عنوان

آنالیز پروفایل ترنسکریپتومی و فاکتورصهای متابولیکی سندرم آسیت القا شده در یک لاین مرغ گوشتی,‮‭Analysis of transcriptomic and metabolic factors profile of induced ascites syndrome in a broiler chicken line‬

Number

‭۲۲۳۲۴پ‬

.Language of Text, Soundtrack etc

per

Title Proper

آنالیز پروفایل ترنسکریپتومی و فاکتورصهای متابولیکی سندرم آسیت القا شده در یک لاین مرغ گوشتی

Parallel Title Proper

‮‭Analysis of transcriptomic and metabolic factors profile of induced ascites syndrome in a broiler chicken line‬

First Statement of Responsibility

/رقیه جباری عوری

Name of Publisher, Distributor, etc.

: کشاورزی

Date of Publication, Distribution, etc.

، ‮‭۱۳۹۷‬

Name of Manufacturer

، میرزائی

Specific Material Designation and Extent of Item

‮‭۱۴۱‬ص‬

Text of Note

چاپی - الکترونیکی

Dissertation or thesis details and type of degree

دکتری

Discipline of degree

علوم دامی گرایش اصلاح نژاد دام

Date of degree

‮‭۱۳۹۸/۱۰/۰۷‬

Body granting the degree

تبریز

Text of Note

سندرم آسیت یک بیماری متابولیکی جدی در صنعت طیور در سراسر جهان است که در جوجه‌صهای گوشتی در سنین بالا بروز پیدا می‌صکند .مطالعه حاضر شامل بررسی داده‌صهای فنوتیپی و داده‌صهای ترنسکریپتومی بین پرنده‌صهای سالم و آسیتی بود .جوجه‌صهای گوشتی حاصل از ‮‭۷۱‬ خانواده ناتنی پدری از خط پدری ‮‭B‬ لاین آرین در دو شرایط تحت تنش سرمایی ‮‭(۸۱۷‬ پرنده (و شرایط استاندارد ‮‭(۱۰۰۰‬ پرنده (پرورش یافتند .در بررسی فنوتیپی صفات مرتبط با وزن بدن و نرخ رشد، برخی از پارامترهای خونی، فاکتورهای متابولیکی و آنتی‌صاکسیدانی جهت تعیین صفات شاخص جهت انتخاب غیر مستقیم علیه سندرم آسیت مورد بررسی قرار گرفتند .عناصر و متابولیت‌صهای خونی شامل گلوکز، آلبومین، تری‌صگلیسیرید، کلسترول، پروتئین، کلسیم، فسفر، منیزیم،‮‭HDL‬ ، آلانین‌صآمینوترانسفراز و آسپارتات‌صآمینوترانسفراز و همچنین فاکتورهای آنتی‌صاکسیدانی شامل مالون‌صدی‌صآلدهید و آنتی اکسیدان کل بودند .در بررسی ترنسکریپتومی، پروفایل بیان ژن بافت کبد مرغان آسیتی) شامل ‮‭۲‬ پرنده نر و ‮‭۲‬ پرنده ماده (و مرغان سالم) شامل ‮‭۲‬ پرنده نر و ‮‭۲‬ پرنده ماده (با استفاده از تکنولوژی‮‭Seq - RNA‬مورد مقایسه قرار گرفت .طبق نتایج مطالعه حاضر میزان مرگ‌صومیر به سبب آسیت در شرایط پرورش تحت تنش سرمایی در لاین مورد بررسی بالا ( ‮‭(۰/۵۹‬ بود که نشان‌صدهنده حساسیت بالای لاین پدری به آسیت است .همچنین میزان تلفات به سبب آسیت در پرنده‌صهای نر ( ‮‭(۴/۶۳‬ نسبت به پرنده‌صهای ماده ( ‮‭(۱/۵۴‬ بالاتر بود .(>‮‭(۰۱/۰p‬ بررسی داده‌صهای فنوتیپی نشان داد که میزان درصد هماتوکریت و نسبت وزن بطن راست به مجموع وزن دو بطن ‮‭(RV/TV)‬ در پرنده‌صهای آسیتی بالاتر از پرنده‌صهای سالم بود (>‮‭(۰۰۰۱/۰p‬ و همچنین میزان همبستگی بین این دو صفت بطور برابر با ‮‭۶۴/۰‬ بود .(>‮‭(۰۰۰۱/۰p‬ از میان فاکتورهای متابولیکی، غلظت کلسترول و ‮‭HDL‬ در پرنده‌صهای نر آسیتی پایین‌صتر از پرنده‌صهای نر سالم بود .این نتایج نشان می‌صدهند که آسیت تحریک شده با تنش سرمایی هماتوکریت،‮‭RV/TV‬ ، کلسترول و ‮‭HDL‬ را تحت تاثیر قرار می‌صدهد .بنابراین همراه با هماتوکریت و‮‭RV/TV‬ ، سایر فاکتورهای متابولیکی خون می‌صتوانند به عنوان ابزارهای تشخیصی و یا حتی شاخص انتخاب برای انتخاب غیر مستقیم علیه آسیت مورد استفاده قرار گیرند .نتایج بررسی ترنسکریپتومی نشان داد که تعداد ‮‭۱۱۵۲‬ ژن در مقایسه بین پرنده‌صهای نر سالم و آسیتی و تعداد ‮‭۱۸۰۳‬ ژن در مقایسه بین پرنده‌صهای ماده سالم و آسیتی به طور معنی‌صداری تفاوت بیان داشتند .تعداد ‮‭۴۵۰‬ ژن هم در مقایسه بین پرنده‌صهای نر سالم و آسیتی و هم در مقایسه بین پرنده‌صهای ماده سالم و آسیتی به طور مشترک تفاوت بیان داشتند .این ژن‌صها در مسیرهای متابولیکی چسبندگی سلولی، تعامل گیرنده - ماتریکس خارج سلولی، ملکول‌صهای چسبندگی کانونی، مسیر سیگنالینگ‮‭PPAR‬ ، متابولیسم اسید چرب و فاگوزوم درگیر بودند .نتایج آنالیز تفاوت بیان ژن نشان داد که پاسخ بدن به آسیب‌صهای ناشی از آسیت در بافت کبد شامل توسعه فیبروز کبدی) برای ترمیم آسیب ایجاد شده (و کاهش فعالیت مسیرهای سنتز اسید چرب و کلسترول و همچنین مسیر فاگوزوم جهت کاهش مصرف انرژی و اکسیژن در این مسیرها می‌صباشد .انتظار بر این است که مطالعه حاضر بینش جدیدی در فهم مکانیسم ملکولی وقوع آسیت در جوجه‌صهای گوشتی فراهم کرده و در طراحی سیستم اصلاح نژادی مناسب برای انتخاب علیه سندرم آسیت با استفاده از بیومارکرهای بیوشیمیایی و ژنتیکی موثر واقع شود

Text of Note

Ascites syndrome (AS) is still a major problem in the broiler industry worldwide. The objective of this study was to analyze the difference in biochemical parameters and transcriptome profile between the ascitic and healthy broiler chickens. Birds from 71 paternal half-sib families were randomly selected and raised under cold stress (817 chicks) and standard (1000 chicks) conditions. In the phenotypic evaluation phase of the study, traits related to body weight and growth rate, blood parameters, metabolic and antioxidant factors were evaluated to determine indicator traits for indirect selection against ascites syndrome. In transcriptome analysis, gene expression profiles of ascitic (including 2 male and 2 female) and healthy birds (including 2 male and 2 female) were compared using RNA-Seq technology. The high incidence of AS (59.0 ) observed in our experiment may indicate a high susceptibility of the studied sire line to AS. In this trial, 63.4 (244/385) of the males and 54.1 (189/349) of the females died due to AS. Hematocrit percentage of the ascitic chickens was significantly higher than that of the healthy chickens (p<0.0001). In both sexes, the ascitic birds showed a significantly higher mean of right ventricle/total ventricle ratios (RV/TV) than healthy birds (p<0.0001). Furthermore, a significant and direct correlation was found between RV/TV and hematocrit percentage (p<0.0001). The concentration of serum HDL and cholesterol in ascitic male birds was significantly lower than in healthy male birds. It can be concluded that cold-induced AS affects RV/TV, hematocrit, HDL and cholesterol of chickens and, therefore, along with RV/TV and hematocrit, other blood metabolic factors can also be used as diagnostic tools or even indicator traits for indirect selection against ascites. The RNA-seq analysis of the liver identified 1152 differentially expressed genes (DEGs) in the AS group compared to the control group for males. A number of 1803 DEGs were detected between ascitic female and healthy female birds. There were 450 DEGs in common between the male and female birds. These genes were involved in metabolic pathways of cellular adhesion, extracellular matrix receptor interaction, cellular adhesion molecules, PPAR signaling pathway, fatty acid metabolism and phagosomes. Gene expression differences analysis showed that the body responds to ascites-induced damage to the liver tissue by developing hepatic fibrosis (to repair injury) and reducing the activity of synthesis pathways such as fatty acid and cholesterol synthesis as well as phagosome pathways to reduce energy and oxygen consumption in these pathways. These findings have provided novel insights into our understanding of molecular mechanisms of AS incidence in broilers, hence they may be useful in designing breeding programs to produce more resistant birds to this syndrome

Parallel Title

‮‭Analysis of transcriptomic and metabolic factors profile of induced ascites syndrome in a broiler chicken line‬

جباری عوری، رقیه

Jabbari Ori, Roghayeh

شجاع غیاث، جلیل، استاد راهنما

اسمعیلی زاده کشکوئیه، علی، استاد راهنما

رافت، سید عباس، استاد مشاور

حسن پور، کریم، استاد مشاور

Public note

سیاه و سفید

نمایه‌سازی قبلی