عنوان

جداسازی و توالی یابی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری ها ‮‭(RGAs)‬ در ارقام زراعی و خویشاوندان وحشی جو

Number

‭۱۸۹پ‬

.Language of Text, Soundtrack etc

per

Title Proper

جداسازی و توالی یابی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری ها ‮‭(RGAs)‬ در ارقام زراعی و خویشاوندان وحشی جو

First Statement of Responsibility

/الهام زارعی عباس آباد

Name of Publisher, Distributor, etc.

: کشاورزی

Specific Material Designation and Extent of Item

‮‭۱۷۱‬ص‬

Text of Note

جدول، نمودار،عکس

Text of Note

چاپی

Text of Note

واژه نامه

Text of Note

کتابنامه ص.: ‮‭۱۶۳-۱۷۰‬

Dissertation or thesis details and type of degree

کارشناسی ارشد

Discipline of degree

مهندسی کشاورزی-بیوتکنولوژی

Date of degree

‮‭۱۳۸۹/۰۶/۲۵‬

Body granting the degree

تبریز

Text of Note

تولید ارقام مقاوم به بیماری‌ها، یکی از روش‌صهای زیست محیطی برای تولید پایدار و کنترل بیماری‌صهای گیاهی است .لازمه این کار شناسایی ژن‌صهای مقاومت و انتقال آن به ژنوتیپ‌صصهای مطلوب می‌صباشد .به منظور جداسازی و توالی‌صیابی آنالوگ‌صهای ژن‌صهای مقاومت به بیماری در جو، از ‮‭۱۱‬ ترکیب آغازگرهای دژنره در شش رقم زراعی دایتون‌صرانی، ماکویی، آبیدر، قره‌صآرپا، سهند ‮‭۱‬و‮‭URB۸۱‬ - ‮‭۳‬و سه گونه وحشی‮‭Hordeum marinum‬ ، ‮‭H. spontaneum‬ و ‮‭H. bulbosum‬ استفاده شد که شش ترکیب آغازگر قطعاتی را در ژنوتیپ-های مورد مطالعه تکثیر کردند .از قطعات تکثیری هر ترکیب، سه تا چهار نوار از ژل جداسازی و پس از تکثیر، توالی‌صیابی شدند .توالی قطعات متناظر همردیف شده و تنوع نوکلئوتیدی و شباهت بین توالی‌صها محاسبه گردید .بیشترین شباهت بین ارقام زراعی در قطعات تکثیر شده توسط جفت آغازگر‮‭۱۰۶۰ -۵۵۶/cre۳gene۱۰۴۰- cre۳gene۵۳۶‬مشاهده شد .در تعدادی از قطعات تکثیری نیز ارقام زراعی شباهت نسبتا بالایی با گونه‌صهای وحشی نشان دادند .نسبت جایگزینی ناهمنام به همنام در مقایسه دو به دوی توالی اسیدآمینه‌صای رمز شده توسط قطعات برای برخی مقایسه‌صها بزرگتر از یک و در تعدادی کوچکتر از یک بود .حذف و اضافه شدگی هیچ کدام از قطعات تکثیر شده معنی‌صدار نبود .تعدادی از توالی‌صها دارای چارچوب قرائت آزاد بودند .همردیفی توالی قطعات تکثیری با توالی‌صهای موجود در داده پایگاه ‮‭NCBI‬ نشان دهنده شباهت بالای توالی برخی از قطعات با ژن‌صهای مقاومت شناخته شده و‮‭RGA‬ ها بود .به عنوان مثال، قطعات تکثیری توسط جفت آغازگر‮‭۱۰۶۰ -۵۵۶/cre۳gene۱۰۴۰- cre۳gene۵۳۶‬با ژن‌صهای مقاومت به زنگ ساقه ‮‭Rpg۴‬ و‮‭Rpg۵‬ ، ژن مقاومت ‮‭Rym۴‬ و ژن مقاومت به سفیدک سطحی ‮‭Mla‬ در جو و ‮‭RGA۱‬ و ‮‭RGA۲‬ گندم شباهت بالایی نشان دادند

Text of Note

Development of resistance cultivars is a environment friendly method for sustainable production and control of plant diseases. It requires identification and transfer of resistance genes into desirable genotypes. To isolate and sequence RGAs in barley, 11 degenerate primer combinations were used to amplify RGAs in six cultivars; Daytonrani, Makoei, Abidar, Gareharpa, Sahand14 and URB81-3, and Three wild species; Hordeum marinum, H. spontaneum and H.bulbosum. Six primer combinations successfully amplified fragments in cultivars and wild species. Three to 4 bands isolated from each primer combination for each genotypes and after re-amplification were sequenced. Sequence alignment was done and nucleotide diversity and similarity between sequences were estimated. The maximum similarity among genotypes was observed in the fragments amplified by Cre3gene536-556/Cre3gene1040-1060 primer pair. Cultivars and wild species showed high sequence identity in some of the amplified fragments. Non-synonymous and synonymous substitutions ratio in pairwise comparion of amino acid product of sequences was greater than unit in some cases, whereas, it was estimated smaller than one for some others. Insertion and deletion events were not significant in non of amplified fragments. Open reading frame was found in the some sequences. Sequences alignment in NCBI database revealed high similarity between amplified sequence and known resistance genes and RGAs. For example, fragments amplified by Cre3gene536-556 and Cre3gene1040-1060 primer pair showed high similarity with stem rust resistance genes Rpg4 and Rpg5, Rym4 resistance gene and powdery mildew resistance gene Mla from barley as well as RGA1 and RGA2. High similarity was also observed between fragments amplified using H2016/H1146 primer and Lr34 resistance gene from wheat and Rpg1-b resistance gene from soybean. Fragment No.3 amplified by H2016/H2020 in Sahand1 cultivar had similarity with Yr36 gene from emmer wild wheat as well as high similarity was found between fragment amplified by H2016/H2022 primers and barley stem rust resistance gene (Rpg1). Some of the fragments amplified using H2016/H2027 primer revealed high similarity with Lr1, Lr34, Rpg4 and Rpg5 resistance genes

زارعی عباس آباد، الهام

محمدی، ابوالقاسم، استاد راهنما

اهری زاد، سعید، استاد راهنمای همکار

علوی کیا، سید سیامک، استاد مشاور

Public note

سیاه و سفید

نمایه‌سازی قبلی