تنوع ژنتیکی Aegilops tauschii شمال ایران با استفاده از نشانگرهای ISSR
Parallel Title Proper
Genetic diversity of Aegilops tauschii of north of Iran by ISSR markers
First Statement of Responsibility
/ده شنی عمر حمه صالح
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
: کشاورزی
Date of Publication, Distribution, etc.
، ۱۳۹۹
Name of Manufacturer
، کبیری
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
۶۳ص
NOTES PERTAINING TO PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC.
Text of Note
چاپی - الکترونیکی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
رشته اصلاح نباتات گرایش ژنتیک مولکولی و مهندسی ژنتیک
Date of degree
۱۳۹۹/۰۹/۰۸
Body granting the degree
تبریز
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
لازمه تقویت پایه ژنتیکی گندم نان، شناسایی تنوع ژنتیکی و طبقهبندی خزانه ژنتیکی در خویشاوندان وحشی آن میباشد .به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی ۵۰ نمونه از گونه وحشی Ae. tauschii جمعآوری شده از استانهای گیلان، گلستان و مازندران از ۲۷ آغازگر ISSR استفاده شد .از ۲۷ آغازگر مورد استفاده، ۸ آغازگر موفق به تکثیر ۷۷ نشانگر شد که ۷۵ (۶/۹۸ درصد (مورد از آنها چند شکل بودند .میانگین تعداد نوار چند شکل برابر ۶۲۵/۹ در دامنه ۸ تا ۱۲ متغیر بود .بالاترین و پایینترین میزان PIC به ترتیب برابر ۴۸۲/۰ و ۳۰۳/۰ محاسبه گردید .میانگین پارامترهای ژنتیکی محاسبه شده برای تعداد الل مؤثر، شاخص شانون،PIC ، MI و Rp به ترتیب برابر۶۱۲/۱ ،۵۲۸/۰ ،۳۵۵/۰ ، ۵/۳ و ۹/۹ بود .نشانگرهایISSR۱۱ ، ISSR۸ و ISSR۸۲۷ با بیشترین مقادیر پارامترهای ژنتیکی در تمایز نمونهها مؤثر واقع شدند .با توجه به پارامترهای ژنتیکی درونگروهی حاصل از دادههای نشانگریISSR ، نمونههای مربوط به استان گیلان بالاترین تنوع ژنتیکی را داشتند .تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) نیز تنوع ژنتیکی درونگروهی بالایی (۸۱ درصد (نسبت به بینگروهی (۱۹ درصد نشان داد .نتایج حاصل از تجزیه خوشهای با استفاده از الگوریتم Minimum evolution با ضریب فاصله Number of differences با بیشترین مقادیر Bootstrap نمونههای Ae. tauschii را در چهار گروه طبقهبندی نمود .سه مؤلفه اول تجزیه به بردارهای اصلی (PCoA) نیز در مجموع ۹۰/۴۴ درصد از واریانس مولکولی کل را تبیین کرد .روشهای گروهبندی خوشهای و تجزیه به بردارهای اصلی جمعیتها را به طور کامل از هم تفکیک نکردند و عدم ارتباط بین تنوع مولکولی و تنوع جغرافیایی را نشان داد که نمایانگر تنوع ژنتیکی بالای این جمعیتها میباشد .نتایج این تحقیق نشان داد که نشانگرهای ISSR ابزار مفیدی برای مدیریت منابع ژنتیکی خویشاوندان وحشی گندم است
Text of Note
Improving the narrow genetic base of bread wheat requires identifying genetic diversity and classifying the gene pool in its wild relatives. In order to evaluate the genetic diversity of 50 accessions of wild species Ae. tauschii Collected from Gilan, Golestan and Mazandaran provinces, 27 ISSR primers were used. Out of 27 primers used, 8 primers succeeded in amplifying 77 bands, of which 75 (98.6 ) were polymorphic. The average number of polymorphic bands varied from 9.625 in the range of 8 to 12. The highest and lowest PIC values were 0.482 and 0.303, respectively. The mean of genetic parameters calculated for the number of effective alleles, Shannon index, PIC, MI and Rp were 1.612, 0.528, 0.535, 3.5 and 9.9, respectively. ISSR11, ISSR8 and ISSR827 markers with the highest values of genetic parameters were effective in separating the accessions. According to the genetic parameters within the group obtained from ISSR markers data, accessions from Gilan province had the highest genetic diversity. Analysis Molecular of Variance (AMOVA) also showed high genetic diversity within populations (81 ) compared to among populations (19 ). Results of cluster analysis using Minimum evolution algorithm with Number of differences coefficient with the highest Bootstrap values assigned the Ae. tauschii accessions into 4 groups. The first three coordinates of Principal Coordinate Analysis (PCoA) explained a total of 44.90 of the total molecular variance. Cluster grouping and Principal Coordinate Analysis methods could not completely separate populations and showed a lack of relationship between molecular diversity and geographical diversity, which indicates the high genetic diversity of these populations. The results of this study showed that ISSR markers are a useful tool for the genetic resources management of wild wheat relatives
PARALLEL TITLE PROPER
Parallel Title
Genetic diversity of Aegilops tauschii of north of Iran by ISSR markers