عنوان

تنوع گونه‌ای نماتدهای ‮‭Longidoridae Thorne, ۱۹۳۵‬و ‮‭Aporcelaimidae Heyns, ۱۹۶۵‬ درخاک‌های غرب استان آذربایجان شرقی با استفاده از ویژگی‌های ریخت‌شناختی و مولکولی,‮‭Species diversity of Longidoridae Thorne, ۱۹۳۵ and Aporcelaimidae Heyns, ۱۹۶۵ in soils of western region of East Azarbaijan province based on morphological and molecular characteristics‬

Number

‭۲۱۵۳۵پ‬

.Language of Text, Soundtrack etc

per

Title Proper

تنوع گونه‌ای نماتدهای ‮‭Longidoridae Thorne, ۱۹۳۵‬و ‮‭Aporcelaimidae Heyns, ۱۹۶۵‬ درخاک‌های غرب استان آذربایجان شرقی با استفاده از ویژگی‌های ریخت‌شناختی و مولکولی

Parallel Title Proper

‮‭Species diversity of Longidoridae Thorne, ۱۹۳۵ and Aporcelaimidae Heyns, ۱۹۶۵ in soils of western region of East Azarbaijan province based on morphological and molecular characteristics‬

First Statement of Responsibility

/آرزو نقوی

Name of Publisher, Distributor, etc.

: کشاورزی

Date of Publication, Distribution, etc.

، ‮‭۱۳۹۷‬

Name of Manufacturer

، میرزائی

Specific Material Designation and Extent of Item

‮‭۲۷۱‬ص‬

Text of Note

چاپی - الکترونیکی

Dissertation or thesis details and type of degree

دکتری

Discipline of degree

بیماری‌شناسی گیاهی-گرایش نماتدشناسی

Date of degree

‮‭۱۳۹۷/۱۱/۱۴‬

Body granting the degree

تبریز

Text of Note

به منظور بررسی تنوع گونه‌ای نماتدهای متعلق به خانواده‌های ‮‭Longidoridae Thorne, ۱۹۳۵‬و ‮‭Aporcelaimidae Heyns, ۱۹۶۵‬ در ناحیه غرب استان آذربایجان شرقی متجاوز از ‮‭۶۰۰‬ نمونه خاک از فراریشه‌ی گیاهان مختلف این منطقه در طی سال‌های ‮‭۱۳۹۵‬ و ‮‭۱۳۹۶‬ جمع‌آوری شد .استخراج نماتدها از خاک با روش تغییر یافته برآون و بوآگ انجام و پس از تثبیت با استفاده از روش دگریسه به گلیسرین خالص انتقال یافتند .از نماتدهای جداسازی شده، اسلایدهای میکروسکوپی تهیه گردید .با بررسی ریخت‌شناختی و ریخت‌سنجی نمونه‌ها و با کمک کلیدهای شناسایی معتبر تشخیص گونه‌های نماتدها صورت گرفت .تصویربرداری از نماتدها با استفاده از دوربین دیجیتالی ‮‭DP۵O‬ متصل به میکروسکوپ نوری المپیوس مدل ‮‭BX۴۱‬ و ترسیم با استفاده از نرم‌افزار ‮‭Corel DRAW v۱۸‬ انجام شد .برای شناسایی مولکولی در ابتدا ‮‭DNA‬ نماتدها استخراج و با استفاده از آغازگرهای عمومی ‮‭ITS۱ Rrna‬ و‮‭D۳ ۲۸S Rrna - D۲‬تکثیر ‮‭DNA‬ انجام گرفت .در صورت نیاز، محصول ‮‭PCR‬ از ژل نیز خالص‌سازی شد .محصول ‮‭PCR‬ بعد از خالص‌شدن، توسط‮‭Biosystem‬ض‍ ‮‭۳۷۳۰/۳۷۳۰xl. DNA Analyzer‬ در کره جنوبی توالی‌یابی شد .توالی‌های تازه با توالی‌های جنس‌ها و گونه‌های موجود در بانک ژن مقایسه شدند .سپس این توالی‌ها به‌همراه توالی‌های به‌دست‌آمده از بانک ژن با استفاده از نرم‌افزار ‮‭MEGA۶‬ برای واکاوی تبارزایی زیرهم‌چینی شدند .بهترین مدل تکاملی‮‭DNA‬ ، با استفاده از نرم‌افزار ‮‭MrModeltest ۲.۳‬ به دست آمد .تجزیه‌وتحلیل بیژین توسط نرم‌افزار ‮‭MrBayes ۳.۱.۲‬ مورد استفاده قرار گرفت .سپس تبارنما با استفاده از نرم‌افزار ‮‭Fig Tree ۱.۴.۳ v‬ قابل رویت گردید .در نتیجه این بررسی، ‮‭۱۴‬ گونه از خانواده ‮‭Longidoridae‬ و ‮‭۱۲‬ گونه از خانواده ‮‭Aporcelaimidae‬ شناسایی شدند که شامل‮‭Aporcelaimellus baeticus‬ ، ‮‭A. medius‬، ‮‭A. obtusicaudatus‬، .‮‭Aporcelaimellus sp‬ ، .‮‭Aporcelaimoides sp‬ ، ‮‭Aporcelinus mediterraneus‬،‮‭Aporcella sp.۱‬ ،.‮‭Aporcella sp. ۲‬ ، ‮‭Aporcella simplex‬ ،‮‭Aporcella vitrinus‬ ، ‮‭Epacrolaimus declinatoaculeatus‬و ‮‭Sectonema heynsi‬ از خانواده ‮‭Aporcelaimidae‬ و‮‭Londidorus apulus‬ ،‮‭L. iranicus‬ ،‮‭L. persicus‬ ، ‮‭L. proximus‬ و گونه‌های‮‭Xiphinema sp. ۱‬ ،‮‭X. himalayense‬ ، ‮‭X. pachtaicum‬ و ‮‭X. simile‬ از‮‭group Xiphinema - americanum‬ و گونه‌های‮‭Xiphinema sp. ۲‬ ،‮‭Xiphinema sp. ۳‬ ،‮‭Xiphinema sp. ۴‬ ، ‮‭X. aceri‬، ‮‭X. index‬ و ‮‭X. vuittenezi‬ از گروه غیر آمریکانوم از خانواده ‮‭Longidoridae‬ است .از این بین، گونه‌های‮‭Xiphinema himalayense‬، ‮‭Aporcelaimellus baeticus‬، ‮‭Aporcelaimellus medius‬،‮‭Aporcelinus mediterraneus‬ ،‮‭Aporcella simplex‬ ،‮‭Aporcella vitrinus‬ ،‮‭L. proximus‬ ، ‮‭X. simile‬ و ‮‭Sectonema heynsi‬ برای فون نماتدهای ایران جدید هستند .هم‌چنین هفت گونه‮‭Xiphinema sp. ۱‬ ،‮‭Xiphinema sp. ۲‬ ،‮‭Xiphinema sp. ۳‬ ،‮‭Xiphinema sp. ۴‬ ،.‮‭Aporcelaimellus sp‬ ،.‮‭Aporcelaimoides sp‬ ، ‮‭Aporcella sp. ۱‬ و ‮‭Aporcella sp. ۲‬ گونه‌های توصیف نشده هستند

Text of Note

‮‭۳۷۳۰/۳۷۳۰xl DNA Analyzer in South Korea. The newly obtained sequences were compared with those of other nematode genera/species available in GenBank. The newly obtained and the retrived sequences from the database were aligned using MEGA۶ for phylogenetic analysis. The best fitted DNA evolutionary model was obtained using MrModeltest ۲.۳. Phylogenetic analysis was performed based on Baysion Inference (BI) using MrBayes ۳.۱.۲. The tree was visualized using FigTree ۱.۴.۳ v. As the result of this study, ۱۲ species of the Aporcelaimidae and ۱۴ species belonging to Longidoridae including Aporcelaimellus baeticus, A. medius, A. obtusicaudatus, Aporcelaimoides sp., Aporcelinus mediterraneus, Aporcella sp. ۱, Aporcella sp. ۲, Aporcella simplex, Aporcella itrines, Epacrolaimus declinatoaculeatus, Sectonema heynsi, Londidorus apulus, L. iranicus, L. persicus, L. proximus, Xiphinema sp. ۱, Xiphinema himalayense, Xiphinema pachtaicum, Xiphinema simile from Xiphinema americanum group and Xiphinema sp. ۲, Xiphinema sp.۳, Xiphinema sp. ۴, X. aceri, X. index and X. vuittenezi from Xiphinema non-americanum-group were identified. Amongest the species Aporcelaimellus baeticus, Aporcelaimellus medius, Aporcelinus mediterraneus, Aporcella simplex, Aporcella itrines, Sectonema heynsi, L. himalayense, L. proximus and X. simile are the first reports for nematode fauna of Iran. Seven undescribed species, including Aporcelaimoides sp. Aporcella sp. ۱, Aporcella sp. ۲, Xiphinema sp. ۱, Xiphinema sp. ۲, Xiphinema sp. ۳ and Xiphinema sp. ۴ were also identified‬ ض‍‮‭In order to study the species diversity of two families, Aporcelaimidae Heyns, ۱۹۶۵ and Longidoridae Thorne, ۱۹۳۵ in some western region of East Azarbaijan province, more than ۶۰۰ soil samples were collected from the rhizosphere of natural and cultivated areas in this region during ۲۰۱۶-۲۰۱۷. The nematodes were extracted using modified Brown and Boag method and killed, fixed and transferred to anhydrous glycerin following De Grisse method. Permanent microscopic slides were prepared from the nematodes. Based on morphological and morphometric characteristics and using vaild identification keys, the nematodes were identified. Imags of the nematodes were taken by a DP۵O digital camera connected to the BX۴۱ Olympus optical microscope and drawings prepared by Corel Draw v۱۸ software. For molecular identification, the DNA of nematodes extracted and a DNA fragment was amplified using the general primers of ITS۱ Rrna and D۲-D۳ ۲۸S Rrna. The obtained PCR products were purified and sequenced by the Applied Biosystems‬

Parallel Title

‮‭Species diversity of Longidoridae Thorne, ۱۹۳۵ and Aporcelaimidae Heyns, ۱۹۶۵ in soils of western region of East Azarbaijan province based on morphological and molecular characteristics‬

نقوی، آرزو

Naghavi, Arezoo

Public note

سیاه و سفید

نمایه‌سازی قبلی