NATIONAL BIBLIOGRAPHY NUMBER
Number
۱۸۶۱۴پ
LANGUAGE OF THE ITEM
.Language of Text, Soundtrack etc
per
TITLE AND STATEMENT OF RESPONSIBILITY
Title Proper
بررسی چندشکلی ها و بیان ژنتیکی برخی از ژن‌های مرتبط با ورم پستان در گاو هلشتاین در آذربایجان شرقی
First Statement of Responsibility
/پروانه رئوفیان
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
: کشاورزی
Date of Publication, Distribution, etc.
، ۱۳۹۶
Name of Manufacturer
، میرزائی
NOTES PERTAINING TO PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC.
Text of Note
چاپی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
دکترا
Discipline of degree
علوم دامی گرایش تغذیه دام
Date of degree
۱۳۹۶/۱۱/۰۷
Body granting the degree
تبریز
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
ورم پستان یکی از شایع‌صترین بیماری‌صها در گاو شیری است که همواره هزینه‌صهای سنگین درمانی را به گاودار تحمیل کرده و مقادیر تولید شیر را بطور معنی‌صدار کاهش می‌صدهد .ژن‌صهای سیستم ایمنی نقش مهمی در مقابله علیه بیماری ورم‌صپستان دارند .هدف از این مطالعه بررسی چندشکلی‌صها و بیان ژنتیکی برخی از ژن‌صهای مرتبط با ورم پستان در گاو هلشتاین در آذربایجان شرقی بود .مطالعه حاضر در سه سطح فنوتیپ، ژنوتیپ و بیان ژن انجام گردید .در سطح فنوتیپ ابتدا دام‌صهای حساس و مقاوم انتخاب گردیدند .در مرحله دوم چندشکلی‌صهای تک نوکلئوتیدی موجود در سه ژن کاندیدایTLR۲ ، IL۸ و TNF شناسایی شدند .در گام آخر تغییرات بیان ژن‌صهای مذکور در سلول‌صهای شیر گاوهای تحت‌صمطالعه و اثر چندشکلی‌صهای تک نوکلئوتیدی روی تغییرات بیان در سطح ژنوتیپ بررسی گردید .به این منظور، ابتدا با استفاده از آنالیز خطی با نرم‌صافزار SAS نسخه ۲/۹ مقادیر باقیمانده صفت نمره سلول‌صهای بدنی محاسبه شد .سپس از بیشترین دارندگان باقیمانده‌صها، ۴۴ راس گاو و از کمترین آن‌صها، ۵۶ راس گاو به ترتیب به-عنوان مقاوم‌صصترین و حساس‌صترین دام‌صها گروه‌صبندی شدند و نمونه‌صهای خون از ۴۴ راس گاو مقاوم و ۵۶ راس گاو حساس جمع‌صآوری گردیدند DNA .ژنومی با پروتوکل فنل‌ص کلروفورم استخراج گردید .با استفاده از روش‌صهای مولکولی -PCR RFLP ، PCR SSCP چندشکلی‌صهای‌صتک نوکلئوتیدی مربوط به هر ژن شناسایی گردیدند و به دنبال آن فراوانی‌صهای ژنوتیپی و آللی هر ژن کاندیدا با استفاده از نرم افزار POPGENE به‌صدست آمد .برای بررسی بیان ژن‌صهای کاندیدا، نمونه شیر از ۵۰ راس گاوهای تحت مطالعه جمع‌صآوری شدندRNA .از سلول‌صهای شیر استخراج گردیدند .تغییرات بیان ژن‌صها با روش Real time PCR انجام شد .ارتباط ژنوتیپ‌صها با باقیمانده نمره سلول‌صهای بدنی به کمک مدل خطی GLM با نرم‌صافزار SAS نسخه ۲/۹ بررسی شد .نتایج مطالعه نشان داد بیشترین فراوانی‌صهای ژنوتیپی برای ژن‌صهایTLR۲ ، IL۸ و TNF در گروه حساس به ترتیب متعلق به ژنوتیپ‌صهایKK ، AA و CC بودند .علاوه بر این بیشترین فراوانی‌صهای ژنوتیپی برای ژن‌صهایTLR۲ ، TNF و IL۸ در گروه مقاوم به ترتیب متعلق به ژنوتیپ‌صهایHK ، TT و GA بودند .بین ژنوتیپ‌صهای ژن‌صهای مذکور با نمره سلول‌صهای بدنی و تولید شیر همبستگی معنی داری وجود داشت .تجزیه و تحلیل بیان ژن‌صها نشان داد که تغییرات بیان ژن‌صهایTLR۲ ، IL۸ و TNFدر گروه حساس۵/۱ ، ۴/۵ و ۵/۲ برابر نسبت به گروه کنترل افزایش یافته است (>(۰۱/۰ p و با افزایش SCC بیان ژن‌صهایTLR۲ ، IL۸ و TNFافزایش یافتند .نتایج این مطالعه نشان دادند چندشکلی‌صهای صتک‌ص نوکلئوتیدی شاید در تغییرات بیان ژن‌صهای کاندیدا تاثیر داشته باشد .چندشکلی‌صهای صتک صنوکلئوتیدی ( T>C در موقعیت ۲۷۲۰ جفت‌صبازی،G>A در موقعیت ۲۸۶۴ جفت‌صبازی، SNP C>G در موقعیت ۲۸۸۳ جفت‌صبازی و SNP C>G در موقعیت ۲۸۸۴ جفت‌صبازی (مربوط به ژن IL۸ و همچنین چندشکلی‌صهای‌ص تک‌ص نوکلئوتیدی ( C>A در موقعیت۴۳۴۶ ، T>C در موقعیت ۴۶۴۴ جفت‌صبازی (متعلق به ژن TNF ممکن است منجر به اختلاف بیان معنی‌صدار mRNA ژن برای ژن‌صهایTNF و IL۸ شود، در نتیجه ژنوتیپ SCS را تغییر داد .تغییرات بیان بین ژنوتیپ‌صهای TNF و IL۸ در گروه حساس معنی‌صدار بود .(۰۵/۰ >p)افزایش تغییرات بیان بین ژنوتیپ‌صهایTLR۲ در گروه حساس معنی‌صدار نبود .(= (۴/۰ pژنوتیپ‌صهای AA و GA به‌صترتیب برای ژن‌صهای TNF و IL۸ نشانگرهای مناسبی برای کاهش ورم پستان در گاو هلشتاین در ایران است .از این مطالعه می‌صتوان استنباط کرد که استفاده از نشانگرهای ژنتیکی تحت مطالعه می‌صتوانند در بهبود سلامت پستان برای انتخاب گاوهای مقاوم نسبی بر علیه ورم‌صپستان به‌صکار برده شوند
Text of Note
Mastitis is the most common diseases in dairy cattle industry, which has imposed heavy therapy costs to farmers and significantly reduces the milk production. Immune system genes have important role against mastitis. This study done in three levels phenotype, genotype and expression gene. For the first stage, were selected resistant and susceptible resistance and susceptible animals. In the second step single nucleotide polymorphisms in the TLR2, IL8 and TNF were detected. In the next stage, the expression changes of these genes in the cows' milk cells and the effect of mutation on expression changes at the genotypes were investigated. For this purpose, by using linear analysis with SAS software version 9.9, the residual values of the somatic cell score trait were calculated. Then of the most residues 44 cows and of the lowest residues 56 cows were selected as the most resistant and susceptible of animals. Blood samples were collected from 44 resistant cows and 56 susceptible cows. Genomic DNA was extracted with Chlorophorm protocol. Then, genetic polymorphisms of the candidate genes were identified by RFLP-PCR and SSCP-PCR approach. Finally, Pop gene software was used to calculate genotype and allele frequency. To study the expression of candidate genes, 50 milk samples were collected from cows under study. RNA was extracted from milk cells. Expression differences of candidate genes were performed using Real Time PCR method. The correlation of genotypes with the residual somatic cell score was investigated using an appropriate statistical model with SAS software version 9.2. Our study results showed that the most frequencies for TLR2, IL8 and TNF in susceptible group was belonged to KK, AA and CC genotypes, respectively. Also, the most frequencies for TLR2, TNF and IL8 in resistance group was belonged to HK, TT and GA genotypes, respectively. There was a significant correlation between the TLR2, IL8 and TNF with somatic cell score and milk yield. The lowest of residual somatic cell score for TLR2 and TNF genes belonged to the genotype AA and for gene IL8 belonged to the genotype GG. Gene expression analysis showed that the level of gene expression for TLR2, IL8 and TNF were higher in susceptible group than resistance group. With the increasing of SCC increased TLR2, IL8 and TNF expression. Also results showed that investigated SNPs affected on levels of candidate genes expressions. The increasing of expression level between TNF and IL8 genotypes was significant in the susceptible group compared control group (p <0.01). Increase of expression changes wasnt significant between the TLR2 genotypes in the susceptible group compared control (p <0.01). In summary, the SNPs on 2720 T>C, 2846 G>A, 2883C>G and 2884G>A sites for IL8 gene also the SNPs on 4346C>A and 4644T>C for TNF gene sites led to the changes of IL8 and TNF expression, and the genotype altered SCS. The SNP didnt have on expression level of TLR2. AA and GA genotypes respectively for TNF and IL8 genes are appropriate markers for mastitis decrease in Holstein cow in Iran. This research showed indicated that genetic markers of under study can be used in order to improvement of statistical models for selecting of resistance cows against mastitis
PERSONAL NAME - PRIMARY RESPONSIBILITY
رئوفیان، پروانه
PERSONAL NAME - SECONDARY RESPONSIBILITY
شجاع، جلیل، استاد راهنما
جعفری جوزانی، رضی الله، استاد راهنما
مقدم، غلامعلی، استاد مشاور
جوانمرد، آرش، استاد مشاور
ELECTRONIC LOCATION AND ACCESS
Public note
سیاه و سفید
نمایه‌سازی قبلی
