تجزیه پروتئوم ساقه یونجه آلوده شده با انگل سسCuscuta campestris))
Parallel Title Proper
Proteome analysis of Alfalfa stem infected by dodder (Cuscuta campestris) parasite
First Statement of Responsibility
/مهدی حسینی
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
: کشاورزی
Date of Publication, Distribution, etc.
، ۱۳۹۷
Name of Manufacturer
، میرزائی
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
۹۱ص
NOTES PERTAINING TO PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC.
Text of Note
چاپی - الکترونیکی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
بیوتکنولوژی کشاورزی
Date of degree
۱۳۹۶/۱۱/۱۶
Body granting the degree
تبریز
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
یونجه (.(Medicago sativa L یکی از مهمترین بقولات علوفهصای سراسر جهان میصباشد .یونجه گیاهی است دائمی، از خانواده لگومینوز و مهمترین گیاه علوفهصای در صنعت دامپروری محسوب میصشود .این گیاه به دلیل بالا بودن ارزش غذایی و امکان کاشت در اقلیمصهای مختلف به ملکه نباتات علوفهصای مشهور است .یکی از دغدغهصهای اصلی تولیدصکنندگان یونجه، کنترل علفصهای هرز در سال استقرار میصباشد .این گیاه در مراحل اولیه رویش سرعت رشد کمی دارد و بنابراین مدیریت علفصهای هرز در این مرحله میصتواند، نقش بسزایی در استقرار آن داشته باشد .از علفصهایصهرز مهــم و مــشکل ســاز یونجــه مــی-تــوان بــه ســس اشاره کرد .جنس Cuscuta عموما با نام سس شناخته شده و باعث خسارت زیادی در تولید عملکرد گیاهان زراعی میصشود که این خسارت در گیاهان مختلف بین۱۸ - ۸۶درصد متفاوت می-باشد .بررسی واکنش گیاه یونجه در مواجه شدن با انگل سس در سطح پروتئینی میتواند اطلاعات زیادی در دسترس قرار دهد و در برنامههای اصلاحی مورد استفاده قرار گیرد .به منظور تجزیه پروتئوم ساقهصهای تیمار شده با انگل سس آزمایشی در ۱۱ تکرار طراحی شد و در این آزمایش از بذور یونجه زراعی رقم قره یونجه استفاده گردید .بدین صورت که ابتدا بذور یونجه در گلخانه در گلدانصهای جعبهصای شکل کشت شده و پس از جوانه زنی، بذور سس خراش دهی و به گلدانصهای تحت تنش انتقال پیدا کردند .با گذشت حدود دو ماه از جوانهصزنی بذور یونجه و حمله سس، صفات مورد نظر از جمله ارتفاع بوته، کلروفیل،تعداد شاخه فرعی، تعداد برگ، قطر ساقه اصلی وزن خشک و وزن تر اندازهصگیری شد و بطور همصزمان نمونه برداری از ساقه یونجه آلوده شده و شاهد انجام گرفت .سپس، پروتئوم بافت ساقه آلوده شده با انگل سس و شاهد با استفاده از روشHcl- Tris، استخراج شده و به منظور بررسی الگوی پروتئوم از روش الکتروفورز دو بعدی استفاده شد .در نهایت رنگ آمیزی ژلصهای بعد دوم با نیترات نقره انجام گرفت و تجزیه کمی ژلصهای حاصل، با استفاده از نرمصافزار PDQUEST صورت گرفت .با مراجعه به پایگاه اینترنتی Expasy لکهصهای پروتئینی با تغییر بیان معنیصدار بر اساس وزن مولکولی (MW) و نقطه ایزوالکتریک(pI) ، شناسایی شده و نقش احتمالی و نحوهصی بیان پروتئینصها در شرایط تنش زیستی مورد بررسی قرار گرفت .در این تحقیق از ۱۲۶۹ لکه پروتئینی مشاهده شده، ۱۰۳ لکه پروتئینی تکرار پذیر شناسایی شد که از این تعداد، ۲۰ لکه تغییرات بیان معنیصدار از خود نشان دادند .از بین پروتئینصهای با تغییر بیان معنیدار، ۱۱ لکه با کاهش بیان و ۹ لکه با افزایش بیان نسبت به شاهد همراه بودند .پروتئینصهای شناسایی شده در ۵ گروه عملکردی طبقهصبندی شدهصاند که از میان آنصها، پروتئینصهای درگیر در متابولیسم و انرژی بیشترین سهم را به خود اختصاص دادهصاند .پروتئینصهای ATP synthase subunit a ،xylance I --۱,۴- Endoو LON protease I از جمله مهمترین پروتئینصهای شناسایی شده در این پژوهش بودند که همگی با افزایش بیان داشتند
Text of Note
Alfalfa (Medicago sativa L.) is one of the most important forage legumes all around the world. Alfalfa - a perennial plant of leguminous family - is the most important forage crop in the breeding industry. Because of its high nutritional value and possible cultivation in different climates, this plant is known as "forage plants queen". This plant has a slow growth in primary levels. Therefore, the process of controlling weed at this level can play a significant role in deployment. A problem and challenge in alfalfa production is weed existence. Dobbers are the most important and problematic alfalfa weeds. Cuscuta which is generally known as dodder, causes a great damage in crops yield. This damage in various plants is different between 18-86 percent. Progress of Alfalfa infected dodder parasite can available more information in protein stage and use of them in breeding programs. For proteome analysis treated stems with dodder parasite, an experiment was designed in 11 replications and in the referred experiment, the Ghara Yonje kind of alfalfa crop was used. First, alfalfa seeds were planted in box-shaped pots in greenhouse and after germination, the seeds of the dodder were scratched and transferred to stress pots. After about two months of alfalfa seeds germination and dodder plant attack, the desired traits including: plant height, chlorophyll, number of sub branch, number of leaf, main stem diameter, wet weight and dry weight measured and at the same time, sampling of alfalfa infected stem and control was performed. Then, stem tissue proteome infected by dodder parasite and control extracted with Tris-HCl method and for proteome analysis used 2-D electrophoresis. At the end, silver nitrate was used for 2-D gels coloring and quantitative analysis of the resulting gels was performed with "PDQUEST" software. By referring to Expassys website, protein spots were identified with significant change in expression based molecular weight (MW) and isoelectric point (pI) and role and mode of expression of proteins in biological stress condition was investigated. In this research from 1269 observed spots, 103 repeatable protein spots were identified, and 20 spots show significant change of expression of themselves. Among the modified proteins, 11 spots faced with reduction in expression and 9 spots faced with increased in expression compared to the control. Identified proteins clustered in 5 functional groups, and proteins involved in metabolism and energy have the highest share among them. ATP synthase subunit a, Endo-1,4--xylance I and LON I proteins were most important identified proteins in this research, that all of them, showed up expression
PARALLEL TITLE PROPER
Parallel Title
Proteome analysis of Alfalfa stem infected by dodder (Cuscuta campestris) parasite