همسانه سازی و تعیین توالی ژن پروتئین HP جدایه های ویروس برگ بادبزنی مو از منطقه شمال غرب کشور
First Statement of Responsibility
/اعظم هوشمند
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
تبریز: دانشگاه تبریز،دانشکده کشاورزی
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
۸۶ ص، جدول، نمودار، عکس، لوح فشرده
NOTES PERTAINING TO PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC.
Text of Note
چاپی
INTERNAL BIBLIOGRAPHIES/INDEXES NOTE
Text of Note
واژه نامه بصورت زیرنویس
Text of Note
کتابنامه ص.: ۸۱-۸۶
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
گیاهپزشکی
Date of degree
۱۳۸۷/۰۶/۲۵
Body granting the degree
تبریز: دانشگاه تبریز،دانشکده کشاورزی
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
ویروس برگ بادبزنی مو Grapevine fanleaf virus (GFLV) از جنس Nepovirus و خانواده Comoviridae عامل ایجاد بیماری برگ بادبزنی، یکی از شدیدترین بیماریصهای ویروسی مو در جهان است .اخیرا پیشرفتصهای قابل توجهی در مورد تشخیص عملکرد بیشتر پروتئین-هایGFLV ، به ویژه آنصهایی که در مراحل مختلف سیکل تکثیری ویروس شامل تکثیرRNA ، حرکت سلول به سلول، و انتقال به وسیله ناقل نماتدی Xiphinema index دخالت دارند صورت گرفته است .پروتئین ۲AHP برای تکثیر RNA۲ این ویروس مورد نیاز است .جداسازی و تعیین توالی ژن ۲A از جدایهصهای ایرانی این ویروس تا کنون انجام نشده است .با توجه به خسارت قابل توجه این ویروس از نظر کمی و کیفی و سطح زیر کشت بالای مو در منطقه شمال غرب کشور، شناسایی و جلوگیری از گسترش این ویروس امر بسیار مهمی میصباشد .به علاوه، مشخص نمودن ژنوتیپ جدایهصها از نظر ژن HP و بررسی تغییرات ژنی بین آنصها به شناسایی بهتر ویروس به منظور کنترل آن به ویژه از راه مهندسی ژنتیک کمک می کند .در این بررسی نمونه برداری موهای آلوده از تاکستانصها بر اساس علائم مشخص بیماری برگ بادبزنی مو صورت گرفت .سپس ویروس در نمونهصهای آلوده از طریق آزمون سرولوژیکی الایزا با استفاده از پادتن چندهمسانه ای اختصاصی GFLV ردیابی گردید و برای اولین بار در ایران ژن پروتئین HP آن باPCR - RTتکثیر شده و در باکتری E. coli همسانهصسازی و مورد تعیین توالی نوکلئوتیدی قرار گرفت .تجزیه و تحلیل دادهصهای نوکلئوتیدی به دست آمده از جدایه های GFLV از شمال غرب کشور حاکی از وجود شباهت زیاد توالی نوکلئوتیدی بین جدایه های ایرانی با جدایه هایی از سایر نقاط جهان در این منطقه ژنی بود به طوری که جدایه های ایرانی همراه با جدایه های دیگر در یک گروه اصلی قرار گرفتند، اما به لحاظ اختلافات اندکی که بین جدایه ایرانی و سایر جدایه ها بود، کلون های جدایه ایرانی بر روی شاخه مجزا قرار گرفتند
Text of Note
Grapevine fanleaf virus (GFLV) belongs to the genus Nepovirus in the family Comoviridae. GFLV, as the cause of fanleaf disease, is one of the severe viral diseases of grapevine worldwide. Recently, significant progress has been made on the elucidation of the function of most GFLV proteins, in particular those involved in critical steps of the virus multiplication cycle, including RNA replication, cell-to-cell movement, and transmission by Xiphinema index. 2AHP protein is needed for replication of the virus RNA2. This gene hasn't been isolated and studied from the Iranian isolates of the virus yet. Because of significant losses caused by the virus and high level cultivation of grapevine in northwest of the country, identification and prevention of the virus dispersion is essential. However, determining genotypes of isolates from viewpoint of HP gene and studying genetic diversity between them help us to accurately identify the virus in order to control it, particularly via genetic engineering. In this study, sampling of diseased vines was done from vineyards on the basis of distinct symptoms of fanleaf disease. Then the virus was detected in the diseased samples by the anti-GFLV polyclonal antibody in DAS-ELISA. This was followed by amplification of HP protein gene by RT-PCR method. Then the PCR product was cloned in Escherichia coli and subjected to sequencing. Nucleotide sequence analysis of GFLV isolates from Iran revealed a high similarity between Iranian clones and isolates from other parts of the world at the HP region. Accordingly Iranian clones of GFLV were placed in a major clade together with other isolates but in a separate branch because of a few differences in the nucleotide sequences of Iranian clones