مطالعه مکانیسم های دخیل درکاهش حساسیت به تایگی سیکلین در باکتری اسینتو باکتر بومانی
Parallel Title Proper
Analysis of Mechanisms involved in Reduced Susceptibility to Tigecyclin in Acinetobacter baumannii
First Statement of Responsibility
/علی عبدالهی
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
: علوم طبیعی
Date of Publication, Distribution, etc.
، ۱۳۹۸
Name of Manufacturer
، راشدی
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
۹۸ص
NOTES PERTAINING TO PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC.
Text of Note
چاپی - الکترونیکی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
زیست شناسی گرایش میکروبیولوژی
Date of degree
۱۳۹۸/۱۱/۱۹
Body granting the degree
تبریز
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
آنتی بیوتیک تایگی سیکلین یکی از آخرین گزینه های درمانی برای مبارزه با عفونت های ناشی از باکتری های مقاوم به چند دارو، به ویژه اسینتوباکتر بومانی می باشد .اگرچه مقاومت به تایگی سیکلین به ندرت اتفاق می افتد ولیکن مقاومت به آن در چند مورد از باکتری ها گزارش شده است .با توجه به اهمیت مقاومت به این آنتی بیوتیک گزینه نهایی، هدف ما از این مطالعه تعیین عوامل دخیل درکاهش حساسیت به تایگی سیکلین در سویه های ا .بومانی بود .پنج سویه بالینی ا .بومانی غیرحساس و یک سویه حساس به تایگی سیکلین مورد مطالعه قرار گرفتند .حساسیت سویه ها به کلاس های مختلف آنتی بیوتیکی توسط روش انتشار از دیسک مورد بررسی قرار گرفت .حضور ژن های پلاسمیدی tetX و tetX۱ توسط روش PCR بررسی شد .توالی نوکلئوتیدی ژن های adeR و adeS تعیین شد .به منظور بررسی ارتباط بین کاهش حساسیت به تایگی سیکلین و افزیش بیان پمپ افلاکس AdeABC ، سطح رونویسی ژن adeB به روشqPCR - RTمورد بررسی قرار گرفت .ژن های رمز شونده پلاسمیدی tetX و tetX۱ در هیج کدام از سویه ها شناسایی نشدند .در همه سویه های غیر حساس به تایگی سیکلین تغییرات ژنتیکی غیرفعال کننده در ژن های کروموزومی مورد مطالعه شناسایی شد .تغییرات ژنتیکی مشاهده شده شامل جایگزینی های آمینو اسیدی ، G۱۸۶V ، N۲۶۸H و D۶۰N در AdeS و موتاسیون A۱۳۶V در AdeR بود .آنالیز های انجام گرفته بر روی اثر موتاسیون های مشاهده شده روی عملکرد پروتئین با استفاده از نرم افزار PROVEAN نشان داد که جایگزینی های آمینو اسیدی G۱۸۶V و D۶۰N دارای اثرات غیرفعال کنندگی بر روی عملکرد AdeS می باشند .کاهش حساسیت به تایگی سیکلین با افزیش بیان پمپ AdeABC مرتبط بود و در همه سویه های غیرحساس به تایگی سیکلین افزایش ۴۳ تا ۲۴۷ برابری در بیان ژن adeB مشاهده شد .در نهایت می توان نتیجه گرفت که کاهش حساسیت به تایگی سیکلین در سویه های مورد مطالعه عمدتا به واسطه ی تغییرات ژنتیکی در سیستم دو جزئی AdeRS میانجی گری می شود که منجر به افزایش بیان پمپ افلاکس AdeABC و برون ریزی آنتی بیوتیک می شود
Text of Note
Tigecycline (TGC) is one of the last-resort therapeutic agents to combat multidrug-resistant bacteria including Acinetobacter baumannii. Although it happens rarely, resistance to TGC has been reported for several bacteria . Regarding the importance of this last-hope antibiotic, we aimed in the present study to determine agents mediating reduced susceptibility to TGC in A. baumannii isolates. Five TGC non-susceptible and one TGC susceptible clinical isolates of A. baumannii were studied. Susceptibility of isolates to various classes of antibiotics was evaluated by disk diffusion method. The presence of tetX and tetX1 genes was investigated by PCR. The nucleotide sequences of adeS and adeR genes was determined. To evaluate the association between reduced susceptibility to TGC and upregulation of AdeABC efflux pump , transcriptional level of adeB gene was quantified by RT-qPCR analysis. None of the plasmid encoded resistance genes were detected in the studied isolates. All TGC non-susceptible isolates harbored inactivating genetic alterations in the studied chromosomally encoded genes. The observed genetic alterations included G186V, N268H and D60N substitutions in the adeS and A136V mutation in the adeR gene. adeS G186V and D60N substitutions were identified as inactivating alterations as determined by PROVEAN tool analysis. Reduced susceptibility to TGC was associated with upregulation of AdeABC efflux pump and adeB was overexpressed 43 to 247 times in all TGC non-susceptible isolates. It can be concluded from our results that reduced suspetibility to TGC in the studied isolates was mainly mediated by genetic alterations in the AdeRS two component system which resulted in overexpression of AdeABC efflux pump and antibiotic extrusion
PARALLEL TITLE PROPER
Parallel Title
Analysis of Mechanisms involved in Reduced Susceptibility to Tigecyclin in Acinetobacter baumannii