مطالعه مهارعمل آنزیم پروتئاز ویروسHIV - ۱از طریق نانوساختارهای مشتقات فولرنی با استفاده از روشهای محاسباتیQSAR
First Statement of Responsibility
/سمیه جعفری موسوی
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
: مرکز تحقیقات علوم پایه
Date of Publication, Distribution, etc.
، ۱۳۹۴
Name of Manufacturer
، راشدی
NOTES PERTAINING TO PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC.
Text of Note
چاپی
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
کارشناسی ارشد
Discipline of degree
زیست شناسی سلولی مولکولی گرایش بیوفیزیک
Date of degree
۱۳۹۴/۱۱/۲۰
Body granting the degree
تبریز
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
پروتئاز ویروس ایدزPR) -(HIVیک آنزیم ضروری برای ایجاد ذره ویروسی بالغ وکامل است .بنابراین این آنزیم یکی از مهم ترین اهداف محققان برای طراحی دارو و مقابله با بیماری ایدز (ADIS) است .امروزه نانوساختارهای فولرنی بعنوان ترکیباتی جدید که دارای پتانسیل مهارکنندگی قوی برای آنزیمPR - HIVهستند، مورد توجه محققان نانومدیسن ونانوبیوتکنولوژی قرار گرفته اند .در این پایان نامه روش ارتباط کمی ساختار- فعالیت دوبعدیQSAR - ۲Dرا برای تبیین ارتباط بین ویژگیهای ساختاری نانوذرات فولرن با فعالیت مهارکنندگی آنزیم پروتئاز به کار بردیم .بدین منظور از روشهایMLR -MLR, PCA-MLR, GAPLS- Stepwiseبرای انتخاب توصیفگر مناسب و ارائه مدلهای QSAR بر روی ۴۹ مشتق فولرنی استفاده شد .مقدار ضریب تعیین برای گروه آموزش(R۲training) ،۹۴۲/۰ ، ۸۹/۰ و ۸۷/۰ و برای گروه آزمون(R۲test) ۷۹/۰ ، ۶۷/۰ و ۶۷۴/۰ به ترتیب برای مدلهایMLR-MLR , Stepwise- GAPLSوML - PCAبدست آمد .برای سنجش قدرت پیشبینی مدلهای بدست آمده روشهای مختلف معتبر سازی از جملهvalidation Leave One Out- crossوrandomization Y - را به کار بردیم .نتایج حاصله نشان دهنده توان بالای مدل های بدست آمده برای پیشبینی فعالیت نانوساختارهای فولرن برای مهار آنزیم پروتئاز هستند .آنالیز توصیفگرهای بدستآمده نشان میدهدکه فعالیت مهاری فولرنها به حجم واندروالسی، قطبش پذیری و توزیع الکترونی ساختار فولرنها بستگی دارد .مدلهای QSAR ارائه شده در این پایان نامه میتواند در تولید داروهای ضد رتروویروسی بر پایه مشتقات فولرنی مفید واقع شود
Text of Note
The protease of human immunodeficiency virus1 (HIV-1 PR) is an essential enzyme for the creation of mature infectious virus agent. Therefore, this enzyme is one of the most important targets of drug designing challenge against AIDS therapy. Nowadays, fullerene nanostructures with a potential of HIV-1 PR inhibition, are important compounds in nanomedicine and nanotechnology for AIDS healing. In this research, two dimensional quantitative structure-activity relationships (2D-QSAR) of fullerene derivatives against HIV-PR activity were employed for elucidation the relationships between structure and experimental observations. QSAR study of 49 fullerene derivatives was performed by employing stepwise-MLR, GAPLS-MLR, and PCA-MLR models for variable (descriptor) selection and model construction. Correlation coefficient for training set (R2training) values of 0.942, 0.89, 0.87 as well as test set (R2test) values of 0.791, 0.67 and 0.674 were obtained for stepwise-MLR, GAPLS-MLR, and PCA -MLR models, respectively. Leave-one-out cross-validated correlation coefficient (R2CV) and Y-randomization methods confirmed the models robustness. Based on the types of the achieved descriptors, the HIV-PR inhibition depends on the van der Waals volumes, polarizability, and electronic distribution of fullerenes derivatives. Thus we believe that these QSAR models can be used in the search for novel HIV-PR inhibitors based on fullerene derivativ