Analytic Study of TRIB1, CD3ε, CD103, and PI9 mRNA in Association with Kidney Allograft Outcome
Title Proper
بررسی بیان ژن های, CD3ε, TRIB1 CD103 وmRNA PI9 در همراهی با پیامد آلوگرافت کلیه
General Material Designation
[Dissertation]
First Statement of Responsibility
Arron Munggela Foma
First Statement of Responsibility
آرون مانگلا فوما
.PUBLICATION, DISTRIBUTION, ETC
Name of Publisher, Distributor, etc.
Tehran University of Medical Sciences, Medicine school
Name of Publisher, Distributor, etc.
Tehran University of Medical Sciences, Medicine school
Date of Publication, Distribution, etc.
2016
Date of Publication, Distribution, etc.
1395
PHYSICAL DESCRIPTION
Specific Material Designation and Extent of Item
71p
DISSERTATION (THESIS) NOTE
Dissertation or thesis details and type of degree
Masters
Discipline of degree
Immunology
Date of degree
1395/09/25
Text preceding or following the note
18
SUMMARY OR ABSTRACT
Text of Note
Background: Gene profiling of associated genes expressed during kidney allograft rejection, has had an enormous impact, shedding light on recent insights in the characterization and pathogenic role of both the humoral and adaptive immunity in acute rejection episodes and chronic allograft injury. In this study, we analyzed the gene expressions of TRIB1, CD3ɛ, PI9, and CD103, in PBMC of kidney transplant recipients in order to predict the allograft outcome in biopsy-proven rejection episodes at 180days and 1-year after transplantation.Materials and Method: A population of 50 kidney allograft recipients was recruited in this study, and their PBMCs from whole blood were evaluated for the expression patterns of TRIB1, CD3ɛ, PI9 and CD103 before transplantation, 2 days, 90 days and 180 days post-transplantation. Of the 28 post-transplant biopsies evaluated, 5 were cause-biopsies and 24 were protocol biopsies in accordance with the Banff schema. The gene expression patterns were analyzed using qRT-PCR.Results: Coordinate gene expressions revealed a higher median score for dysfunctional allografts than in well function allografts from Mann-Whitney U test p = 0.003. Upregulation of the genes in PBMC predicted graft dysfunction at 90days post-transplantation based on GFR, while the increase in cause biopsy and 180 days protocol biopsy, correlated with a one-year pathological post-transplant prediction of allograft dysfunction from logistic regression and ROC curve analysis. Repeated measures analysis of variance test indicated a statistically significant elevation of TRIB1, CD3e, PI9 and CD103 mRNA (p < 0.001) in peripheral blood of patients with graft dysfunction compared to patients with well-functioning graft in the chronological analysis.Conclusion: Results from our data suggest that TRIB1, CD3e, PI9 and CD103 (αEβ7 integrin) could positively anticipate one-year allograft dysfunctional state and chronic allograft nephropathy from peripheral blood, as combined biomarkers.
Text of Note
سابقه و هدف: پروفایل ژنهای مرتبط که در طول رد آلوگرافت کلیه بیان می شوند، تا به حال تاثیر زیادی بر روشن کردن بینش اخیر ما در خصوصیات و نقش های بیماری زای هر دو ایمنی هومورال و سازگاری در دوره های رد حاد و آسیب مزمن آلوگرافت داشته است. در این مطالعه، بیان ژن های TRIB1، CD3ɛ، PI9 و CD103، در PBMC دریافت کنندگان پیوند کلیه به منظور پیش بینی نتیجه آلوگرافت در پیوند های رد شده تشخیص داده شده با بیوپسی در دوره های 6 ماه و 1 سال پس از پیوند مورد بررسی قرار گرفت.مواد و روش ها: تعداد 50 نفر دریافت کنندگان پیوند کلیه در این مطالعه انتخاب شدند، و PBMC خون آنها برای الگوهای بیان TRIB1، CD3ɛ، PI9 و CD103 قبل از پیوند، 2 روز، 3 ماه و 6 ماه پس از پیوند مورد ارزیابی قرار گرفتند. از 28 نمونه بیوپسی پس از پیوند، 5 مورد بیوپسی علتی و 24 نمونه بیوپسی پروتکل، با توجه به طرح بنف بود. الگوهای بیان ژن با استفاده از qRT-PCR بررسی شد.نتایج: مختصات بیان ژن نشان داد که امتیاز میانگین بالایی در آلوگرافت های بدون عملکرد نسبت به آلوگرافت های با عملکرد خوب، بر اساس آزمون Mann-Whitney U وجود دارد. افزایش بیان ژن ها در PBMC در 90 روز بعد از پیوند (بیوپسی علتی) و 180 روز پس از پیوند (بیوپسی پروتکل)، با یک سال تشخیص پاتولوژیک آلوگرافت ناکارامد با توجه به آنالیز رگرسیون لوجستیک ارتباط داشت. آنالیز Repeated measure برای آزمون واریانس نشان داد که افزایش آماری معنی داری در بیان mRNA ژن های TRIB1، CD3e، PI9 و CD103 (P <0.001) در خون محیطی بیماران مبتلایان به آلوگرافت ناکارآمد براساس تجزیه و تحلیل زمانی وجود داشت.نتیجه گیری: نتایج داده های ما نشان می دهد که TRIB1، CD3e، PI9 و CD103 (αEβ7 اینتگرین) می تواند بطور مثبتی وضعیت یک سال آلوگرافت ناکارآمد و نفروپاتی آلوگرافت مزمن در خون محیطی، به عنوان نشانگرهای زیستی ترکیب شده را پیش بینی نماید.
TOPICAL NAME USED AS SUBJECT
Chronic allograft nephropathy
نفروپاتی آلوگرافت مزمن
gene expression
بیان ژن
kidney transplantation
پیوند کلیه
PERSONAL NAME - PRIMARY RESPONSIBILITY
Relator Code
, Author
Relator Code
, Author
Munggela Foma, Arron
مانگلا فوما، آرون
PERSONAL NAME - SECONDARY RESPONSIBILITY
Relator Code
, Thesis advisor
Relator Code
, Thesis advisor
Relator Code
, Thesis advisor
Relator Code
, Thesis advisor
Relator Code
, Consulting advisor
Relator Code
, Consulting advisor
Amirzargar, Ali Akbar
امیرزرگر، علی اکبر
نیک بین، بهروز
Nikbin, Behrouz
Ahmadpoor, Pedram
احمدپور، پدرام
CORPORATE BODY NAME - SECONDARY RESPONSIBILITY
Entry Element
Tehran University of Medical Sciences, Medicine school