مطالعهی برهمکنش شیمگین از مشتقات ترپنوئیدی طبیعی با DNA به روش تئوری و تجربی
First Statement of Responsibility
/معصومه اشرفی خواجه
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
: علوم طبیعی
Date of Publication, Distribution, etc.
، ۱۳۹۵
Name of Manufacturer
، افشاری
NOTES PERTAINING TO PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC.
Text of Note
چاپی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
علوم جانوری
Date of degree
۱۳۹۵/۱۱/۱۱
Body granting the degree
تبریز
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
در سالصهای اخیرتحقیقات بسیاری بر روی برهمصکنش مولکولصهای کوچک با DNA متمرکز شده است DNA .معمولا اولین هدف داخل سلولی داروهای ضد سرطان میصباشد، بنابراین برهم-کنش بین مولکولصهای کوچک و DNA میصتواند منجر به آسیب در سلولصهای سرطانی و توقف تقسیم سلولصهای سرطانی و در نتیجه مرگ سلولی شود .ترپنوئیدصها هیدروکربنصهایی هستند که به عنوصاصن ترپن یا ایزوپرنوصئید شناصخته میصشوند و در بسیاری از گیاصهان از جمله گونهصهای جنس کما و برخی از قارچصها وجود دارند که دارای فعاصلیت ضدصتوموری روی طیف وسیعی از سلولصهای سرطانی انسانی هستند .ساختار شیمیایی ترپنوئیدها، ظرفیتی را برای اتصال آنصها به DNA فراهم میصکند .در این مطالعه برهمصکنش شیمگین یکی از ترکیبات ترپنوئیدی با DNA بررسی شده است . در این تحقیق نحوه برهمصکنش شیمگین با DNA با استفاده از تکنیکصهای اسپکتروسکوپیvisible- UV، اسپکتروسکوپی فلوروسانس، ویسکوزیمتری و دورنگ نمایی دورانی در محیط آزمایشگاه و در نسبتصهای مولی مختلف این مواد نسبت به DNA بررسی شد .طیف جذبی ماوراء بنفش- مرئی شیمگین هایپرکرومیسیتی در حضور DNA نشان داد و علاوه بر این، میزان پایین ثابت اتصال شیمگین بهDNA (۱۰۴ ۲۷/۲)روشن می کند که اتصال شیمگین به DNA از طریق اتصال به شیار صورت می گیرد .وجود تغییرات نامحسوس در ویسکوزیته DNA در حضور شیمگین نیز دلیل بر اتصال به صورت غیر درج شونده است و باعث تأیید نتایج حاصل از طیف سنجی جذبی ماوراء بنفش- مرئی می شود .علاوه بر این، مطالعات فلورسانس رقابتی با استفاده از متیلن بلو و هوخست نشان داد که شیمگین از طریق اتصال از شیار میصتواند با DNA برهمصکنش داشته باشد .مطالعات داکینگ مولکولی نیز نشان دهنده اتصال شیمگین به شیار DNA می باشد .تمامی نتایج بیانگر این است که برهمصکنش بین شیمگین و DNA از طریق اتصال به شیار میصباشد .مطالعه اتصال مولکولصهای کوچک به DNA درک بهتری از مدل اتصال مولکولصهای کوچک، جهش ژنصها، شروع برخی بیماریصها، مکانیسم فعالیت داروهای آنتی تومور و آنتی ویروس همچنین برای طراحی داروهای جدید با اثر کلینیکی زیاد و سمیت کمتر فراهم میصکند
Text of Note
104), indicates that TMG binds to DNA by a non-intercalative mode. A little change in the DNA viscosity in the presence of increasing amounts of TMG is indicative of a non-intercalative mode of binding which is in agreement with spectroscopies studies. Furthermore competitive fluorescence spectroscopy studies using Methylen blue and Hoechst 33258 was shown that TMG can interact with DNA via minor groove. Molecular docking studies also indicate that TMG binds into the minor groove of DNA. All results indicate that DNA- TMG interaction is through the minor groove binding. The study on the interaction of small molecules with DNA is of great help to understand the mode of interaction of small molecules with DNA, the mutation of genes, the origin of some diseases, the action mechanism of some antitumor and antivirus drugs, and therefore, to designing new anticancer drugs with greater clinical efficacy and lower toxicityIn recent years, many studies have been focused on interaction of small molecules with DNA. DNA is generally the primary intracellular target of anticancer drugs, so the interaction between small molecules and DNA can cause DNA damage in cancer cells, blocking the division of cancer cells, and resulting in cell death. Terpenoids are hydrocarbons that are also referred to as terpenes or isoprenoids and they are found in higher plants including Ferula genus and some mushrooms which have shown antitumour activities on a wide variety of human cancer cell lines. The chemical structure of terpenoids provides them with capacity to interact with DNA. In this study we have investigated the DNA interaction capability of Tschimgine (TMG), as a derivative of tmonoerpenoids. In this work, the interaction of TMG with ct-DNA has been investigated using UV-visible spectroscopy, viscosimetry, circular dicromism and non-competitive binding studies using fluorescence spectroscopy and molecular docking. UV-visible absorption band of TMG showed hyperchromisity in the presence of DNA. Beside this, the low value of Kb (2.27