭MO۱۷‬ از گروه هتروتیک آمریکایی ‮‭LSC‬ و سه لاین مشتق شده از آن یعنی‮‭K۱۹‬ ، ‮‭K۱۹/۱‬ و ‮‭K۱۸‬ نیز در یک گروه قرارگرفتند .اکثر لاین-های اینبرد ‮‭KL۱۷/۲‬ مشتق شده از منابع نامشخص ‮‭XL۱۷/۲‬ در کلیه روش‌ها با هم گروه‌بندی شدند .همچنین لاین‌های خویشاوند‮‭K۱۶۶A‬ و ‮‭K۱۶۶/B‬ در کلیه گروه‌بندی‌صها در کنار هم واقع شدند .با مقایسه نتایج حاصل، در نهایت دندروگرام حاصل از ضریب‮‭۸۳ - Nei‬بدلیل مطابقت بالا با شجره و اطلاعات موجود برای لاین‌ها به‌عنوان گروه‌بندی اصلی در نظر گرفته شد .برای تعیین تعداد مطلوب گروه‌ها و یا بهترین نقطه برش دندروگرام از تجزیه واریانس مولکولی استفاده شد .مقایسه نتایج در نقاط برش نشان داد که بیشترین تمایز بین گروه‌ها در نقطه برش با هفت گروه حاصل شد .با هفت گروه، واریانس بین گروهی حدود ‮‭۶۶/۰‬ واریانس مولکولی کل را توجیه کرد .در این گروه‌بندی، گروه اول با دو زیر گروه، لاین‌هایی با منشأ مواد غیرمعتدله سیمیت و لاین‌های مشتق شده از منبع ‮‭XL۱۷/۲‬ بجز‮‭KL۱۷/۲‬ - ‮‭۳‬را در زیر گروه اول و لاین‌های مربوط به گروه هتروتیک ‮‭RYD‬ و لاین ‮‭A۶۳۲‬ را در زیرگروه دوم دربرداشت .گروه دوم شامل لاین‌صهایی با منشأ ناشناخته بود .در گروه سوم تعدادی از لاین‌صهای مشتق شده از مواد سنتتیک دیررس و یک لاین با شجره برزیلی ‮‭(K۳۰۴۷/۲)‬ قرار داشت .گروه چهارم لاین ‮‭MO۱۷‬از گروه هتروتیک ‮‭LSC‬ و سه لاین مشتق شده از آن، دو لاین با منشأ نامشخص محلی، دو لاین با شجره ناشناخته، یک لاین سنتتیک دیررس، لاین‮‭KL۱۷/۲‬ - ‮‭۳‬با منشأ نامشخص ‮‭XL۱۷/۲‬ و لاین ‮‭K۳۲۱۸‬ مشتق شده از مواد اسپانیایی را دربرداشت .در گروه پنجم بیشتر لاین‌صها با شجره نامشخص و چند لاین مشتق شده از مواد غیرمعتدله سیمیت قرار داشتند .بیشتر لاین های منشأ گرفته از مواد غیرمعتدله سیمیت در گروه ششم واقع شدند .گروه هفتم نیز شامل اغلب لاین‌های مشتق شده از منبع سنتتیک دیررس و چند لاین دیگر بود .در بین گروه‌ها، بیشترین ناهمگنی مربوط به گروه اول با ‮‭۱۴/۰‬ واریانس مولکولی کل و کمترین ناهمگنی مربوط به گروه-های دوم و سوم با واریانس درون گروهی تقریبا صفر بود .تعداد ‮‭۹۳‬ الل اختصاصی برای ‮‭۷‬ گروه شناسایی شد که بیشترین تعداد متعلق به گروه دوم ‮‭(۲۰‬ الل (و کمترین آن متعلق به گروه سوم ‮‭(۴‬ الل (بود .براساس تجزیه ارتباط ژنوتیپ و فنوتیپ، ‮‭۳۲‬ الل از ‮‭۱۵‬ نشانگر ریزماهواره رابطه معنی‌دار با ‮‭۱۵‬ صفت از ‮‭۱۹‬ صفت مورد ارزیابی در لاین‌های اینبرد ذرت نشان دادند .ارتفاع بلال با ‮‭۵‬ الل بیشترین و صفات قطر پایینی بلال، طول محور بالایی گل تاجی، عرض دانه و فاصله انشعابات گل تاجی با یک الل کمترین تعداد الل مثبت را داشتند.

Text of Note

.‮‭Knowledge about the level of genetic variation and relationships among inbred lines is the first step in maize hybrid breeding programs. In this study, genetic diversity and relationships of ۶۷ Iranian maize inbred lines were evaluated by means of ۴۹ microsatellite markers selected from different chromosomes. In total, ۴۱۰ polymorphic alleles with an average of ۸.۳۶۷۰.۶۹۹ allele per locus were amplified. A many markers, phi۰۴۶, phi۰۱۵۲, phi۱۲۷, bnlg۱۸۶۳ and nc۱۳۳ with ۳ alleles and bnlg۱۰۴۵ with ۲۳ alleles showed the minimum and maximum number of alleles, respectively. Polymorphic information content (PIC) ranged from ۰.۲ (nc۱۳۳) to ۰.۹۳۹ (bnlg۱۰۹۲) with the mean value of ۰.۷۰۹۰.۰۲۴. With respect to the gene diversity, two markers bnlg۱۰۹۲ and nc۱۳۳ showed maximum (۰/۹۴۲) and minimum (۰/۲۱۱) values, respectively. Cluster analysis based on Neighbor-Joining algorithm and distance coefficients on the basis of absence and presence of alleles and allelic frequency were used for grouping of inbred lines. In all the resulting dendrograms, the inbred lines from American heterotic group of RYD including B۷۳, A۶۷۹ and B۸۴ along with A۶۳۲ from USA maize germplasm were grouped together. MO۱۷ from American heterotic group of LSC and its three derivates, K۱۸, K۱۹ and K۱۹/۱, consistently assigned to the same group. The majority of inbred lines derived from unknown source of KL۱۷/۲ were also grouped with each other. In all methods two related lines K۱۶۶/B and K۱۶۶A were closely clustered. A many dendrograms, the dendrogram based on Nei-۸۳ distance coefficient was selected for final grouping due to high concordance with the available pedigree information for inbred lines. Analysis of molecular variance (AMOVA) was used to determine the optimal number of clusters. Maximum group differentiation was obtained at cutting point of seven groups. With seven groups, between group variance explained ۶۶ of the total molecular variation. In this grouping, group I with two sub-groups, consisted of some lines derived from CIMMYT, non-temperate materials, and all the lines obtained from XL۱۷/۲ except KL۱۷/۲-۳ in sub-group ۱ and all of the lines from heterotic group of RYD and A۶۳۲ in sub-group ۲. Group II mostly included the lines with unknown pedigree. In group III, some lines derived from late synthetic materials and K۳۰۴۷/۲, a line with Brazilian pedigree, were located. Group IV constructed from MO۱۷, from the heterotic group of LSC and its three derivates, two lines from unknown local sources, two lines with unknown pedigree, a line derived from late synthetic source, KL۱۷۲-۳ obtained from XL۱۷/۲ and K۳۲۱۸, a line with Spain materials in its pedigree. Group V contained most of the lines with unknown pedigree and several lines derived from CIMMYT non-temperate materials. Most of the lines derived from the CIMMYT non-temperate materials were assigned into group VI. In Group VII, were included most of the lines derived from late synthetic materials and several others inbreds. Among the groups, group I with ۱۴ of total molecular variance and group II and III with about zero within group variance showed maximum and minimum heterogenesity, respectively. Ninety three specific alleles were detected for seven groups. Group II with ۲۰ specific alleles and group III with ۴ alleles showed the maximum and minimum number of specific alleles, respectively. Association analysis revealed significant association between ۳۲ alleles belonging to ۱۵ microsatellite markers and ۱۵ out of ۱۹ characters evaluated in maize inbred lines. Ear height with five alleles and ear lower diameter, length of main tassel branch , kernel width and tassel branch interval with one allele had maximum and minimum number of alleles, respectively‬

Analysis of molecular variance

Genetic diversity

Informative markers

Maize

Microsatellite markers

Neighbor-Joining algorithm

عسکری سعادت آبادی،آمنه

محمدی،سید ابوالقاسم، استاد راهنما

چوکان،رجب، استادمشاور

نمایه‌سازی قبلی