بهینهسازی تکثیر وکتور VIGS بر پایه ALSV در گیاهان باغبانی
First Statement of Responsibility
/علیرضا طیموری نژاد
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
: کشاورزی
Date of Publication, Distribution, etc.
، ۱۳۹۵
NOTES PERTAINING TO PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC.
Text of Note
چاپی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
علوم باغبانی
Date of degree
۱۳۹۵/۱۲/۱۴
Body granting the degree
تبریز
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
امروزه به علت توانایی طبیعی ویروسها در انتقال ژن و الحاق به ژنوم میزبان که بخشی ضروری از سیکل زندگی آنهاست، از آنها بهعنوان ابزاری قوی برای خاموشی ژنهای درونی گیاه و انتقال ژن بیگانه به درون سلولهای میزبان استفاده میشود .امروزه سیستم خاموشی ژن القاشده توسط ویروس (VIGS) در ژنتیک گیاهی به دلیل سهولت در استفاده و صرف زمان کوتاهی برای ایجاد فنوتیپ مورد نظر، کاربرد زیادی دارد .وکتور ویروسی کروی پنهان سیب (ALSV) میتواند برای VIGS پایدار و مؤثر در میان طیف گستردهای از گیاهان ازجمله آرابیدوپسیس، درختان میوه رزاسه، سولاناسه، فاباسه، کوکوربیتاسه، اسکروفولاریاسه کاربرد داشته باشد .در این تحقیق بهینهسازی تکثیر وکتور VIGS بر پایه ALSV در گیاهان باغبانی و معرفی میزبانی جدید برای این وکتور ویروسی مدنظر بود .برای این منظور از گیاهان توتفرنگی دیپلویید (Fragaria vesca) و شنبلیله (trigonella foenum graceum) بهعنوان میزبان برای ویروس موردنظر و از گیاه کینوا (Chenopodium quinoa) بهعنوان یک گیاه واسطه برای تکثیر ویروس استفاده شد .ابتدا پلاسمیدهای ویروسی pEALSR۱ و pEALSR۲ برای تکثیر بیشتر با الکتروپوریشن به باکتری E.coli انتقال داده شدند .سپس استخراج پلاسمید با روش لیز-قلیایی انجام گرفت این پلاسمیدها با دو روش کاربرد پودر کاربوراندوم و تزریق با سرنگ انسولین به گیاه کینوا انتقال یافتند .گیاهان کینوا بعد از۳ - ۵هفته، آلودگی به ویروس موردنظر را بهصورت علائم نکروز و کلروز بروز دادند .سپس عصاره این گیاهان آلوده به ویروس استخراج و با استفاده از پودر کاربوراندوم، روی گیاهان توتفرنگی و شنبلیله و تزریق با سرنگ انسولین روی گیاه شنبلیله، مایهزنی انجام شد .در ۵ هفته بعد از مایهزنی، استخراج RNA از برگهای توتفرنگی و شنبلیله و کینوا و درنهایتPCR - RTانجام شد .نتایجPCR - RTنشان داد که قطعه موردنظر از پلاسمید pEALSR۲ به طول ۲۱۱ جفت باز از cDNA بهدستآمده از این گیاهان تکثیر شده است .این موضوع نشان میدهد که این وکتور ویروسی در گیاهان وارد شده و تا حد قابلیت تشخیص تکثیر شده است و میتوان در آینده از این وکتور برای خاموشی ژن در این گیاهان استفاده نمود
Text of Note
Nowaday Due to intrinsic ability of viruses in gene transfer and incorporation to the host genome that is an important part of their life cycle, they are used as a powerful tool for plant gene silencing and transfer of foreign genes into the host cells. VIGS is nowadays widely used in plant genetics for knocking down genes thanks to its ease of use and the time required to generate phenotype. Apple latent spherical virus (ALSV)-based vectors can be used for effective and stable VIGS in a broad range of plants belonging to Brassicaceae, Rosaceae, Solanaceae, Fabaceae, Cucurbitaceae and Scrophulariaceae. In this research, we aimed to optimize and evaluate the propagation of an ALSV-based VIGS vector in two horticultural plants. For this purpose, Fragaria vesca and trigonella foenum graceum were targeted and chenopodium quinoa used as a propagation mediator plant. To do this, viral plasmids pEALSR1 and pEALSR2 transformed into Escherichia coli by electroporation and then plasmid extraction was performed by alkaline-lysis method. These plasmids inoculated into c.quinoa plants by two method, using carborundum powder and injection by insulin syringe. C.quinoa plant showed virus-induced chlorosis and necrosis symptoms 3-5 week after inoculation. subsequently, the extract of infected plants was inoculated onto diploid strawberry and fenugreek plants leaves using carborundum powder and onto fenugreek plant leaves using syringe. RNA were extracted from all inoculated plants leaves and used for RT-PCR. Results indicated that a 211 bp fragment of pEALSR2 plasmid was amplified from all inoculated plants. It was concluded that this vector has been introduced and propagated in the targeted plants and can be used as a VIGS vector in these plants in the future