عنوان

بررسی تنوع ژنتیکی ارقام پاییزه کلزا با استفاده از نشانگرهای ‮‭DNA‬

Number

‭۳۱۶پ‬

.Language of Text, Soundtrack etc

per

Title Proper

بررسی تنوع ژنتیکی ارقام پاییزه کلزا با استفاده از نشانگرهای ‮‭DNA‬

First Statement of Responsibility

/فهیمه شایق

Name of Publisher, Distributor, etc.

: کشاورزی

Specific Material Designation and Extent of Item

‮‭۱۱۱‬ص.‬

Other Physical Details

: جدول، نمودار،عکس

Text of Note

چاپی

Text of Note

کتابنامه ص.: ‮‭۹۴-۱۰۸‬

Dissertation or thesis details and type of degree

کارشناسی ارشد

Discipline of degree

مهندسی کشاورزی- بیوتکنولوژی

Date of degree

‮‭۱۳۸۴/۰۶/۲۵‬

Body granting the degree

تبریز

Text of Note

لازمه استفاده و به کارگیری بهینه منابع ژنتیکی در برنامه‌های اصلاحی، در گام اول تعیین سطح تنوع ژنتیکی آنها است .در تحقیق حاضر تنوع ژنتیکی ‮‭۳۲‬ ژنوتیپ کلزا با استفاده از نشانگرهای ‮‭RAPD‬ و ریزماهواره مورد بررسی قرار گرفت .برای تهیه نمونه برگی جهت استخراج‮‭DNA‬ ، از هر رقم ‮‭۱۰‬ بذر در گلخانه کاشته شد .استخراج‮‭DNA‬ ی ژن‍-ومی از ن‍-مونه‌های برگی به روش ‮‭CTAB‬ ان‍-جام گ‍-رفت .در تجزیه‮‭RAPD‬ ، از ‮‭۱۷۵‬ آغ‍-ازگ‍-ر ب‍-ررس‍-ی شده، ‮‭۳۷‬ آغازگر با الگوهای نواربندی چند شکل در مجموع ‮‭۲۰۲‬ نوار چند شکل واضح، با میانگین ‮‭۴۵/۵‬ نوار چند شکل به ازای هر آغازگر در ‮‭۳۲‬ ژنوتیپ تولید کردند ‮‭۱۱۸‬ .آلل چند شکل نیز، با میانگین ‮‭۸۱/۹‬ آلل به ازای هر جایگاه ریزم‍-اهواره در بررسی ‮‭۱۰‬ جفت آغازگر ریزم‍-اهواره به دست آمد .میزان اطلاعات چندشکلی ‮‭(PIC)‬ نشانگرهای ریزم‍-اهواره در این تحقیق، بین ‮‭۶۸/۰‬ تا‮‭۸۸/۰‬ ، ب‍-ا م‍-یان‍-گین ‮‭۸۱/۰‬ م‍-ت‍-غیر ب‍-ود .تن‍-وع ژن‍-ی این نشان‍-گرها ب‍-ین‮‭۷۳/۰- ۸۹/۰‬، با میانگین ‮‭۸۳/۰‬ بود .برای گروه‌بندی ژنوتیپ‌ها بر مبنای داده‌های حاصل از نشانگرهای ‮‭RAPD‬ و ریزماهواره از دو روش تجزیه خوشه‌ای دورترین همسایه ‮‭(CLINK)‬ و متوسط فاصله ‮‭(UPGMA)‬، بر اساس ضرایب تشابه نی و لی، ژاکارد و تطابق ساده استفاده شد .ژنوتیپ‌ها هم‌چنین براساس فراوانی‌های آللی نشانگرهای ریزماهواره با دو روش ‮‭UPGMA‬ و‮‭Joining - Neighbor‬بر اساس دو ضریب فاصله ‮‭Nei۸۳‬ و ‮‭Rogers‬ خوشه‌بندی شدند .با توجه به نتایج حاصل از تجزیه خوشه‌ای و تجزیه به مولفه‌های اصلی، تجزیه واریانس یک‌طرفه و تجزیه واریانس چند متغیره، بر اساس اطلاعات هشت صفت مورفولوژیک ژنوتیپ‌ها، از بین دندروگرام‌های به دست آمده از روش‌های خوشه‌بندی بر اساس انواع ضرایب تشابه و فاصله، در نهایت روش خوشه‌بندی ‮‭UPGMA‬ بر اساس ضریب تشابه ژاکارد، هم برای داده‌های ریزماهواره و هم داده‌های ‮‭RAPD‬ انتخاب شد .برش دندروگرام با استفاده از روش‌های ذکر شده، ژنوتیپ‌ها را در ‮‭۴‬ گروه قرار داد .این چهار گروه در دندروگرام حاصل از داده‌های ‮‭RAPD‬ از نظر عملکرد دانه در هکتار و در داده‌های حاصل از نشانگرهای ریزماهواره در سه صفت تعداد روز تا رسیدگی، ارتفاع گیاه و تعداد غلاف در بوته اختلاف معنی‌دار داشتند .

Text of Note

Assessment of genetic diversity, in the frist step is usefull for the utilization of genetic materials through breeding programs. In the present study, genetic diversity of 32 winter genotypes of B. napus was assessed by RAPD and SSR markers. Ten seeds from each genotype were grown in greenhouse and genomic DNA was extracted from leaf samples by CTAB procedure. For the RAPD analysis, 175 primers were screened and 37 most polymorphic ones yielded 202 clear polymorphic bands. On the average 5.45 bands per primer were observed. For the SSR analysis, 37 primer pairs were tested and 10 primer pairs were used for genotypes analysis. A total of 118 polymorphic alleles were scored, with an average of 9.81 alleles per each locus of SSR. Polymophism information content (PIC) values and gene diversity for SSR markers, ranged from 0.68 to 0.88 with mean of 0.81 and 0.73 to 0.89 with mean of 0.83, respectively. Cluster analysis of RAPD and SSR data was done using UPGMA and Complete Linkage methods with Nei & Li, Simple Matching and Jaccard similarity coefficients, genotype grouping based on allelic frequencies of SSR loci was carried out by UPGMA and Neighbor-Joining methods based on Rogers and Nei83 distance coefficients. Result of cluster analysis and principal component analysis confirmed using one way analysis of variance and multivariate analysis of variance based on eight morphological characters in different cutting point of dendrogram showed that among variance clustering methods, the UPGMA method based on Jaccard coefficient in both marker systems revealed better grouping. In the resulting dendrogram based on RAPD data and SSR data four groups were detected. In grouping based on RAPD data, the groups showed significant differentes in grain yield whereas in groups obtained by SSR data significantly differed in three characters via days to maturity, plant height and number pod per plant.

RAPD

Rapeseed

Genetic diversity

شایق، فهیمه

محمدی، سید ابوالقاسم، استاد راهنما

تورچی، محمود، استاد راهنمای همکار

مقدم، محمد، استاد مشاور

جاوید فر، فرزاد، استاد مشاور همکار

Public note

سیاه و سفید

نمایه‌سازی قبلی