تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیت درمنه (.(Artemisia annua L ایرانی بر اساس نشانگرهایSSR - EST
Parallel Title Proper
Genetic diversity and population structure of Iranian wormwood (Artemisia annua L.) based on EST-SSR markers
First Statement of Responsibility
/شهین کریمی
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
: کشاورزی
Date of Publication, Distribution, etc.
، ۱۳۹۷
Name of Manufacturer
، میرزائی
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
۶۴ص
NOTES PERTAINING TO PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC.
Text of Note
چاپی - الکترونیکی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
بیوتکنولوژی کشاورزی
Date of degree
۱۳۹۷/۱۱/۰۱
Body granting the degree
تبریز
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
آگاهی از میزان تنوع ژنتیکی و درک روابط بین ژنوتیپصها گام موثری در راستای حفظ ژرمصپلاسم و طراحی برنامهصهای اصلاحی در گیاهان است .در این مطالعه، تنوع ژنتیکی ۱۲۵ نمونهAremisia annua جمعصآوری شده از استانصهای گیلان، گلستان، مازندران و آذربایجان شرقی، اردبیل، قزوین، سمنان با ۱۲ جفت آغازگرSSR - ESTمورد ارزیابی قرار گرفت .در مجموع ۴۷ آلل در نمونهصهای مورد مطالعه تکثیر شد .تعداد آللص بین ۲ تا ۶ عدد با میانگین ۲۵/۴ به ازای هر جایگاه متغیر بود .میزان اطلاعات چندشکلی از ۳۷/۰ برای نشانگرSSR۴۴۲ - ESTتا ۶۷/۰ برای نشانگرSSR۱۰۱۲- ESTبا میانگین ۵۷/۰ و تنوع ژنی در محدوده ۴۹/۰ برای نشانگرSSR۱۰۱۲ - ESTتا ۷۲/۰ برای نشانگرSSR ۴۴۲ -ESTبا میانگین ۶۴/۰ متغیر بود .براساس این شاخصصها، نشانگرهایSSR۱۰۱۲ -ESTوSSR۳۰۵ - ESTمناسبصترین نشانگرها برای تمایز نمونهصها بودند .در تجزیه واریانس مولکولی براساس گروههای جغرافیایی، واریانس درون و بین گروهی به ترتیب ۹۳ و ۷ درصد از واریانس مولکولی کل نشانگرها را تبیین کردند .تجزیه خوشهصای با استفاده از الگوریتمJoining - Neighborو ضریب فاصلهdistance- P، نمونه ها را به پنج گروه منتسب کرد .در تجزیه به بردارهای اصلی سه بردار اصلی در مجموع ۵۳/۵۸ درصد از تغییرات مولکولی کل نمونهصها را تبیین کردند .نتایج این تحقیق وجود تنوع ژنتیکی قابل توجه در نمونهصهای A. annua مورد مطالعه را نشان داد که میصتواند در برنامهصهای اصلاحی A. annua مفید واقع شود
Text of Note
Knowledge about the level of genetic diversity and understanding the relationships between genotypes are an important step in plant germplasm conservation and designing breeding program in plants. In this study, the genetic diversity of 125 Artemisia annua accessions collected from Gilan, Golestan, Mazandaran, East Azarbijan, Ardebil, Qazvin and Semnan provinces was assessed by 12 EET-SSR primer pairs. A total of 47 alleles were amplified. The number of alleles varied from 2 to 6 with an average of 4.25 alleles per locus. Polymorphic information content (PIC) ranged from 0.37 (EST-SSR442) to 0.61 (EST-SSR1012) with an average of 0.57 and gene diversity ranged from 0.49 (EST-SSR1012) to 0.72 (EST-SSR442) with an average of 0.64. Based on these indices, EST-SSR1012 and EST-SSR305 were the most appropriate markers for discrimination of the accessions. In the analysis of molecular variance based on geographical groups, 7 and 93 of total molecular variation were explained by between and within group variances, respectively. Cluster analysis using Neighbor-Joining algorithm and P-distance coefficient assigned the studied accessions into four groups. In the principal coordinate analysis, the first three coordinates explained 58/53 of the total molecular variation. This study revealed a considerable genetic diversity in the studied A. annua accessions which could useful in the breeding programs of the A. annua
PARALLEL TITLE PROPER
Parallel Title
Genetic diversity and population structure of Iranian wormwood (Artemisia annua L.) based on EST-SSR markers